86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5980 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5980  hypothetical protein  100 
 
 		 470 aa  972    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335989  normal  0.514898 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4704  hypothetical protein  67.72 
 
 		 473 aa  675    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0115102 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2216  hypothetical protein  90.85 
 
 		 470 aa  886    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.952755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0864  hypothetical protein  60.22 
 
 		 498 aa  589  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5403  hypothetical protein  58.8 
 
 		 470 aa  578  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2465  hypothetical protein  58.3 
 
 		 470 aa  567  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1408  hypothetical protein  41.85 
 
 		 464 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1504  hypothetical protein  42.96 
 
 		 462 aa  365  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.215631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7522  hypothetical protein  44.69 
 
 		 466 aa  368  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.523269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1437  hypothetical protein  41.85 
 
 		 464 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.768827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1145  hypothetical protein  41.28 
 
 		 465 aa  365  1e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1207  hypothetical protein  42.49 
 
 		 474 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.587699  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2396  hypothetical protein  41.59 
 
 		 471 aa  353  4e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.944145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0653  hypothetical protein  44.25 
 
 		 471 aa  351  1e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2987  hypothetical protein  41.48 
 
 		 471 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000011145  hitchhiker  0.00753945 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2140  hypothetical protein  43.57 
 
 		 470 aa  336  7e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2955  hypothetical protein  38.57 
 
 		 510 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000276818  hitchhiker  0.00175827 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6353  hypothetical protein  39.69 
 
 		 484 aa  315  9e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.385812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6605  hypothetical protein  41.7 
 
 		 470 aa  305  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1503  hypothetical protein  41.97 
 
 		 503 aa  300  5e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227596 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1503  Protein of unknown function DUF2252  43.1 
 
 		 464 aa  299  8e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.935426  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4747  hypothetical protein  39.91 
 
 		 487 aa  294  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0473  hypothetical protein  39.45 
 
 		 473 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2365  Protein of unknown function DUF2252  37.42 
 
 		 458 aa  290  4e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398569  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0473  Protein of unknown function DUF2252  38.11 
 
 		 462 aa  285  1.0000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3161  hypothetical protein  38.72 
 
 		 437 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0158  hypothetical protein  34.55 
 
 		 477 aa  278  2e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.94727  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1593  hypothetical protein  35.68 
 
 		 476 aa  276  4e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2326  hypothetical protein  37.79 
 
 		 474 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00587073  hitchhiker  0.0000416917 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2520  hypothetical protein  36.77 
 
 		 493 aa  273  5.000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0184081 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0568  hypothetical protein  34.34 
 
 		 468 aa  267  2.9999999999999995e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1587  hypothetical protein  38.38 
 
 		 461 aa  260  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2396  hypothetical protein  38.41 
 
 		 495 aa  258  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.167793 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1130  hypothetical protein  37.55 
 
 		 494 aa  253  7e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1242  hypothetical protein  37.34 
 
 		 494 aa  252  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.36599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4442  hypothetical protein  35 
 
 		 479 aa  246  8e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1537  hypothetical protein  30.54 
 
 		 465 aa  230  4e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02588  conserved hypothetical protein  27.7 
 
 		 448 aa  120  6e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1648  hypothetical protein  28.64 
 
 		 437 aa  120  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.324068  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1916  hypothetical protein  27.66 
 
 		 480 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.382206 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1384  hypothetical protein  27.55 
 
 		 438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.978626  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1368  hypothetical protein  27.31 
 
 		 438 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1350  hypothetical protein  27.31 
 
 		 442 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.060115  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2341  hypothetical protein  27.67 
 
 		 444 aa  107  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000268257  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2087  hypothetical protein  28.11 
 
 		 432 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.642554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1180  hypothetical protein  27.08 
 
 		 469 aa  101  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4080  hypothetical protein  28.92 
 
 		 404 aa  100  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4516  hypothetical protein  24.6 
 
 		 486 aa  98.6  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4820  Protein of unknown function DUF2252  26.3 
 
 		 447 aa  98.2  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.923578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2085  hypothetical protein  27.25 
 
 		 407 aa  97.8  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5889  hypothetical protein  28.12 
 
 		 404 aa  97.1  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0931  Protein of unknown function DUF2252  25 
 
 		 462 aa  96.7  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5970  hypothetical protein  25.29 
 
 		 436 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.323905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2606  hypothetical protein  25.28 
 
 		 448 aa  94.4  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.045879  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3585  hypothetical protein  22.87 
 
 		 492 aa  94  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2529  hypothetical protein  22.87 
 
 		 492 aa  94  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.301158  normal  0.321166 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0828  hypothetical protein  23.24 
 
 		 451 aa  86.7  9e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.182341  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1459  hypothetical protein  31.51 
 
 		 413 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6450  hypothetical protein  62.5 
 
 		 176 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.201741 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3960  hypothetical protein  27.58 
 
 		 399 aa  85.1  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.146173  normal  0.0157887 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3637  hypothetical protein  27.76 
 
 		 407 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1341  hypothetical protein  29.39 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.101093 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3367  hypothetical protein  44.12 
 
 		 391 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000329011  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3805  hypothetical protein  38.74 
 
 		 138 aa  77.8  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.702256  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4869  Protein of unknown function DUF2252  34.17 
 
 		 485 aa  73.2  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1406  hypothetical protein  28.8 
 
 		 408 aa  73.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.926489  normal  0.0309709 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0769  hypothetical protein  35.29 
 
 		 503 aa  61.6  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.598571  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2044  hypothetical protein  26.46 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.122216  normal  0.245811 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4763  hypothetical protein  24.68 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.896269  normal  0.204861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5840  hypothetical protein  26.2 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.5584 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01772  hypothetical protein  23.5 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.454303  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5266  hypothetical protein  37.89 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.164397  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3998  hypothetical protein  24.49 
 
 		 413 aa  54.7  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.348755 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2373  hypothetical protein  36.46 
 
 		 348 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.424194  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2868  hypothetical protein  26.88 
 
 		 392 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.285945  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3587  hypothetical protein  25.33 
 
 		 414 aa  51.6  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2635  hypothetical protein  26.82 
 
 		 392 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5051  hypothetical protein  34.48 
 
 		 357 aa  50.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684708  normal  0.0897321 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1863  hypothetical protein  33.68 
 
 		 406 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.165766 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4311  hypothetical protein  33.33 
 
 		 358 aa  50.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.517108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4574  hypothetical protein  32.99 
 
 		 358 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.134631 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2675  hypothetical protein  33.67 
 
 		 350 aa  50.1  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3330  hypothetical protein  33.05 
 
 		 364 aa  47  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0308165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4552  hypothetical protein  33.98 
 
 		 411 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0632047 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4087  hypothetical protein  33.98 
 
 		 420 aa  44.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0074  hypothetical protein  32.61 
 
 		 406 aa  43.1  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.667411 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>