17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0406 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0406  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  417  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0288  hypothetical protein  43.81 
 
 		 187 aa  142  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.641057  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0293  hypothetical protein  43.81 
 
 		 187 aa  142  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000858035 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0351  hypothetical protein  46.49 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000357166 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0235  hypothetical protein  33.51 
 
 		 173 aa  94  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.636645 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0295  hypothetical protein  32.24 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0322  putative transmembrane protein  31.64 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.324639  normal  0.0201256 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4900  hypothetical protein  30.46 
 
 		 180 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4193  hypothetical protein  28.57 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0229  hypothetical protein  30.3 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.329962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1029  putative transmembrane protein  27.23 
 
 		 187 aa  50.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6211  hypothetical protein  29.74 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2786  hypothetical protein  29.23 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0286  putative transmembrane protein  30.59 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0235  hypothetical protein  31.06 
 
 		 229 aa  45.1  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.980002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2924  hypothetical protein  28.21 
 
 		 190 aa  42.4  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.25765  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0192  putative transmembrane protein  34.72 
 
 		 189 aa  42  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>