31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0288 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0288  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  361  4e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.641057  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0293  hypothetical protein  98.93 
 
 		 187 aa  357  4e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000858035 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0351  hypothetical protein  53.19 
 
 		 189 aa  151  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000357166 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0406  hypothetical protein  44 
 
 		 205 aa  136  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0235  hypothetical protein  43.18 
 
 		 173 aa  114  6.9999999999999995e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.636645 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4900  hypothetical protein  42.24 
 
 		 180 aa  99.8  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0295  hypothetical protein  41.71 
 
 		 194 aa  99  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0322  putative transmembrane protein  34.83 
 
 		 176 aa  84.7  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.324639  normal  0.0201256 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6211  hypothetical protein  32.53 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4193  hypothetical protein  31.4 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2786  hypothetical protein  31.74 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2924  hypothetical protein  31.14 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.25765  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2869  hypothetical protein  43.94 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0108848  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2255  hypothetical protein  43.94 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37161  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2880  hypothetical protein  42.42 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0229  hypothetical protein  29.09 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.329962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0403  hypothetical protein  27.84 
 
 		 237 aa  52.8  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1029  putative transmembrane protein  29.34 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0335  putative transmembrane protein  37.97 
 
 		 189 aa  50.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3224  hypothetical protein  27.92 
 
 		 250 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0434  hypothetical protein  29.81 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1960  hypothetical protein  26.21 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2820  hypothetical protein  27.92 
 
 		 269 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0480  putative lipoprotein  28.89 
 
 		 269 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0460  putative lipoprotein  28.89 
 
 		 269 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1394  hypothetical protein  27.92 
 
 		 269 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0199  hypothetical protein  27.92 
 
 		 269 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0644  hypothetical protein  27.92 
 
 		 301 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0198  putative transmembrane protein  36.51 
 
 		 179 aa  48.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.751895  hitchhiker  0.00509427 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0286  putative transmembrane protein  31.16 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0192  putative transmembrane protein  33.33 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>