More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0870 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0870  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
319 aa  610  9.999999999999999e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23320  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  47.06 
 
 
322 aa  258  8e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115564  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1864  alcohol dehydrogenase  45.23 
 
 
324 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15133  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4503  alcohol dehydrogenase  45.54 
 
 
324 aa  235  9e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13162  NADPH quinone oxidoreductase fadB4  45.23 
 
 
323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4894  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.2 
 
 
323 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0082  alcohol dehydrogenase  44.41 
 
 
321 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0092  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.79 
 
 
321 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0101  alcohol dehydrogenase  44.79 
 
 
321 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0992812 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1577  alcohol dehydrogenase  44.65 
 
 
333 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1554  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.65 
 
 
333 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.439452  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2364  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.75 
 
 
321 aa  216  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180992  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1523  alcohol dehydrogenase  44.95 
 
 
333 aa  215  8e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0659671  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4574  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.07 
 
 
331 aa  213  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.750038  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0740  alcohol dehydrogenase  43.3 
 
 
320 aa  210  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.869283 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.41 
 
 
325 aa  206  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.56 
 
 
322 aa  205  7e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4322  alcohol dehydrogenase  41.67 
 
 
324 aa  204  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1174  alcohol dehydrogenase  39.94 
 
 
333 aa  203  4e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.755357  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1382  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.75 
 
 
324 aa  201  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0107  alcohol dehydrogenase  43.61 
 
 
322 aa  200  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  40.18 
 
 
325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3334  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.74 
 
 
324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  39.88 
 
 
325 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2132  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.62 
 
 
331 aa  192  9e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0936  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.87 
 
 
327 aa  190  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  39.88 
 
 
325 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  39.76 
 
 
326 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  43.77 
 
 
325 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.77 
 
 
325 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342791  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  38.15 
 
 
325 aa  186  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.32 
 
 
328 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0924  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.58 
 
 
326 aa  181  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.284125 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1917  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  42.24 
 
 
336 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.820902  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0449  alcohol dehydrogenase  38.46 
 
 
324 aa  180  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0495582  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3534  alcohol dehydrogenase  39.63 
 
 
323 aa  179  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311979  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01063  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.1 
 
 
324 aa  179  5.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.27847  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0861  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.11 
 
 
326 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  38.65 
 
 
325 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1342  alcohol dehydrogenase  42.11 
 
 
326 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  38.65 
 
 
325 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  38.3 
 
 
326 aa  177  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1382  alcohol dehydrogenase  36.86 
 
 
334 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1858  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.11 
 
 
320 aa  177  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  38.39 
 
 
325 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  38.44 
 
 
319 aa  174  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1321  alcohol dehydrogenase  42.11 
 
 
326 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0130  alcohol dehydrogenase  40.31 
 
 
320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6127  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.02 
 
 
326 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0714054 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.78 
 
 
326 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4474  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  40.87 
 
 
326 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  37.77 
 
 
324 aa  171  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1259  alcohol dehydrogenase  41.49 
 
 
326 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  38.08 
 
 
324 aa  171  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1234  alcohol dehydrogenase  41.8 
 
 
326 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4076  alcohol dehydrogenase  39.63 
 
 
323 aa  170  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1231  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.56 
 
 
319 aa  169  5e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.727575  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0406  alcohol dehydrogenase  38.73 
 
 
326 aa  169  6e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262448  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.63 
 
 
324 aa  169  6e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2099  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.46 
 
 
324 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.287009  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1716  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.88 
 
 
325 aa  168  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1814  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.92 
 
 
324 aa  165  8e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1203  oxidoreductase protein  37.65 
 
 
324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1960  alcohol dehydrogenase  41.18 
 
 
326 aa  163  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.480335 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10150  quinone oxidoreductase  38.2 
 
 
322 aa  163  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0404  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.42 
 
 
324 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0179654  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2796  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.58 
 
 
327 aa  164  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.650426  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0644  alcohol dehydrogenase  42.42 
 
 
331 aa  163  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.815744 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2119  zinc-binding alcohol dehydrogenase  37.15 
 
 
361 aa  162  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0428078  normal  0.0987257 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0674  alcohol dehydrogenase  41.22 
 
 
319 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  decreased coverage  0.00401474 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2114  alcohol dehydrogenase  39.63 
 
 
324 aa  161  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1906  alcohol dehydrogenase  41.14 
 
 
340 aa  161  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.466553  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1047  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.42 
 
 
324 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.510115  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0037  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.42 
 
 
324 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.42 
 
 
324 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0470349  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.42 
 
 
335 aa  159  5e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0095  alcohol dehydrogenase  35.8 
 
 
324 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1667  alcohol dehydrogenase  40.4 
 
 
329 aa  158  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.367647  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3398  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.85 
 
 
326 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.197357  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5914  alcohol dehydrogenase  36.34 
 
 
337 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.96705  decreased coverage  0.00164429 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1891  Zinc-binding dehydrogenase  39.56 
 
 
319 aa  156  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0539  alcohol dehydrogenase  39.25 
 
 
319 aa  156  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5263  putative oxidoreductase  39.13 
 
 
325 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.333673  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0707  zinc-binding alcohol dehydrogenase  35.49 
 
 
324 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0360  putative oxidoreductase  39.43 
 
 
331 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2527  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  36.11 
 
 
323 aa  153  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0958  alcohol dehydrogenase  38.39 
 
 
324 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.84 
 
 
324 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308751  normal  0.191683 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2354  putative NADPH quinone oxidoreductase, zinc- containing  37.46 
 
 
324 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350138  normal  0.0818586 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4852  putative Zinc-dependent dehydrogenase  38.25 
 
 
336 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.249579  normal  0.200549 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  35.8 
 
 
327 aa  150  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1413  alcohol dehydrogenase  36.84 
 
 
324 aa  149  6e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2354  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.26 
 
 
325 aa  149  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00555058  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2783  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.84 
 
 
324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0243  putative quinone oxidoreductase (NADPH) and Zn-dependent alcohol dehydrogenase  34.67 
 
 
324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2947  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.14 
 
 
335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.654698  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4830  alcohol dehydrogenase  37.46 
 
 
332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2406  alcohol dehydrogenase  38.11 
 
 
326 aa  146  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.14287 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4910  alcohol dehydrogenase  36.03 
 
 
331 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1855  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.28 
 
 
329 aa  146  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>