16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1703 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1703  hypothetical protein  100 
 
 
79 aa  160  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.27794  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0020  hypothetical protein  65 
 
 
399 aa  87  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.117767  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0021  hypothetical protein  65 
 
 
401 aa  87  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.170066  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2044  hypothetical protein  55.41 
 
 
410 aa  86.7  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.122216  normal  0.245811 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5840  hypothetical protein  55.41 
 
 
413 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.5584 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0074  hypothetical protein  58.82 
 
 
406 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.667411 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2868  hypothetical protein  53.25 
 
 
392 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.285945  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0041  hypothetical protein  63.33 
 
 
401 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0602392  normal  0.0628482 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2635  hypothetical protein  51.95 
 
 
392 aa  84  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355805  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4763  hypothetical protein  59.42 
 
 
413 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.896269  normal  0.204861 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3587  hypothetical protein  52.11 
 
 
414 aa  82  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4552  hypothetical protein  52.38 
 
 
411 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0632047 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3998  hypothetical protein  47.83 
 
 
413 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.348755 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4087  hypothetical protein  47.83 
 
 
420 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1863  hypothetical protein  46.67 
 
 
406 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.165766 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0156  hypothetical protein  57.14 
 
 
73 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>