73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0020 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0020  hypothetical protein  100 
 
 
399 aa  803    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.117767  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0041  hypothetical protein  86.22 
 
 
401 aa  685    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0602392  normal  0.0628482 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0021  hypothetical protein  98.74 
 
 
401 aa  792    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.170066  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0074  hypothetical protein  76.25 
 
 
406 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.667411 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5840  hypothetical protein  56.35 
 
 
413 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.5584 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2044  hypothetical protein  55.64 
 
 
410 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.122216  normal  0.245811 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2635  hypothetical protein  56.07 
 
 
392 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355805  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3587  hypothetical protein  55.81 
 
 
414 aa  425  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2868  hypothetical protein  55.3 
 
 
392 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.285945  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1863  hypothetical protein  55.56 
 
 
406 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.165766 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3998  hypothetical protein  47.83 
 
 
413 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.348755 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4087  hypothetical protein  47.31 
 
 
420 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4552  hypothetical protein  47.45 
 
 
411 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0632047 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4763  hypothetical protein  47.84 
 
 
413 aa  360  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.896269  normal  0.204861 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0156  hypothetical protein  84.31 
 
 
73 aa  94  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1703  hypothetical protein  65 
 
 
79 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.27794  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3367  hypothetical protein  26.84 
 
 
391 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000329011  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2085  hypothetical protein  28.7 
 
 
407 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5889  hypothetical protein  26.75 
 
 
404 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4080  hypothetical protein  26.79 
 
 
404 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3637  hypothetical protein  26.75 
 
 
407 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02588  conserved hypothetical protein  30.91 
 
 
448 aa  62.4  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1587  hypothetical protein  25.33 
 
 
461 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1130  hypothetical protein  24.23 
 
 
494 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1242  hypothetical protein  23.98 
 
 
494 aa  57  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.36599  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0769  hypothetical protein  24.28 
 
 
503 aa  56.6  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.598571  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0828  hypothetical protein  27.87 
 
 
451 aa  56.6  0.0000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.182341  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4820  Protein of unknown function DUF2252  28.12 
 
 
447 aa  55.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.923578  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1459  hypothetical protein  30.11 
 
 
413 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1648  hypothetical protein  31.86 
 
 
437 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.324068  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3960  hypothetical protein  27.8 
 
 
399 aa  54.3  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.146173  normal  0.0157887 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2606  hypothetical protein  30.58 
 
 
448 aa  54.3  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.045879  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4516  hypothetical protein  24.77 
 
 
486 aa  53.9  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1406  hypothetical protein  27.95 
 
 
408 aa  53.9  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.926489  normal  0.0309709 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5970  hypothetical protein  33.01 
 
 
436 aa  53.5  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.323905  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2341  hypothetical protein  30.83 
 
 
444 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000268257  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4311  hypothetical protein  35 
 
 
358 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.517108  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2396  hypothetical protein  25.48 
 
 
495 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.167793 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3585  hypothetical protein  23.02 
 
 
492 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2396  hypothetical protein  25.58 
 
 
471 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.944145  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2529  hypothetical protein  23.02 
 
 
492 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.301158  normal  0.321166 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0931  Protein of unknown function DUF2252  30.09 
 
 
462 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5266  hypothetical protein  32.5 
 
 
369 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.164397  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4574  hypothetical protein  33.33 
 
 
358 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.134631 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2520  hypothetical protein  35.45 
 
 
493 aa  51.2  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0184081 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2087  hypothetical protein  29.41 
 
 
432 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.642554  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1207  hypothetical protein  35.29 
 
 
474 aa  50.4  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.587699  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4869  Protein of unknown function DUF2252  34.52 
 
 
485 aa  50.1  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2465  hypothetical protein  28.12 
 
 
470 aa  50.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1384  hypothetical protein  32.58 
 
 
438 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.978626  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1350  hypothetical protein  32.58 
 
 
442 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.060115  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1368  hypothetical protein  32.58 
 
 
438 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5051  hypothetical protein  30.83 
 
 
357 aa  49.3  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684708  normal  0.0897321 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1916  hypothetical protein  21.19 
 
 
480 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.382206 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3330  hypothetical protein  34.83 
 
 
364 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0308165  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2373  hypothetical protein  32.48 
 
 
348 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.424194  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2675  hypothetical protein  29.82 
 
 
350 aa  47.8  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1341  hypothetical protein  34.57 
 
 
415 aa  47.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.101093 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2987  hypothetical protein  34.78 
 
 
471 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000011145  hitchhiker  0.00753945 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1408  hypothetical protein  28.57 
 
 
464 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0158  hypothetical protein  31.91 
 
 
477 aa  46.2  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.94727  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1437  hypothetical protein  28.57 
 
 
464 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.768827  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1145  hypothetical protein  32.22 
 
 
465 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0864  hypothetical protein  33.33 
 
 
498 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134206  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1180  hypothetical protein  29.55 
 
 
469 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115091  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3161  hypothetical protein  35.29 
 
 
437 aa  45.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1537  hypothetical protein  31.58 
 
 
465 aa  45.1  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1504  hypothetical protein  31.52 
 
 
462 aa  44.3  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.215631  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7522  hypothetical protein  34.48 
 
 
466 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.523269  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0653  hypothetical protein  31.58 
 
 
471 aa  43.9  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0568  hypothetical protein  33.33 
 
 
468 aa  43.5  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2140  hypothetical protein  31.25 
 
 
470 aa  43.5  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1593  hypothetical protein  26.72 
 
 
476 aa  43.5  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>