88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2087 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2087  hypothetical protein  100 
 
 
432 aa  875    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.642554  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5970  hypothetical protein  68.69 
 
 
436 aa  593  1e-168  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.323905  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1648  hypothetical protein  61.36 
 
 
437 aa  519  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.324068  normal  0.118221 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02588  conserved hypothetical protein  56.42 
 
 
448 aa  486  1e-136  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1384  hypothetical protein  54.02 
 
 
438 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.978626  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1368  hypothetical protein  54.48 
 
 
438 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1350  hypothetical protein  54.48 
 
 
442 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.060115  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2341  hypothetical protein  48.96 
 
 
444 aa  425  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000268257  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4820  Protein of unknown function DUF2252  50.94 
 
 
447 aa  423  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.923578  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0931  Protein of unknown function DUF2252  49.07 
 
 
462 aa  395  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2606  hypothetical protein  47.22 
 
 
448 aa  391  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.045879  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1916  hypothetical protein  29.68 
 
 
480 aa  196  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.382206 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1180  hypothetical protein  31.68 
 
 
469 aa  187  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115091  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0828  hypothetical protein  29.47 
 
 
451 aa  183  5.0000000000000004e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.182341  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3585  hypothetical protein  28.64 
 
 
492 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2529  hypothetical protein  28.64 
 
 
492 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.301158  normal  0.321166 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4869  Protein of unknown function DUF2252  33 
 
 
485 aa  161  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2136  hypothetical protein  27.71 
 
 
438 aa  147  3e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.698891 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4516  hypothetical protein  27.29 
 
 
486 aa  136  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3367  hypothetical protein  29.45 
 
 
391 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000329011  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1145  hypothetical protein  25.39 
 
 
465 aa  122  8e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1130  hypothetical protein  29.02 
 
 
494 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1242  hypothetical protein  29.02 
 
 
494 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.36599  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0769  hypothetical protein  26.63 
 
 
503 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.598571  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2085  hypothetical protein  28.94 
 
 
407 aa  120  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2396  hypothetical protein  28.71 
 
 
495 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.167793 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3161  hypothetical protein  27.31 
 
 
437 aa  117  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4442  hypothetical protein  28.67 
 
 
479 aa  114  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0864  hypothetical protein  28.11 
 
 
498 aa  113  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134206  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4704  hypothetical protein  26.94 
 
 
473 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0115102 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1587  hypothetical protein  29.58 
 
 
461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5889  hypothetical protein  27.8 
 
 
404 aa  111  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2987  hypothetical protein  28.17 
 
 
471 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000011145  hitchhiker  0.00753945 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5403  hypothetical protein  26.94 
 
 
470 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0473  hypothetical protein  27.36 
 
 
473 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172011  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1593  hypothetical protein  25.7 
 
 
476 aa  107  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1437  hypothetical protein  25.75 
 
 
464 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.768827  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1408  hypothetical protein  25.75 
 
 
464 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2465  hypothetical protein  26.62 
 
 
470 aa  106  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2326  hypothetical protein  26.19 
 
 
474 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00587073  hitchhiker  0.0000416917 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0653  hypothetical protein  26.59 
 
 
471 aa  105  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7522  hypothetical protein  26.49 
 
 
466 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.523269  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4080  hypothetical protein  26.03 
 
 
404 aa  103  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2396  hypothetical protein  26.83 
 
 
471 aa  103  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.944145  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0473  Protein of unknown function DUF2252  25.11 
 
 
462 aa  102  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0568  hypothetical protein  24.73 
 
 
468 aa  102  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5980  hypothetical protein  28.11 
 
 
470 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335989  normal  0.514898 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0158  hypothetical protein  26.36 
 
 
477 aa  100  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.94727  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1503  hypothetical protein  26.27 
 
 
503 aa  100  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227596 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2520  hypothetical protein  29.32 
 
 
493 aa  99.8  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0184081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6605  hypothetical protein  26.9 
 
 
470 aa  99.8  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3637  hypothetical protein  29.14 
 
 
407 aa  99.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2216  hypothetical protein  26.07 
 
 
470 aa  99  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.952755  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1207  hypothetical protein  27.1 
 
 
474 aa  97.4  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.587699  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6353  hypothetical protein  24.65 
 
 
484 aa  96.7  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.385812 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3960  hypothetical protein  27.58 
 
 
399 aa  94  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.146173  normal  0.0157887 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2365  Protein of unknown function DUF2252  28.81 
 
 
458 aa  93.2  8e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398569  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1504  hypothetical protein  25.17 
 
 
462 aa  92.8  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.215631  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1503  Protein of unknown function DUF2252  25.52 
 
 
464 aa  88.2  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.935426  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1341  hypothetical protein  30.74 
 
 
415 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.101093 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2140  hypothetical protein  24.83 
 
 
470 aa  82.4  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1459  hypothetical protein  30.99 
 
 
413 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1537  hypothetical protein  24.85 
 
 
465 aa  80.1  0.00000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1406  hypothetical protein  30.45 
 
 
408 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.926489  normal  0.0309709 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4747  hypothetical protein  40.91 
 
 
487 aa  77.8  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01772  hypothetical protein  37.31 
 
 
442 aa  75.9  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.454303  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2955  hypothetical protein  40 
 
 
510 aa  70.9  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000276818  hitchhiker  0.00175827 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4763  hypothetical protein  25.15 
 
 
413 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.896269  normal  0.204861 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4574  hypothetical protein  34.84 
 
 
358 aa  66.6  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.134631 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3330  hypothetical protein  40.38 
 
 
364 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0308165  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2373  hypothetical protein  36.84 
 
 
348 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.424194  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3998  hypothetical protein  24.8 
 
 
413 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.348755 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4311  hypothetical protein  34.84 
 
 
358 aa  63.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.517108  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5266  hypothetical protein  39.78 
 
 
369 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.164397  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5051  hypothetical protein  32.67 
 
 
357 aa  59.7  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684708  normal  0.0897321 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1863  hypothetical protein  28.35 
 
 
406 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.165766 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2635  hypothetical protein  32 
 
 
392 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355805  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2868  hypothetical protein  32 
 
 
392 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.285945  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0074  hypothetical protein  32.26 
 
 
406 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.667411 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2044  hypothetical protein  24.91 
 
 
410 aa  56.2  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.122216  normal  0.245811 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4552  hypothetical protein  31.5 
 
 
411 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0632047 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5840  hypothetical protein  29.82 
 
 
413 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.5584 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3587  hypothetical protein  27.91 
 
 
414 aa  55.1  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2675  hypothetical protein  50 
 
 
350 aa  54.3  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4087  hypothetical protein  28.69 
 
 
420 aa  53.5  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0041  hypothetical protein  26.63 
 
 
401 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0602392  normal  0.0628482 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0021  hypothetical protein  29.41 
 
 
401 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.170066  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0020  hypothetical protein  29.41 
 
 
399 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.117767  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>