31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0198 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0198  putative transmembrane protein  100 
 
 		 179 aa  361  3e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.751895  hitchhiker  0.00509427 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0192  putative transmembrane protein  91.62 
 
 		 189 aa  337  8e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0335  putative transmembrane protein  79.66 
 
 		 189 aa  301  4.0000000000000003e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0286  putative transmembrane protein  57.87 
 
 		 198 aa  194  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0235  hypothetical protein  54.12 
 
 		 229 aa  185  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.980002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2924  hypothetical protein  49.72 
 
 		 190 aa  148  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.25765  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2786  hypothetical protein  50.28 
 
 		 190 aa  147  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6211  hypothetical protein  49.45 
 
 		 190 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2255  hypothetical protein  50 
 
 		 200 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37161  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2869  hypothetical protein  50 
 
 		 200 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0108848  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2880  hypothetical protein  49.45 
 
 		 190 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0434  hypothetical protein  48.81 
 
 		 191 aa  131  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0229  hypothetical protein  41.21 
 
 		 202 aa  124  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.329962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4193  hypothetical protein  39.44 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0403  hypothetical protein  38.76 
 
 		 237 aa  108  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0199  hypothetical protein  38.74 
 
 		 269 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2820  hypothetical protein  38.74 
 
 		 269 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0480  putative lipoprotein  38.74 
 
 		 269 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1394  hypothetical protein  38.74 
 
 		 269 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3224  hypothetical protein  38.74 
 
 		 250 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0644  hypothetical protein  38.74 
 
 		 301 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0460  putative lipoprotein  38.22 
 
 		 269 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0522  hypothetical protein  37.42 
 
 		 149 aa  98.6  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0565289  normal  0.869934 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1960  hypothetical protein  23.16 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1667  hypothetical protein  36.92 
 
 		 87 aa  53.9  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.659404 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0351  hypothetical protein  32.63 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000357166 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0322  putative transmembrane protein  33.33 
 
 		 176 aa  50.8  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.324639  normal  0.0201256 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0293  hypothetical protein  38.1 
 
 		 187 aa  50.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000858035 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0288  hypothetical protein  36.51 
 
 		 187 aa  48.1  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.641057  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0235  hypothetical protein  30.68 
 
 		 173 aa  42.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.636645 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0295  hypothetical protein  25.14 
 
 		 194 aa  41.6  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>