34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4193 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4193  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0522  hypothetical protein  93.29 
 
 		 149 aa  286  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0565289  normal  0.869934 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0229  hypothetical protein  68.54 
 
 		 202 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.329962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2786  hypothetical protein  55.17 
 
 		 190 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2924  hypothetical protein  54.6 
 
 		 190 aa  190  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.25765  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0460  putative lipoprotein  51.08 
 
 		 269 aa  188  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6211  hypothetical protein  54.6 
 
 		 190 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0403  hypothetical protein  54.02 
 
 		 237 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2820  hypothetical protein  51.04 
 
 		 269 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0480  putative lipoprotein  51.04 
 
 		 269 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1394  hypothetical protein  51.04 
 
 		 269 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0199  hypothetical protein  51.04 
 
 		 269 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3224  hypothetical protein  51.04 
 
 		 250 aa  187  7e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0644  hypothetical protein  51.04 
 
 		 301 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0434  hypothetical protein  57.59 
 
 		 191 aa  186  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2869  hypothetical protein  54.02 
 
 		 200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0108848  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2255  hypothetical protein  54.02 
 
 		 200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37161  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2880  hypothetical protein  53.45 
 
 		 190 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0192  putative transmembrane protein  38.86 
 
 		 189 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0198  putative transmembrane protein  39.44 
 
 		 179 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.751895  hitchhiker  0.00509427 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0335  putative transmembrane protein  40.98 
 
 		 189 aa  119  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0235  hypothetical protein  36.47 
 
 		 229 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.980002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0286  putative transmembrane protein  35.9 
 
 		 198 aa  104  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0235  hypothetical protein  31.93 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.636645 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0322  putative transmembrane protein  28.65 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.324639  normal  0.0201256 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0293  hypothetical protein  30.77 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000858035 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0288  hypothetical protein  31.4 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.641057  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0351  hypothetical protein  29.15 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000357166 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0295  hypothetical protein  27.33 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4900  hypothetical protein  38.89 
 
 		 180 aa  48.9  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1960  hypothetical protein  28.12 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0406  hypothetical protein  30.17 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1667  hypothetical protein  26.92 
 
 		 87 aa  45.4  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.659404 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1029  putative transmembrane protein  27.53 
 
 		 187 aa  41.6  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>