80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1720 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1720  CutA1 divalent ion tolerance protein  100 
 
 		 101 aa  206  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.574224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3115  divalent cation tolerance protein  31.68 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0820083  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2000  CutA1 divalent ion tolerance protein  38.54 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.314038  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1490  periplasmic divalent cation tolerance protein cutA, putative  37.37 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000459087  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1673  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.46 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.478718  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0581  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.35 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2158  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.11 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.890158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0428  CutA1 divalent ion tolerance protein  32.26 
 
 		 103 aa  57  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.832839 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1688  CutA1 divalent ion tolerance protein  24.47 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2482  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.87 
 
 		 105 aa  53.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.634613  normal  0.126784 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4630  CutA1 divalent ion tolerance protein  31.87 
 
 		 113 aa  52.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292633  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0385  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.79 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.331799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4155  CutA1 divalent ion tolerance protein  32.29 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000487398  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1741  CutA1 divalent ion tolerance protein  32.61 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.894466 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0040  CutA1 divalent ion tolerance protein  31.18 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.214285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0633  CutA1 divalent ion tolerance protein  30 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1473  CutA1 divalent ion tolerance protein  31.58 
 
 		 103 aa  51.2  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.168159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2936  CutA1 divalent ion tolerance protein  32.29 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.157087 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4326  CutA1 divalent ion tolerance protein  31 
 
 		 111 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1739  hypothetical protein  30.85 
 
 		 125 aa  50.1  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4624  CutA1 divalent ion tolerance protein  27.37 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1899  CutA1 divalent ion tolerance protein  29.17 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1473  periplasmic divalent cation tolerance protein  31.25 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000113096  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1589  divalent cation tolerance protein CutA  31.25 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0777  CutA1 divalent ion tolerance protein  32.98 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1337  CutA1 divalent ion tolerance protein  31.63 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0544712  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0756  divalent ion tolerance protein CutA1  27.55 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.123364  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3007  hypothetical protein  33.7 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0373  CutA1 divalent ion tolerance protein  36.14 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135716  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0645  CutA1 divalent ion tolerance protein  31.91 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0828  CutA1 divalent ion tolerance protein  28.57 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1262  CutA1 divalent ion tolerance protein  33.33 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112671  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1193  CutA1 divalent ion tolerance protein  33.33 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0316727  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0586  CutA1 divalent ion tolerance protein  33.33 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2261  periplasmic divalent cation tolerance protein  31.96 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.155745  normal  0.159586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0547  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.65 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.118163  normal  0.108424 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3575  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.21 
 
 		 107 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.229751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3405  CutA1 divalent ion tolerance protein  37.65 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.467432  normal  0.0160634 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0246  CutA1 divalent ion tolerance protein  32.99 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.299344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3509  CutA1 divalent ion tolerance protein  33.68 
 
 		 100 aa  47.4  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.666044  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1180  CutA1 divalent ion tolerance protein  30.43 
 
 		 105 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1513  CutA1 divalent ion tolerance protein  35.63 
 
 		 100 aa  47  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0036  CutA1 divalent ion tolerance protein  32.14 
 
 		 114 aa  47  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1539  CutA1 divalent ion tolerance protein  26.32 
 
 		 103 aa  47  0.00009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.234612 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0749  dephospho-CoA kinase  34.78 
 
 		 294 aa  46.2  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0299889  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0318  CutA1 divalent ion tolerance protein  26.53 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.344842  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2188  CutA1 divalent ion tolerance protein  39.29 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4014  CutA1 divalent ion tolerance protein  30.53 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000995556 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03011  periplasmic divalent cation tolerance protein  33 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0021  CutA1 divalent ion tolerance protein  31.63 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.722189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1306  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.55 
 
 		 103 aa  44.7  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0828  periplasmic divalent cation tolerance protein  23.96 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31390  uncharacterized protein involved in tolerance to divalent cations  27.78 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473848 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0037  CutA1 divalent ion tolerance protein  30.85 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1230  CutA1 divalent ion tolerance protein  33.33 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0954  periplasmic divalent cation tolerance protein CutA  29.76 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1056  CutA1 divalent ion tolerance protein  26.26 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00140547  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2339  CutA1 divalent ion tolerance protein  29.21 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119887  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3269  CutA1 divalent ion tolerance protein  33.33 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.011597 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2095  CutA1 divalent ion tolerance protein  28.72 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0637  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.12 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.887126  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0660  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.12 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.970126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1667  CutA1 divalent ion tolerance protein  32.18 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.024619 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3725  CutA1 divalent ion tolerance protein  34.12 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.414398  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2991  periplasmic divalent cation tolerance protein  32.63 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0078  CutA1 divalent ion tolerance protein  27.84 
 
 		 116 aa  41.6  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000144851 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5137  CutA1 divalent ion tolerance protein  30.43 
 
 		 109 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504404  normal  0.028749 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4624  CutA1 divalent ion tolerance protein  30.43 
 
 		 116 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0605  CutA1 divalent ion tolerance protein  29.89 
 
 		 112 aa  41.2  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  decreased coverage  0.0027095 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0029  CutA1 divalent ion tolerance protein  27.55 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3226  CutA1 divalent ion tolerance protein  30.43 
 
 		 172 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.508585  normal  0.268666 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5355  CutA1 divalent ion tolerance protein  25.26 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0656579 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3152  CutA1 divalent ion tolerance protein  33.85 
 
 		 126 aa  41.2  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.857846  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3534  divalent-cation tolerance protein CutA  25.88 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0664  CutA1 divalent ion tolerance protein  32.94 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1752  CutA1 divalent ion tolerance protein  29.17 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0108  CutA1 divalent ion tolerance protein  25.93 
 
 		 103 aa  40.8  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000262572 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3289  CutA1 divalent ion tolerance protein  31.37 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3914  CutA1 divalent ion tolerance protein  31.58 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1359  CutA1 divalent ion tolerance protein  27.37 
 
 		 103 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.458665  normal  0.151703 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>