292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1521 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1521  glutaredoxin family protein  100 
 
 
145 aa  287  4e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0272827  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20470  glutaredoxin family protein, arsenate reductase  67.52 
 
 
118 aa  160  6e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4508  arsenate reductase and related  64.41 
 
 
121 aa  152  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0745404  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2640  arsenate reductase and related  63.25 
 
 
121 aa  151  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00790249  normal  0.809424 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3081  arsenate reductase and related  55.93 
 
 
118 aa  131  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.174741  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2790  putative arsenate reductase  59.13 
 
 
115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3022  arsenate reductase-like protein  57.63 
 
 
117 aa  122  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000669385  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2989  arsenate reductase  43.7 
 
 
121 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.912841  hitchhiker  0.00763911 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36820  arsenate reductase  47.9 
 
 
117 aa  100  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1247  arsenate reductase  43.7 
 
 
121 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000157462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4072  arsenate reductase  42.86 
 
 
117 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1645  arsenate reductase  42.02 
 
 
117 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0900  arsenate reductase  40.83 
 
 
117 aa  94.7  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000694318 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1207  arsenate reductase  41.18 
 
 
117 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3702  arsenate reductase  41.18 
 
 
117 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.895191  hitchhiker  0.000974632 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4228  arsenate reductase  40.34 
 
 
117 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106625  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2871  arsenate reductase, putative  40 
 
 
122 aa  92.4  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1687  arsenate reductase  38.66 
 
 
117 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4559  putative arsenate reductase  42.86 
 
 
117 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.720566  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51980  putative arsenate reductase  44.54 
 
 
117 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00081226 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0438  arsenate reductase  40.35 
 
 
116 aa  89.4  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0186  arsenate reductase  38.66 
 
 
116 aa  87.4  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.261986  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0559  arsenate reductase  41.23 
 
 
118 aa  86.7  9e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.779022  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2339  arsenate reductase  37.39 
 
 
114 aa  85.9  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0346722 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2420  arsenate reductase  39.5 
 
 
116 aa  84.3  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0233064  hitchhiker  0.000897731 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1694  arsenate reductase  38.66 
 
 
116 aa  84  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.964599  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1648  arsenate reductase  38.66 
 
 
116 aa  84  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2520  arsenate reductase  38.98 
 
 
116 aa  83.2  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782751  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1970  arsenate reductase  36.13 
 
 
116 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00382055  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1588  arsenate reductase (glutaredoxin)  36.52 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.686638  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2348  arsenate reductase  38.66 
 
 
116 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0983471  decreased coverage  0.000000000390856 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1754  arsenate reductase  38.6 
 
 
120 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1782  arsenate reductase  37.82 
 
 
116 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.094425  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1826  arsenate reductase  37.82 
 
 
116 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206755  normal  0.246096 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1789  arsenate reductase  37.82 
 
 
116 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2496  arsenate reductase  37.82 
 
 
116 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.52155  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2964  arsenate reductase  34.17 
 
 
115 aa  80.9  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0847246  normal  0.0110665 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0149  arsenate reductase  33.33 
 
 
117 aa  80.5  0.000000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000238389  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0286  arsenate reductase  36.84 
 
 
116 aa  79.7  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0914  arsenate reductase  38.33 
 
 
117 aa  79  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2883  arsenate reductase  38.26 
 
 
117 aa  78.2  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09213  probable arsenate reductase (glutaredoxin)  30.51 
 
 
121 aa  77.8  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.641437  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1646  arsenate reductase  35.29 
 
 
116 aa  77  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1840  arsenate reductase  36.97 
 
 
120 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.455524  normal  0.0890605 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5167  arsenate reductase  37.9 
 
 
119 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000109788  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5692  arsenate reductase  37.9 
 
 
119 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000484398  hitchhiker  0.00107308 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0846  arsenate reductase  37.39 
 
 
115 aa  75.5  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.273266  normal  0.401181 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4544  arsenate reductase  37.9 
 
 
119 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000001485  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2246  arsenate reductase  37.72 
 
 
120 aa  75.5  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3399  arsenate reductase  33.33 
 
 
116 aa  74.7  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1502  arsenate reductase  35 
 
 
118 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000339052  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3174  arsenate reductase  35 
 
 
118 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0227078  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3287  arsenate reductase  35 
 
 
118 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000468406  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2988  arsenate reductase  35.54 
 
 
118 aa  73.9  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.527919  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1914  arsenate reductase  38.6 
 
 
116 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.204122  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1068  arsenate reductase  36.52 
 
 
118 aa  73.6  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1207  arsenate reductase  33.62 
 
 
117 aa  72.8  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0485928  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3103  arsenate reductase  37.1 
 
 
119 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000012138  normal  0.181739 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2438  arsenate reductase  33.61 
 
 
116 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00647081 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2168  arsenate reductase  36.97 
 
 
116 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2461  arsenate reductase  33.88 
 
 
143 aa  72  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.255465  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3518  arsenate reductase  35 
 
 
117 aa  72  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000783056  normal  0.635279 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4964  arsenate reductase  36.29 
 
 
119 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000180468  normal  0.016428 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1465  arsenate reductase  33.62 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1133  arsenate reductase  34.45 
 
 
123 aa  71.2  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1073  arsenate reductase  31.45 
 
 
118 aa  70.9  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0830034  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3114  arsenate reductase  31.4 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3935  arsenate reductase  32.46 
 
 
115 aa  70.9  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0110005  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2754  arsenate reductase  38.02 
 
 
119 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2642  arsenate reductase  38.02 
 
 
119 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000176401  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2863  arsenate reductase  38.02 
 
 
119 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2732  arsenate reductase  38.02 
 
 
119 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.128422  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2690  arsenate reductase  38.02 
 
 
119 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.609299  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3183  arsenate reductase  33.05 
 
 
125 aa  70.5  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.4596  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0674  arsenate reductase  33.33 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.587242  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1421  arsenate reductase  34.17 
 
 
118 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245055  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2113  arsenate reductase  34.17 
 
 
118 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0142816  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0953  putative arsenate reductase  33.33 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2408  arsenate reductase  34.17 
 
 
118 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00110254  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1142  arsenate reductase  34.17 
 
 
118 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023694  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3141  arsenate reductase  33.06 
 
 
116 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0302  hypothetical protein  31.67 
 
 
113 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0006  arsenate reductase  37.1 
 
 
119 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000819049  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2642  arsenate reductase  35.9 
 
 
119 aa  68.2  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.226283  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2979  arsenate reductase  33.61 
 
 
119 aa  68.2  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.757259  normal  0.379867 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02387  predicted oxidoreductase  36.75 
 
 
119 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0301251  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3717  arsenate reductase  36.75 
 
 
119 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.38808  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0318  hypothetical protein  30.83 
 
 
113 aa  67.8  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02349  hypothetical protein  36.75 
 
 
119 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0505808  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2629  arsenate reductase  35.54 
 
 
119 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.549147  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3163  arsenate reductase  38.1 
 
 
119 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000451788  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2869  arsenate reductase  36.75 
 
 
119 aa  67.8  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.882195  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1355  arsenate reductase  31.4 
 
 
118 aa  67.4  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000261494  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1238  arsenate reductase (glutaredoxin)  31.4 
 
 
118 aa  67.4  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000367892  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3126  arsenate reductase  31.4 
 
 
118 aa  67.4  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000234859  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4852  arsenate reductase  31.93 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03352  arsenate reductase  31.4 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1174  arsenate reductase  35.54 
 
 
119 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.102535  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0213  arsenate reductase  31.4 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.592565 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03305  hypothetical protein  31.4 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>