87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1863 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1863  hypothetical protein  100 
 
 
406 aa  798    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.165766 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0041  hypothetical protein  56.56 
 
 
401 aa  410  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0602392  normal  0.0628482 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0021  hypothetical protein  55.27 
 
 
401 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.170066  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0020  hypothetical protein  55.22 
 
 
399 aa  392  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.117767  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0074  hypothetical protein  55.67 
 
 
406 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.667411 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5840  hypothetical protein  47.89 
 
 
413 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.5584 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2044  hypothetical protein  47.75 
 
 
410 aa  361  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.122216  normal  0.245811 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3587  hypothetical protein  48.61 
 
 
414 aa  349  4e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2635  hypothetical protein  47.25 
 
 
392 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355805  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2868  hypothetical protein  45.73 
 
 
392 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.285945  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4763  hypothetical protein  44.78 
 
 
413 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.896269  normal  0.204861 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3998  hypothetical protein  45.27 
 
 
413 aa  315  7e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.348755 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4087  hypothetical protein  43.75 
 
 
420 aa  310  4e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4552  hypothetical protein  43.5 
 
 
411 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0632047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3367  hypothetical protein  28.79 
 
 
391 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000329011  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4516  hypothetical protein  21.74 
 
 
486 aa  86.3  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1130  hypothetical protein  28.53 
 
 
494 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2085  hypothetical protein  31.02 
 
 
407 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1242  hypothetical protein  28.26 
 
 
494 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.36599  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1406  hypothetical protein  30.1 
 
 
408 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.926489  normal  0.0309709 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1459  hypothetical protein  30.75 
 
 
413 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5889  hypothetical protein  29.88 
 
 
404 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4080  hypothetical protein  28.21 
 
 
404 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1207  hypothetical protein  28.66 
 
 
474 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.587699  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1341  hypothetical protein  29.01 
 
 
415 aa  72  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.101093 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1587  hypothetical protein  27.69 
 
 
461 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2529  hypothetical protein  22.41 
 
 
492 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.301158  normal  0.321166 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3585  hypothetical protein  22.41 
 
 
492 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2396  hypothetical protein  27.48 
 
 
471 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.944145  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1916  hypothetical protein  22.2 
 
 
480 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.382206 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4869  Protein of unknown function DUF2252  27.05 
 
 
485 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2396  hypothetical protein  26.67 
 
 
495 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.167793 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1648  hypothetical protein  34.75 
 
 
437 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.324068  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2341  hypothetical protein  30 
 
 
444 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000268257  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3637  hypothetical protein  30.27 
 
 
407 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0828  hypothetical protein  34.09 
 
 
451 aa  63.2  0.000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.182341  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1503  Protein of unknown function DUF2252  27.67 
 
 
464 aa  62.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.935426  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3161  hypothetical protein  38.37 
 
 
437 aa  62  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0158  hypothetical protein  23.89 
 
 
477 aa  61.6  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.94727  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5970  hypothetical protein  30.09 
 
 
436 aa  60.8  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.323905  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1503  hypothetical protein  30.16 
 
 
503 aa  60.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227596 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1504  hypothetical protein  25.56 
 
 
462 aa  60.1  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.215631  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2520  hypothetical protein  39.77 
 
 
493 aa  58.9  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0184081 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0864  hypothetical protein  31.9 
 
 
498 aa  58.9  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134206  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2087  hypothetical protein  28.35 
 
 
432 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.642554  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2987  hypothetical protein  25.56 
 
 
471 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000011145  hitchhiker  0.00753945 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5266  hypothetical protein  27.05 
 
 
369 aa  57  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.164397  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2465  hypothetical protein  37.08 
 
 
470 aa  57  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4704  hypothetical protein  33.04 
 
 
473 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0115102 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0931  Protein of unknown function DUF2252  25.14 
 
 
462 aa  56.6  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4820  Protein of unknown function DUF2252  32.56 
 
 
447 aa  56.6  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.923578  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2136  hypothetical protein  23.66 
 
 
438 aa  56.6  0.0000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.698891 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1437  hypothetical protein  38.64 
 
 
464 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.768827  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1408  hypothetical protein  38.64 
 
 
464 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3960  hypothetical protein  32.65 
 
 
399 aa  55.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.146173  normal  0.0157887 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1703  hypothetical protein  46.67 
 
 
79 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.27794  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2606  hypothetical protein  31.52 
 
 
448 aa  55.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.045879  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0156  hypothetical protein  57.14 
 
 
73 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0473  Protein of unknown function DUF2252  29.57 
 
 
462 aa  54.3  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1180  hypothetical protein  21.48 
 
 
469 aa  54.3  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115091  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0473  hypothetical protein  25.79 
 
 
473 aa  53.9  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172011  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0653  hypothetical protein  22.91 
 
 
471 aa  53.5  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5403  hypothetical protein  24.15 
 
 
470 aa  53.1  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2955  hypothetical protein  32.08 
 
 
510 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000276818  hitchhiker  0.00175827 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4442  hypothetical protein  30.39 
 
 
479 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1145  hypothetical protein  31.78 
 
 
465 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1384  hypothetical protein  26.96 
 
 
438 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.978626  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2216  hypothetical protein  32.76 
 
 
470 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.952755  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2326  hypothetical protein  32.95 
 
 
474 aa  51.2  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00587073  hitchhiker  0.0000416917 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5980  hypothetical protein  33.68 
 
 
470 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335989  normal  0.514898 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2140  hypothetical protein  31.48 
 
 
470 aa  50.8  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6353  hypothetical protein  24.73 
 
 
484 aa  50.4  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.385812 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1368  hypothetical protein  26.09 
 
 
438 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6605  hypothetical protein  26.43 
 
 
470 aa  50.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2365  Protein of unknown function DUF2252  33.71 
 
 
458 aa  50.4  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398569  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1350  hypothetical protein  26.09 
 
 
442 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.060115  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7522  hypothetical protein  32.58 
 
 
466 aa  49.7  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.523269  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2373  hypothetical protein  30.21 
 
 
348 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.424194  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1537  hypothetical protein  22.16 
 
 
465 aa  49.3  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02588  conserved hypothetical protein  22.94 
 
 
448 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2675  hypothetical protein  33.88 
 
 
350 aa  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0568  hypothetical protein  31.87 
 
 
468 aa  47.4  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4574  hypothetical protein  26.52 
 
 
358 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.134631 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1593  hypothetical protein  30.34 
 
 
476 aa  45.1  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4747  hypothetical protein  32.97 
 
 
487 aa  44.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5051  hypothetical protein  31.3 
 
 
357 aa  43.5  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684708  normal  0.0897321 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4311  hypothetical protein  26.97 
 
 
358 aa  43.1  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.517108  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>