86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3960 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3960  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  816    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.146173  normal  0.0157887 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3637  hypothetical protein  71.65 
 
 		 407 aa  550  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1459  hypothetical protein  54.41 
 
 		 413 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1406  hypothetical protein  55.31 
 
 		 408 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.926489  normal  0.0309709 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1341  hypothetical protein  54.46 
 
 		 415 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.101093 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4080  hypothetical protein  40.46 
 
 		 404 aa  290  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5889  hypothetical protein  41.73 
 
 		 404 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2085  hypothetical protein  41.22 
 
 		 407 aa  287  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3367  hypothetical protein  39.38 
 
 		 391 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000329011  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1916  hypothetical protein  26.5 
 
 		 480 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.382206 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4820  Protein of unknown function DUF2252  26.65 
 
 		 447 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.923578  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02588  conserved hypothetical protein  27.48 
 
 		 448 aa  117  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5970  hypothetical protein  26.97 
 
 		 436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.323905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2341  hypothetical protein  26.78 
 
 		 444 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000268257  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1648  hypothetical protein  26.45 
 
 		 437 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.324068  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1384  hypothetical protein  27.27 
 
 		 438 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.978626  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3585  hypothetical protein  28.7 
 
 		 492 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2529  hypothetical protein  28.7 
 
 		 492 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.301158  normal  0.321166 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1368  hypothetical protein  26.99 
 
 		 438 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1350  hypothetical protein  26.99 
 
 		 442 aa  99.8  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.060115  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1587  hypothetical protein  27.71 
 
 		 461 aa  99.4  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2087  hypothetical protein  26.87 
 
 		 432 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.642554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2396  hypothetical protein  27.24 
 
 		 495 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.167793 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1242  hypothetical protein  26.69 
 
 		 494 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.36599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3161  hypothetical protein  23.87 
 
 		 437 aa  95.1  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1130  hypothetical protein  26.69 
 
 		 494 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2606  hypothetical protein  25.94 
 
 		 448 aa  93.2  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.045879  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2216  hypothetical protein  27.6 
 
 		 470 aa  90.5  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.952755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1437  hypothetical protein  25 
 
 		 464 aa  90.1  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.768827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1408  hypothetical protein  25 
 
 		 464 aa  90.1  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0653  hypothetical protein  28.99 
 
 		 471 aa  89.4  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1537  hypothetical protein  24.72 
 
 		 465 aa  88.2  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2987  hypothetical protein  28.35 
 
 		 471 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000011145  hitchhiker  0.00753945 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4869  Protein of unknown function DUF2252  30.89 
 
 		 485 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5266  hypothetical protein  30.63 
 
 		 369 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.164397  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0931  Protein of unknown function DUF2252  25.64 
 
 		 462 aa  86.7  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2326  hypothetical protein  26.98 
 
 		 474 aa  86.7  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00587073  hitchhiker  0.0000416917 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5980  hypothetical protein  27.58 
 
 		 470 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335989  normal  0.514898 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4516  hypothetical protein  26.67 
 
 		 486 aa  84.3  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1180  hypothetical protein  26.18 
 
 		 469 aa  84  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0568  hypothetical protein  23.42 
 
 		 468 aa  82.8  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3330  hypothetical protein  31.53 
 
 		 364 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0308165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0473  Protein of unknown function DUF2252  25.45 
 
 		 462 aa  82  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0828  hypothetical protein  24.09 
 
 		 451 aa  81.3  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.182341  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4442  hypothetical protein  27.32 
 
 		 479 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2520  hypothetical protein  40.21 
 
 		 493 aa  80.5  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0184081 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2136  hypothetical protein  28.24 
 
 		 438 aa  78.6  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.698891 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1503  Protein of unknown function DUF2252  26.57 
 
 		 464 aa  77.8  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.935426  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5051  hypothetical protein  27.62 
 
 		 357 aa  77.8  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684708  normal  0.0897321 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0158  hypothetical protein  23.64 
 
 		 477 aa  76.6  0.0000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.94727  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6605  hypothetical protein  29.94 
 
 		 470 aa  76.3  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1207  hypothetical protein  26.32 
 
 		 474 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.587699  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2140  hypothetical protein  35.83 
 
 		 470 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1504  hypothetical protein  23.46 
 
 		 462 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.215631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5403  hypothetical protein  25 
 
 		 470 aa  74.7  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2955  hypothetical protein  34.91 
 
 		 510 aa  73.9  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000276818  hitchhiker  0.00175827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7522  hypothetical protein  25.77 
 
 		 466 aa  73.6  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.523269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2396  hypothetical protein  33.06 
 
 		 471 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.944145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2465  hypothetical protein  25.27 
 
 		 470 aa  73.6  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1593  hypothetical protein  25.75 
 
 		 476 aa  72.4  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4704  hypothetical protein  25.42 
 
 		 473 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0115102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1503  hypothetical protein  26.96 
 
 		 503 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227596 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6353  hypothetical protein  24.14 
 
 		 484 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.385812 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1145  hypothetical protein  24.66 
 
 		 465 aa  72  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0769  hypothetical protein  23.64 
 
 		 503 aa  68.6  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.598571  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2373  hypothetical protein  24.02 
 
 		 348 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.424194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4311  hypothetical protein  27.71 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.517108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0864  hypothetical protein  24.4 
 
 		 498 aa  63.9  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2365  Protein of unknown function DUF2252  28.57 
 
 		 458 aa  63.2  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398569  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4574  hypothetical protein  33.33 
 
 		 358 aa  60.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.134631 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01772  hypothetical protein  26.02 
 
 		 442 aa  59.7  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.454303  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0473  hypothetical protein  22.71 
 
 		 473 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2675  hypothetical protein  34.44 
 
 		 350 aa  57  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2635  hypothetical protein  22.09 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0041  hypothetical protein  27.09 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0602392  normal  0.0628482 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0021  hypothetical protein  27.31 
 
 		 401 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.170066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1863  hypothetical protein  32.65 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.165766 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2868  hypothetical protein  23.29 
 
 		 392 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.285945  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4747  hypothetical protein  33.71 
 
 		 487 aa  54.3  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0020  hypothetical protein  26.8 
 
 		 399 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.117767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3587  hypothetical protein  23.71 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3998  hypothetical protein  24.17 
 
 		 413 aa  47.4  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.348755 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4087  hypothetical protein  25.2 
 
 		 420 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4763  hypothetical protein  26.47 
 
 		 413 aa  44.3  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.896269  normal  0.204861 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0074  hypothetical protein  28.57 
 
 		 406 aa  43.1  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.667411 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2044  hypothetical protein  27.47 
 
 		 410 aa  43.1  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.122216  normal  0.245811 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>