88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1459 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1459  hypothetical protein  100 
 
 		 413 aa  833    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1406  hypothetical protein  81.33 
 
 		 408 aa  649    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.926489  normal  0.0309709 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1341  hypothetical protein  80.34 
 
 		 415 aa  654    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.101093 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3637  hypothetical protein  57.64 
 
 		 407 aa  414  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3960  hypothetical protein  54.41 
 
 		 399 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.146173  normal  0.0157887 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4080  hypothetical protein  41.79 
 
 		 404 aa  293  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2085  hypothetical protein  40.44 
 
 		 407 aa  292  6e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5889  hypothetical protein  41.4 
 
 		 404 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3367  hypothetical protein  40.66 
 
 		 391 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000329011  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1916  hypothetical protein  28.9 
 
 		 480 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.382206 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1648  hypothetical protein  33.6 
 
 		 437 aa  104  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.324068  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3585  hypothetical protein  29.06 
 
 		 492 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2529  hypothetical protein  29.06 
 
 		 492 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.301158  normal  0.321166 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2341  hypothetical protein  31.48 
 
 		 444 aa  102  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000268257  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1130  hypothetical protein  31.6 
 
 		 494 aa  99.8  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1242  hypothetical protein  31.29 
 
 		 494 aa  99  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.36599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1180  hypothetical protein  27.65 
 
 		 469 aa  98.6  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115091  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4820  Protein of unknown function DUF2252  32.79 
 
 		 447 aa  98.2  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.923578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2987  hypothetical protein  31.35 
 
 		 471 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000011145  hitchhiker  0.00753945 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2396  hypothetical protein  28.27 
 
 		 471 aa  94  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.944145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5970  hypothetical protein  32.78 
 
 		 436 aa  94  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.323905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1587  hypothetical protein  29.25 
 
 		 461 aa  93.6  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4516  hypothetical protein  27.13 
 
 		 486 aa  92.4  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4704  hypothetical protein  29.87 
 
 		 473 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0115102 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1503  Protein of unknown function DUF2252  28.96 
 
 		 464 aa  90.1  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.935426  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1207  hypothetical protein  27.74 
 
 		 474 aa  87.8  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.587699  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2326  hypothetical protein  28.04 
 
 		 474 aa  87.4  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00587073  hitchhiker  0.0000416917 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1350  hypothetical protein  29.82 
 
 		 442 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.060115  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1384  hypothetical protein  29.82 
 
 		 438 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.978626  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1368  hypothetical protein  29.82 
 
 		 438 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2216  hypothetical protein  31.51 
 
 		 470 aa  87.4  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.952755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5980  hypothetical protein  31.51 
 
 		 470 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335989  normal  0.514898 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0653  hypothetical protein  26.02 
 
 		 471 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02588  conserved hypothetical protein  28.14 
 
 		 448 aa  85.5  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0473  Protein of unknown function DUF2252  29.77 
 
 		 462 aa  84.7  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1504  hypothetical protein  27.67 
 
 		 462 aa  84  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.215631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6605  hypothetical protein  31.38 
 
 		 470 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2087  hypothetical protein  30.99 
 
 		 432 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.642554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3161  hypothetical protein  24.92 
 
 		 437 aa  81.6  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5266  hypothetical protein  32.43 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.164397  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4869  Protein of unknown function DUF2252  27.53 
 
 		 485 aa  80.9  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2520  hypothetical protein  41.07 
 
 		 493 aa  79.3  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0184081 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2396  hypothetical protein  28.98 
 
 		 495 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.167793 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2606  hypothetical protein  29.15 
 
 		 448 aa  79.7  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.045879  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1863  hypothetical protein  30.75 
 
 		 406 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.165766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0473  hypothetical protein  27.78 
 
 		 473 aa  78.2  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1437  hypothetical protein  26.02 
 
 		 464 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.768827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0158  hypothetical protein  24.38 
 
 		 477 aa  78.2  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.94727  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1408  hypothetical protein  26.02 
 
 		 464 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2955  hypothetical protein  30.6 
 
 		 510 aa  77  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000276818  hitchhiker  0.00175827 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1145  hypothetical protein  24 
 
 		 465 aa  76.3  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2465  hypothetical protein  26.87 
 
 		 470 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2365  Protein of unknown function DUF2252  26.22 
 
 		 458 aa  75.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398569  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5051  hypothetical protein  32.52 
 
 		 357 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684708  normal  0.0897321 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0931  Protein of unknown function DUF2252  28.17 
 
 		 462 aa  74.7  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4442  hypothetical protein  27.64 
 
 		 479 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0568  hypothetical protein  25.76 
 
 		 468 aa  73.2  0.000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6353  hypothetical protein  25.91 
 
 		 484 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.385812 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2140  hypothetical protein  31.58 
 
 		 470 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0864  hypothetical protein  32.03 
 
 		 498 aa  72  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7522  hypothetical protein  36.22 
 
 		 466 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.523269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0828  hypothetical protein  25.89 
 
 		 451 aa  72  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.182341  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4311  hypothetical protein  29.67 
 
 		 358 aa  70.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.517108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2373  hypothetical protein  28.11 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.424194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0769  hypothetical protein  28.83 
 
 		 503 aa  68.6  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.598571  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3330  hypothetical protein  37.76 
 
 		 364 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0308165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1537  hypothetical protein  21.94 
 
 		 465 aa  67.8  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1503  hypothetical protein  27.54 
 
 		 503 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227596 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2136  hypothetical protein  26 
 
 		 438 aa  67.4  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.698891 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5403  hypothetical protein  32.8 
 
 		 470 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2675  hypothetical protein  31.51 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1593  hypothetical protein  24.17 
 
 		 476 aa  63.5  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4574  hypothetical protein  28.57 
 
 		 358 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.134631 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4747  hypothetical protein  33.98 
 
 		 487 aa  58.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01772  hypothetical protein  26.67 
 
 		 442 aa  57  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.454303  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0021  hypothetical protein  28.47 
 
 		 401 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.170066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2044  hypothetical protein  26.09 
 
 		 410 aa  54.7  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.122216  normal  0.245811 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0041  hypothetical protein  27.88 
 
 		 401 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0602392  normal  0.0628482 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5840  hypothetical protein  26.54 
 
 		 413 aa  53.1  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.5584 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4763  hypothetical protein  24.62 
 
 		 413 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.896269  normal  0.204861 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2868  hypothetical protein  27.92 
 
 		 392 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.285945  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3587  hypothetical protein  27.05 
 
 		 414 aa  49.3  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0020  hypothetical protein  34.94 
 
 		 399 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.117767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2635  hypothetical protein  26.47 
 
 		 392 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0074  hypothetical protein  34.94 
 
 		 406 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.667411 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3998  hypothetical protein  25.81 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.348755 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4552  hypothetical protein  29.09 
 
 		 411 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0632047 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4087  hypothetical protein  28.18 
 
 		 420 aa  43.5  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>