34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0229 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0229  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.329962  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4193  hypothetical protein  68.54 
 
 
202 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0522  hypothetical protein  72.48 
 
 
149 aa  227  9e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0565289  normal  0.869934 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2786  hypothetical protein  51.37 
 
 
190 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6211  hypothetical protein  51.91 
 
 
190 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3224  hypothetical protein  50.54 
 
 
250 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2820  hypothetical protein  50.54 
 
 
269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0480  putative lipoprotein  50.54 
 
 
269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1394  hypothetical protein  50.54 
 
 
269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0199  hypothetical protein  50.54 
 
 
269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0644  hypothetical protein  50.54 
 
 
301 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0434  hypothetical protein  51.87 
 
 
191 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0460  putative lipoprotein  50.85 
 
 
269 aa  171  9e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2880  hypothetical protein  52.46 
 
 
190 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2924  hypothetical protein  50.27 
 
 
190 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.25765  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0403  hypothetical protein  50.57 
 
 
237 aa  167  8e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2869  hypothetical protein  51.91 
 
 
200 aa  167  9e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0108848  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2255  hypothetical protein  51.91 
 
 
200 aa  167  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37161  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0192  putative transmembrane protein  40.74 
 
 
189 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0335  putative transmembrane protein  43.26 
 
 
189 aa  125  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0198  putative transmembrane protein  41.21 
 
 
179 aa  124  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.751895  hitchhiker  0.00509427 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0286  putative transmembrane protein  39.9 
 
 
198 aa  124  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0235  hypothetical protein  41.52 
 
 
229 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.980002  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0322  putative transmembrane protein  30.77 
 
 
176 aa  67.8  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.324639  normal  0.0201256 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0351  hypothetical protein  33.9 
 
 
189 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000357166 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0235  hypothetical protein  28.83 
 
 
173 aa  59.7  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.636645 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0293  hypothetical protein  29.09 
 
 
187 aa  54.3  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000858035 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0295  hypothetical protein  27.91 
 
 
194 aa  53.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0288  hypothetical protein  29.09 
 
 
187 aa  53.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.641057  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1960  hypothetical protein  28.4 
 
 
193 aa  49.7  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1667  hypothetical protein  29.63 
 
 
87 aa  49.7  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.659404 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4900  hypothetical protein  26.29 
 
 
180 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0406  hypothetical protein  29.05 
 
 
205 aa  46.2  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1029  putative transmembrane protein  26.06 
 
 
187 aa  45.8  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>