32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0322 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0322  putative transmembrane protein  100 
 
 		 176 aa  351  4e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.324639  normal  0.0201256 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0295  hypothetical protein  33.92 
 
 		 194 aa  98.6  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1029  putative transmembrane protein  37.85 
 
 		 187 aa  95.9  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0235  hypothetical protein  31.87 
 
 		 173 aa  88.2  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.636645 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0293  hypothetical protein  34.83 
 
 		 187 aa  84.7  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000858035 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0288  hypothetical protein  34.83 
 
 		 187 aa  84.7  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.641057  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0351  hypothetical protein  38.15 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000357166 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0406  hypothetical protein  30.86 
 
 		 205 aa  73.9  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0229  hypothetical protein  30.77 
 
 		 202 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.329962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4900  hypothetical protein  32.7 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4193  hypothetical protein  28.65 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6211  hypothetical protein  31.35 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2786  hypothetical protein  31.52 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2924  hypothetical protein  30.43 
 
 		 190 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.25765  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2880  hypothetical protein  30.96 
 
 		 190 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2869  hypothetical protein  30.96 
 
 		 200 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0108848  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2255  hypothetical protein  30.96 
 
 		 200 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37161  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0192  putative transmembrane protein  31.78 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0335  putative transmembrane protein  30.77 
 
 		 189 aa  51.2  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0198  putative transmembrane protein  33.33 
 
 		 179 aa  50.8  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.751895  hitchhiker  0.00509427 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0403  hypothetical protein  28.74 
 
 		 237 aa  50.1  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0460  putative lipoprotein  29.41 
 
 		 269 aa  48.5  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3224  hypothetical protein  28.88 
 
 		 250 aa  47.8  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2820  hypothetical protein  29.41 
 
 		 269 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0480  putative lipoprotein  29.41 
 
 		 269 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1394  hypothetical protein  29.41 
 
 		 269 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0199  hypothetical protein  29.41 
 
 		 269 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0235  hypothetical protein  27.38 
 
 		 229 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.980002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0644  hypothetical protein  29.57 
 
 		 301 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0434  hypothetical protein  27.04 
 
 		 191 aa  45.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0286  putative transmembrane protein  25.24 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1960  hypothetical protein  31.15 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>