80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2868 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2868  hypothetical protein  100 
 
 		 392 aa  810    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.285945  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2635  hypothetical protein  93.11 
 
 		 392 aa  733    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5840  hypothetical protein  60.35 
 
 		 413 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.5584 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2044  hypothetical protein  60.35 
 
 		 410 aa  496  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.122216  normal  0.245811 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3587  hypothetical protein  59.9 
 
 		 414 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0021  hypothetical protein  54.64 
 
 		 401 aa  432  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.170066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0041  hypothetical protein  55.87 
 
 		 401 aa  429  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0602392  normal  0.0628482 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0074  hypothetical protein  55.87 
 
 		 406 aa  427  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.667411 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0020  hypothetical protein  55.3 
 
 		 399 aa  424  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.117767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3998  hypothetical protein  53.12 
 
 		 413 aa  418  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.348755 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4763  hypothetical protein  50.88 
 
 		 413 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.896269  normal  0.204861 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4087  hypothetical protein  50.13 
 
 		 420 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4552  hypothetical protein  49.37 
 
 		 411 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0632047 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1863  hypothetical protein  45.73 
 
 		 406 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.165766 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3367  hypothetical protein  27.45 
 
 		 391 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000329011  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1703  hypothetical protein  53.25 
 
 		 79 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.27794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2085  hypothetical protein  26.69 
 
 		 407 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1130  hypothetical protein  25.4 
 
 		 494 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02588  conserved hypothetical protein  26.1 
 
 		 448 aa  70.9  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5889  hypothetical protein  25.74 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1242  hypothetical protein  25.4 
 
 		 494 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.36599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1916  hypothetical protein  21.25 
 
 		 480 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.382206 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1587  hypothetical protein  25.61 
 
 		 461 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0828  hypothetical protein  24.59 
 
 		 451 aa  66.6  0.0000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.182341  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2396  hypothetical protein  27.03 
 
 		 495 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.167793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4516  hypothetical protein  23.51 
 
 		 486 aa  63.2  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4080  hypothetical protein  25.72 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1368  hypothetical protein  24.58 
 
 		 438 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1350  hypothetical protein  24.58 
 
 		 442 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.060115  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4820  Protein of unknown function DUF2252  24.86 
 
 		 447 aa  62  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.923578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1384  hypothetical protein  23.73 
 
 		 438 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.978626  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1648  hypothetical protein  36.36 
 
 		 437 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.324068  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2465  hypothetical protein  25.86 
 
 		 470 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2396  hypothetical protein  25 
 
 		 471 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.944145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5980  hypothetical protein  26.88 
 
 		 470 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335989  normal  0.514898 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2216  hypothetical protein  25.94 
 
 		 470 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.952755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0931  Protein of unknown function DUF2252  24.56 
 
 		 462 aa  58.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2087  hypothetical protein  32 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.642554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1207  hypothetical protein  25.97 
 
 		 474 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.587699  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3637  hypothetical protein  26.47 
 
 		 407 aa  57  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1504  hypothetical protein  20.55 
 
 		 462 aa  56.6  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.215631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0653  hypothetical protein  24.14 
 
 		 471 aa  56.2  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2606  hypothetical protein  31.58 
 
 		 448 aa  56.2  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.045879  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3585  hypothetical protein  25 
 
 		 492 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2529  hypothetical protein  25 
 
 		 492 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.301158  normal  0.321166 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5970  hypothetical protein  23.68 
 
 		 436 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.323905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0473  Protein of unknown function DUF2252  24.68 
 
 		 462 aa  54.7  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2341  hypothetical protein  23.88 
 
 		 444 aa  54.7  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000268257  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1180  hypothetical protein  24.06 
 
 		 469 aa  54.3  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1593  hypothetical protein  23.62 
 
 		 476 aa  53.9  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1341  hypothetical protein  27.01 
 
 		 415 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.101093 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3960  hypothetical protein  22.88 
 
 		 399 aa  52.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.146173  normal  0.0157887 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1459  hypothetical protein  28.4 
 
 		 413 aa  52.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0156  hypothetical protein  54.35 
 
 		 73 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4869  Protein of unknown function DUF2252  28.24 
 
 		 485 aa  50.8  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3330  hypothetical protein  32.48 
 
 		 364 aa  50.8  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0308165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3161  hypothetical protein  21.01 
 
 		 437 aa  50.8  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1537  hypothetical protein  34.38 
 
 		 465 aa  50.8  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1408  hypothetical protein  23.38 
 
 		 464 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1437  hypothetical protein  23.38 
 
 		 464 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.768827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0158  hypothetical protein  23.54 
 
 		 477 aa  49.7  0.00009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.94727  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2987  hypothetical protein  30.33 
 
 		 471 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000011145  hitchhiker  0.00753945 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2520  hypothetical protein  32.04 
 
 		 493 aa  49.3  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0184081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7522  hypothetical protein  35.35 
 
 		 466 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.523269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4311  hypothetical protein  35.45 
 
 		 358 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.517108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1503  Protein of unknown function DUF2252  23.47 
 
 		 464 aa  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.935426  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5403  hypothetical protein  25.78 
 
 		 470 aa  47.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4574  hypothetical protein  34.55 
 
 		 358 aa  47  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.134631 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2140  hypothetical protein  31.63 
 
 		 470 aa  47  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1145  hypothetical protein  28.28 
 
 		 465 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0769  hypothetical protein  22.81 
 
 		 503 aa  46.2  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.598571  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0473  hypothetical protein  24.87 
 
 		 473 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5266  hypothetical protein  29.63 
 
 		 369 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.164397  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2675  hypothetical protein  29.41 
 
 		 350 aa  45.8  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0568  hypothetical protein  30.3 
 
 		 468 aa  44.7  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6605  hypothetical protein  24.35 
 
 		 470 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5051  hypothetical protein  33.66 
 
 		 357 aa  44.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684708  normal  0.0897321 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2365  Protein of unknown function DUF2252  30.23 
 
 		 458 aa  44.3  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398569  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2326  hypothetical protein  34.65 
 
 		 474 aa  43.9  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00587073  hitchhiker  0.0000416917 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1406  hypothetical protein  23.56 
 
 		 408 aa  43.5  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.926489  normal  0.0309709 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>