31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2255 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_2255  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37161  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2869  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0108848  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2880  hypothetical protein  98.42 
 
 
190 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6211  hypothetical protein  93.68 
 
 
190 aa  360  5.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2924  hypothetical protein  91.05 
 
 
190 aa  354  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.25765  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2786  hypothetical protein  91.05 
 
 
190 aa  352  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0434  hypothetical protein  87.96 
 
 
191 aa  307  5e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0403  hypothetical protein  64.94 
 
 
237 aa  225  4e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3224  hypothetical protein  64.25 
 
 
250 aa  222  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2820  hypothetical protein  64.25 
 
 
269 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0480  putative lipoprotein  64.25 
 
 
269 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0460  putative lipoprotein  61.9 
 
 
269 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1394  hypothetical protein  64.25 
 
 
269 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0199  hypothetical protein  64.25 
 
 
269 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0644  hypothetical protein  64.25 
 
 
301 aa  221  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4193  hypothetical protein  55.17 
 
 
202 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0229  hypothetical protein  53.01 
 
 
202 aa  176  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.329962  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0522  hypothetical protein  55.7 
 
 
149 aa  169  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0565289  normal  0.869934 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0198  putative transmembrane protein  50 
 
 
179 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.751895  hitchhiker  0.00509427 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0192  putative transmembrane protein  50 
 
 
189 aa  145  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0335  putative transmembrane protein  46.33 
 
 
189 aa  132  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0286  putative transmembrane protein  40 
 
 
198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0235  hypothetical protein  40.48 
 
 
229 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.980002  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0293  hypothetical protein  32.74 
 
 
187 aa  61.6  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000858035 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0288  hypothetical protein  32.74 
 
 
187 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.641057  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0235  hypothetical protein  31.67 
 
 
173 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.636645 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0322  putative transmembrane protein  31.52 
 
 
176 aa  58.9  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.324639  normal  0.0201256 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0351  hypothetical protein  45.45 
 
 
189 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000357166 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0295  hypothetical protein  29.14 
 
 
194 aa  47.4  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1960  hypothetical protein  25.93 
 
 
193 aa  44.7  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1667  hypothetical protein  28.75 
 
 
87 aa  42.7  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.659404 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>