31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2880 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2880  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  380  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2255  hypothetical protein  98.42 
 
 
200 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37161  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2869  hypothetical protein  98.42 
 
 
200 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0108848  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6211  hypothetical protein  92.63 
 
 
190 aa  357  8e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2786  hypothetical protein  91.58 
 
 
190 aa  353  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2924  hypothetical protein  90.53 
 
 
190 aa  352  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.25765  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0434  hypothetical protein  87.43 
 
 
191 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0403  hypothetical protein  64.94 
 
 
237 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0460  putative lipoprotein  61.9 
 
 
269 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2820  hypothetical protein  63.69 
 
 
269 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0480  putative lipoprotein  63.69 
 
 
269 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1394  hypothetical protein  63.69 
 
 
269 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0199  hypothetical protein  63.69 
 
 
269 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3224  hypothetical protein  63.69 
 
 
250 aa  220  8e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0644  hypothetical protein  63.69 
 
 
301 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4193  hypothetical protein  55.17 
 
 
202 aa  187  9e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0229  hypothetical protein  53.55 
 
 
202 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.329962  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0522  hypothetical protein  55.7 
 
 
149 aa  169  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0565289  normal  0.869934 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0198  putative transmembrane protein  49.45 
 
 
179 aa  145  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.751895  hitchhiker  0.00509427 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0192  putative transmembrane protein  49.45 
 
 
189 aa  143  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0335  putative transmembrane protein  45.66 
 
 
189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0286  putative transmembrane protein  40 
 
 
198 aa  119  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0235  hypothetical protein  40.83 
 
 
229 aa  111  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.980002  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0293  hypothetical protein  32.14 
 
 
187 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000858035 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0351  hypothetical protein  37.4 
 
 
189 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000357166 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0235  hypothetical protein  31.67 
 
 
173 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.636645 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0288  hypothetical protein  32.14 
 
 
187 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.641057  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0322  putative transmembrane protein  32.07 
 
 
176 aa  58.9  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.324639  normal  0.0201256 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0295  hypothetical protein  29.14 
 
 
194 aa  47.4  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1667  hypothetical protein  30 
 
 
87 aa  45.4  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.659404 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1960  hypothetical protein  25.93 
 
 
193 aa  43.1  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>