29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0235 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0235  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  347  5e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.636645 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0295  hypothetical protein  69.19 
 
 		 194 aa  218  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0288  hypothetical protein  43.18 
 
 		 187 aa  114  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.641057  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0293  hypothetical protein  42.61 
 
 		 187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000858035 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1029  putative transmembrane protein  35.81 
 
 		 187 aa  93.2  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0322  putative transmembrane protein  31.87 
 
 		 176 aa  88.2  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.324639  normal  0.0201256 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0351  hypothetical protein  34.65 
 
 		 189 aa  86.7  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000357166 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0406  hypothetical protein  32.2 
 
 		 205 aa  85.9  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4900  hypothetical protein  36.65 
 
 		 180 aa  85.1  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0460  putative lipoprotein  32.43 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0644  hypothetical protein  31.89 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2820  hypothetical protein  31.89 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0480  putative lipoprotein  31.89 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1394  hypothetical protein  31.89 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0199  hypothetical protein  31.89 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3224  hypothetical protein  31.89 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4193  hypothetical protein  31.93 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0403  hypothetical protein  32.39 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2924  hypothetical protein  29.78 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.25765  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2786  hypothetical protein  29.78 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0229  hypothetical protein  28.83 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.329962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6211  hypothetical protein  29.21 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2869  hypothetical protein  29.21 
 
 		 200 aa  52  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0108848  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2255  hypothetical protein  29.21 
 
 		 200 aa  52  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.37161  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0434  hypothetical protein  31.06 
 
 		 191 aa  52  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2880  hypothetical protein  29.21 
 
 		 190 aa  51.6  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0522  hypothetical protein  29.58 
 
 		 149 aa  44.3  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0565289  normal  0.869934 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0198  putative transmembrane protein  30.68 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.751895  hitchhiker  0.00509427 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0192  putative transmembrane protein  28.57 
 
 		 189 aa  41.2  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>