32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0235 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0235  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  457  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.980002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0286  putative transmembrane protein  69.57 
 
 		 198 aa  261  8.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0335  putative transmembrane protein  58.38 
 
 		 189 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0192  putative transmembrane protein  53.04 
 
 		 189 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0198  putative transmembrane protein  52.51 
 
 		 179 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.751895  hitchhiker  0.00509427 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0229  hypothetical protein  42.2 
 
 		 202 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.329962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2786  hypothetical protein  41.36 
 
 		 190 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2924  hypothetical protein  41.36 
 
 		 190 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.25765  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6211  hypothetical protein  39.79 
 
 		 190 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4193  hypothetical protein  36.78 
 
 		 202 aa  108  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2880  hypothetical protein  41.57 
 
 		 190 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2255  hypothetical protein  40.45 
 
 		 200 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37161  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2869  hypothetical protein  40.45 
 
 		 200 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0108848  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0434  hypothetical protein  40.72 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0522  hypothetical protein  34.38 
 
 		 149 aa  85.1  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0565289  normal  0.869934 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0403  hypothetical protein  35.23 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0460  putative lipoprotein  34.76 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3224  hypothetical protein  34.41 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1394  hypothetical protein  34.41 
 
 		 269 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0480  putative lipoprotein  34.41 
 
 		 269 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2820  hypothetical protein  34.41 
 
 		 269 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0199  hypothetical protein  34.41 
 
 		 269 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0644  hypothetical protein  34.41 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1960  hypothetical protein  24.44 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1667  hypothetical protein  36.62 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.659404 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0351  hypothetical protein  35.09 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000357166 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0293  hypothetical protein  29.88 
 
 		 187 aa  48.9  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000858035 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0322  putative transmembrane protein  27.65 
 
 		 176 aa  48.1  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.324639  normal  0.0201256 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0288  hypothetical protein  29.52 
 
 		 187 aa  48.1  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.641057  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0235  hypothetical protein  30.72 
 
 		 173 aa  47  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.636645 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0406  hypothetical protein  30.43 
 
 		 205 aa  45.1  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0295  hypothetical protein  27.91 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>