88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4869 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4869  Protein of unknown function DUF2252  100 
 
 
485 aa  973    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1916  hypothetical protein  43.24 
 
 
480 aa  355  8.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.382206 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2529  hypothetical protein  39.15 
 
 
492 aa  291  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.301158  normal  0.321166 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3585  hypothetical protein  39.15 
 
 
492 aa  291  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4516  hypothetical protein  40.43 
 
 
486 aa  289  1e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2136  hypothetical protein  35.96 
 
 
438 aa  257  4e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.698891 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1180  hypothetical protein  34.83 
 
 
469 aa  192  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115091  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0828  hypothetical protein  30.17 
 
 
451 aa  181  4e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.182341  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1384  hypothetical protein  33.09 
 
 
438 aa  176  8e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.978626  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1350  hypothetical protein  33.09 
 
 
442 aa  176  9e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.060115  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1368  hypothetical protein  33.09 
 
 
438 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2087  hypothetical protein  33 
 
 
432 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.642554  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02588  conserved hypothetical protein  31.78 
 
 
448 aa  167  4e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1648  hypothetical protein  30.3 
 
 
437 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.324068  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4820  Protein of unknown function DUF2252  31.03 
 
 
447 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.923578  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2341  hypothetical protein  30.79 
 
 
444 aa  159  8e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000268257  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0931  Protein of unknown function DUF2252  30.75 
 
 
462 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2606  hypothetical protein  29.59 
 
 
448 aa  153  7e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.045879  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5970  hypothetical protein  29.8 
 
 
436 aa  152  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.323905  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0769  hypothetical protein  28.93 
 
 
503 aa  124  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.598571  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5889  hypothetical protein  27.31 
 
 
404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1587  hypothetical protein  28.43 
 
 
461 aa  114  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3161  hypothetical protein  27.85 
 
 
437 aa  114  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2085  hypothetical protein  26.51 
 
 
407 aa  111  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3367  hypothetical protein  26.46 
 
 
391 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000329011  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01772  hypothetical protein  25.9 
 
 
442 aa  108  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.454303  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4080  hypothetical protein  26.58 
 
 
404 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1242  hypothetical protein  29.03 
 
 
494 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.36599  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1130  hypothetical protein  29.03 
 
 
494 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0473  hypothetical protein  26.74 
 
 
473 aa  98.2  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172011  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1537  hypothetical protein  24.66 
 
 
465 aa  97.1  7e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2396  hypothetical protein  25.69 
 
 
495 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.167793 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3960  hypothetical protein  28.53 
 
 
399 aa  90.9  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.146173  normal  0.0157887 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4442  hypothetical protein  27.45 
 
 
479 aa  90.9  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2365  Protein of unknown function DUF2252  25.14 
 
 
458 aa  89.7  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398569  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2326  hypothetical protein  27.37 
 
 
474 aa  86.7  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00587073  hitchhiker  0.0000416917 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1459  hypothetical protein  27.65 
 
 
413 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1503  Protein of unknown function DUF2252  26.22 
 
 
464 aa  85.5  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.935426  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4704  hypothetical protein  26.1 
 
 
473 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0115102 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3637  hypothetical protein  27.12 
 
 
407 aa  85.1  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2216  hypothetical protein  26.56 
 
 
470 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.952755  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0158  hypothetical protein  26.22 
 
 
477 aa  82  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.94727  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6605  hypothetical protein  26.77 
 
 
470 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2465  hypothetical protein  26.94 
 
 
470 aa  80.9  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5980  hypothetical protein  26.29 
 
 
470 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335989  normal  0.514898 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4747  hypothetical protein  27.74 
 
 
487 aa  78.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5403  hypothetical protein  25 
 
 
470 aa  79.3  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0473  Protein of unknown function DUF2252  26.55 
 
 
462 aa  77  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1145  hypothetical protein  35 
 
 
465 aa  76.3  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0864  hypothetical protein  26.23 
 
 
498 aa  74.7  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134206  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1863  hypothetical protein  25.94 
 
 
406 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.165766 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1341  hypothetical protein  30.08 
 
 
415 aa  73.9  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.101093 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2520  hypothetical protein  34.55 
 
 
493 aa  73.6  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0184081 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1593  hypothetical protein  26.77 
 
 
476 aa  72.8  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1504  hypothetical protein  24.86 
 
 
462 aa  71.6  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.215631  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5266  hypothetical protein  29.96 
 
 
369 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.164397  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2396  hypothetical protein  37.65 
 
 
471 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.944145  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1207  hypothetical protein  31.78 
 
 
474 aa  70.5  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.587699  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1503  hypothetical protein  26.33 
 
 
503 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227596 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2955  hypothetical protein  32.26 
 
 
510 aa  68.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000276818  hitchhiker  0.00175827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7522  hypothetical protein  35.35 
 
 
466 aa  68.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.523269  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1437  hypothetical protein  22.94 
 
 
464 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.768827  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6353  hypothetical protein  36.89 
 
 
484 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.385812 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1408  hypothetical protein  22.94 
 
 
464 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1406  hypothetical protein  27.54 
 
 
408 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.926489  normal  0.0309709 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2987  hypothetical protein  34.62 
 
 
471 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000011145  hitchhiker  0.00753945 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0568  hypothetical protein  36.05 
 
 
468 aa  67  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2140  hypothetical protein  34.02 
 
 
470 aa  66.6  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0653  hypothetical protein  22.59 
 
 
471 aa  65.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5840  hypothetical protein  25.61 
 
 
413 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.5584 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2044  hypothetical protein  26.01 
 
 
410 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.122216  normal  0.245811 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3330  hypothetical protein  36.27 
 
 
364 aa  60.1  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0308165  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2373  hypothetical protein  28.06 
 
 
348 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.424194  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4763  hypothetical protein  30.25 
 
 
413 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.896269  normal  0.204861 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2675  hypothetical protein  33.33 
 
 
350 aa  52.8  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0041  hypothetical protein  33.71 
 
 
401 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0602392  normal  0.0628482 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3998  hypothetical protein  31.01 
 
 
413 aa  52.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.348755 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2868  hypothetical protein  23.66 
 
 
392 aa  52  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.285945  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0021  hypothetical protein  34.52 
 
 
401 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.170066  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0020  hypothetical protein  34.52 
 
 
399 aa  50.4  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.117767  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3587  hypothetical protein  28.1 
 
 
414 aa  49.7  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5051  hypothetical protein  25.7 
 
 
357 aa  49.7  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684708  normal  0.0897321 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4552  hypothetical protein  28.95 
 
 
411 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0632047 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0074  hypothetical protein  30.91 
 
 
406 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.667411 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2635  hypothetical protein  29.91 
 
 
392 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355805  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4311  hypothetical protein  24.61 
 
 
358 aa  48.5  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.517108  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4574  hypothetical protein  29.91 
 
 
358 aa  47.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.134631 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4087  hypothetical protein  30.36 
 
 
420 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>