15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1029 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1029  putative transmembrane protein  100 
 
 		 187 aa  375  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0322  putative transmembrane protein  37.85 
 
 		 176 aa  95.9  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.324639  normal  0.0201256 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0235  hypothetical protein  35.81 
 
 		 173 aa  93.2  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.636645 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0295  hypothetical protein  32.12 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4900  hypothetical protein  31.08 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0288  hypothetical protein  29.34 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.641057  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0293  hypothetical protein  28.31 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000858035 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0406  hypothetical protein  26.29 
 
 		 205 aa  48.5  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0229  hypothetical protein  26.06 
 
 		 202 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.329962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1960  hypothetical protein  45.24 
 
 		 193 aa  43.9  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0351  hypothetical protein  38.6 
 
 		 189 aa  42.4  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000357166 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6211  hypothetical protein  27.74 
 
 		 190 aa  42  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2924  hypothetical protein  27.49 
 
 		 190 aa  41.6  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.25765  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4193  hypothetical protein  27.53 
 
 		 202 aa  41.6  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0192  putative transmembrane protein  28.83 
 
 		 189 aa  40.8  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>