70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3998 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_3998  hypothetical protein  100 
 
 
413 aa  829    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.348755 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4552  hypothetical protein  79.85 
 
 
411 aa  659    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0632047 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4087  hypothetical protein  79.36 
 
 
420 aa  654    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4763  hypothetical protein  61.41 
 
 
413 aa  508  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.896269  normal  0.204861 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2044  hypothetical protein  56.37 
 
 
410 aa  463  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.122216  normal  0.245811 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5840  hypothetical protein  55.34 
 
 
413 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.5584 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2868  hypothetical protein  53.12 
 
 
392 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.285945  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2635  hypothetical protein  52.66 
 
 
392 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355805  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3587  hypothetical protein  52.16 
 
 
414 aa  393  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0074  hypothetical protein  49.75 
 
 
406 aa  368  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.667411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0041  hypothetical protein  48.97 
 
 
401 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0602392  normal  0.0628482 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0021  hypothetical protein  47.44 
 
 
401 aa  363  3e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.170066  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0020  hypothetical protein  47.83 
 
 
399 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.117767  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1863  hypothetical protein  45.27 
 
 
406 aa  315  7e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.165766 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3367  hypothetical protein  26.28 
 
 
391 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000329011  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2085  hypothetical protein  26.38 
 
 
407 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5889  hypothetical protein  26.71 
 
 
404 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1130  hypothetical protein  26.86 
 
 
494 aa  76.6  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1242  hypothetical protein  26.6 
 
 
494 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.36599  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0828  hypothetical protein  24.59 
 
 
451 aa  72.4  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.182341  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1703  hypothetical protein  47.83 
 
 
79 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.27794  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1350  hypothetical protein  25.35 
 
 
442 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.060115  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1368  hypothetical protein  25.35 
 
 
438 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1916  hypothetical protein  21.49 
 
 
480 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.382206 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4516  hypothetical protein  20.73 
 
 
486 aa  68.2  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1384  hypothetical protein  25.29 
 
 
438 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.978626  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4080  hypothetical protein  25.08 
 
 
404 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4820  Protein of unknown function DUF2252  25.25 
 
 
447 aa  64.7  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.923578  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2087  hypothetical protein  24.8 
 
 
432 aa  63.9  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.642554  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0931  Protein of unknown function DUF2252  26.9 
 
 
462 aa  63.5  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3585  hypothetical protein  22.67 
 
 
492 aa  60.1  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2529  hypothetical protein  22.67 
 
 
492 aa  60.1  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.301158  normal  0.321166 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5970  hypothetical protein  22.66 
 
 
436 aa  59.3  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.323905  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2987  hypothetical protein  23.88 
 
 
471 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000011145  hitchhiker  0.00753945 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2216  hypothetical protein  24.81 
 
 
470 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.952755  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2365  Protein of unknown function DUF2252  25.07 
 
 
458 aa  55.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398569  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1648  hypothetical protein  31.86 
 
 
437 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.324068  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0158  hypothetical protein  25.9 
 
 
477 aa  55.1  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.94727  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2341  hypothetical protein  34.23 
 
 
444 aa  54.7  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000268257  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5980  hypothetical protein  24.49 
 
 
470 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335989  normal  0.514898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1587  hypothetical protein  20.48 
 
 
461 aa  53.9  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2465  hypothetical protein  27.15 
 
 
470 aa  53.9  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2606  hypothetical protein  30.77 
 
 
448 aa  52.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.045879  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2396  hypothetical protein  24.06 
 
 
471 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.944145  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4869  Protein of unknown function DUF2252  31.01 
 
 
485 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.15703 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02588  conserved hypothetical protein  28.45 
 
 
448 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3637  hypothetical protein  26.52 
 
 
407 aa  51.2  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1207  hypothetical protein  26.63 
 
 
474 aa  51.6  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.587699  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3161  hypothetical protein  21.79 
 
 
437 aa  50.8  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1504  hypothetical protein  21.93 
 
 
462 aa  50.4  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.215631  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1180  hypothetical protein  32.95 
 
 
469 aa  49.3  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115091  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1537  hypothetical protein  21.13 
 
 
465 aa  48.1  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5266  hypothetical protein  34.55 
 
 
369 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.164397  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1503  hypothetical protein  27.65 
 
 
503 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227596 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2520  hypothetical protein  33.98 
 
 
493 aa  47.4  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0184081 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3960  hypothetical protein  23.57 
 
 
399 aa  47.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.146173  normal  0.0157887 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2396  hypothetical protein  24.86 
 
 
495 aa  47  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.167793 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0864  hypothetical protein  23.88 
 
 
498 aa  46.6  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134206  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0653  hypothetical protein  27.87 
 
 
471 aa  46.2  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3330  hypothetical protein  32.17 
 
 
364 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0308165  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1408  hypothetical protein  23.4 
 
 
464 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1593  hypothetical protein  21.19 
 
 
476 aa  45.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1437  hypothetical protein  23.4 
 
 
464 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.768827  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1459  hypothetical protein  25.81 
 
 
413 aa  45.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5403  hypothetical protein  35 
 
 
470 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6353  hypothetical protein  22.67 
 
 
484 aa  43.5  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.385812 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4747  hypothetical protein  38.14 
 
 
487 aa  43.1  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2955  hypothetical protein  31.25 
 
 
510 aa  43.1  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000276818  hitchhiker  0.00175827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7522  hypothetical protein  32.29 
 
 
466 aa  43.1  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.523269  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1503  Protein of unknown function DUF2252  34.04 
 
 
464 aa  43.1  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.935426  normal  0.301708 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>