80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0600 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0600  FlgA, flagellar basal-body P-ring formation protein  100 
 
 		 162 aa  317  5e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0622  FlgA, flagellar basal-body P-ring formation protein  91.46 
 
 		 164 aa  287  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.191359  normal  0.0984024 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0633  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  90.85 
 
 		 164 aa  286  7e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.683972  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3677  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  77.17 
 
 		 176 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550365 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1688  FlgA, flagellar basal-body P-ring formation protein  50 
 
 		 142 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163534  normal  0.0178 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3652  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  47.33 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.265024  normal  0.613737 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0028  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  44.53 
 
 		 148 aa  114  6e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4208  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  42.74 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0155  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  41.94 
 
 		 160 aa  103  8e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1098  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  37.18 
 
 		 161 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.368798 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0139  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  41.13 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.126341  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0259  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  37.87 
 
 		 169 aa  90.5  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1140  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  36.59 
 
 		 152 aa  87.4  7e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0294  flagellar protein FlgA  34.35 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0321  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.55 
 
 		 160 aa  83.6  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.827086 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0353  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.55 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0779084 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0741  flagellar protein FLGA precursor  36.8 
 
 		 159 aa  77  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2560  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.69 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443953 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0923  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  29.06 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1948  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.92 
 
 		 314 aa  53.1  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.68378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0262  lateral flagellar P-ring addition protein LfgA  26.73 
 
 		 245 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0595  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  37.78 
 
 		 326 aa  52.4  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4196  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  29.82 
 
 		 347 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2683  flageller protein FlgA  33.33 
 
 		 235 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2959  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.23 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.569087  normal  0.151047 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4419  SAF domain-containing protein  31.18 
 
 		 259 aa  51.6  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3372  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  29.87 
 
 		 245 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2216  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like  29.84 
 
 		 243 aa  50.8  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1342  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.56 
 
 		 235 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.127049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01015  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.7 
 
 		 214 aa  48.5  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0919764  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1505  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.33 
 
 		 370 aa  48.5  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.563767 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06151  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.7 
 
 		 214 aa  48.5  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000222326  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0523  SAF domain-containing protein  34.48 
 
 		 262 aa  47.4  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1430  flagellar basal body P-ring formation protein FlgA  29.76 
 
 		 247 aa  47  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0228  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.33 
 
 		 282 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.531559 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3487  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.19 
 
 		 252 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0718  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.33 
 
 		 272 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0638  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.33 
 
 		 272 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0205  SAF domain-containing protein  26.79 
 
 		 281 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620643 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1251  SAF domain-containing protein  28.57 
 
 		 280 aa  45.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.792381  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1926  flagellar protein, putative  26.19 
 
 		 248 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210434  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1204  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  28.32 
 
 		 286 aa  45.8  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1594  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.64 
 
 		 235 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1997  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.16 
 
 		 254 aa  45.1  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2325  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.16 
 
 		 232 aa  45.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.635455  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1270  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  36.84 
 
 		 219 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0241853 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2426  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.16 
 
 		 269 aa  45.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2606  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.85 
 
 		 139 aa  45.1  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.690909  hitchhiker  0.000478924 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1326  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  24.22 
 
 		 235 aa  44.7  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2965  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25 
 
 		 235 aa  44.7  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.639269  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1256  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  24.22 
 
 		 235 aa  44.7  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3558  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  23.86 
 
 		 234 aa  44.3  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0076  SAF domain-containing protein  30.86 
 
 		 254 aa  44.3  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2950  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25 
 
 		 235 aa  43.9  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.892014  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1413  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25 
 
 		 235 aa  43.9  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4711  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  28.57 
 
 		 343 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0269631  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3090  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  24.79 
 
 		 259 aa  43.9  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3103  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25 
 
 		 235 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.864983 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0940  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  24.14 
 
 		 233 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2844  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.33 
 
 		 360 aa  43.9  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1318  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  22.66 
 
 		 235 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.212104 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3253  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  23.44 
 
 		 235 aa  43.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0970  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  24.14 
 
 		 233 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1325  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.71 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3972  SAF domain-containing protein  26.61 
 
 		 245 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2199  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.53 
 
 		 219 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112928 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1241  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.53 
 
 		 219 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.684745  normal  0.229528 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1285  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.53 
 
 		 219 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115713  normal  0.0340077 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2015  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.06 
 
 		 219 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2986  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.71 
 
 		 139 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3099  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  30.86 
 
 		 236 aa  42.4  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3270  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  29.76 
 
 		 348 aa  42.4  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.132076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1214  Flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  34.25 
 
 		 262 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.974456  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3469  SAF domain-containing protein  25.81 
 
 		 245 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0070  SAF domain-containing protein  28.4 
 
 		 248 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3046  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  29.76 
 
 		 348 aa  41.6  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1524  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  28.26 
 
 		 234 aa  41.2  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2341  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.77 
 
 		 248 aa  40.4  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4424  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.86 
 
 		 342 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2600  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  22.66 
 
 		 235 aa  40.4  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>