More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0339 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
307 aa  621  1e-177  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.139022  hitchhiker  0.0000361495 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.35 
 
 
320 aa  288  6e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0035  GDP-fucose synthetase  46.08 
 
 
312 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0178713 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0060  GDP-fucose synthetase  45.93 
 
 
308 aa  286  4e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.396896  normal  0.0281476 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1700  GDP-fucose synthetase NAD dependent epimerase/dehydratase  44.44 
 
 
314 aa  280  3e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.231068  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5688  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.95 
 
 
313 aa  276  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.874346 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.7 
 
 
311 aa  272  4.0000000000000004e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0386838  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0619  GDP-fucose synthetase  45.8 
 
 
308 aa  272  6e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0438  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.95 
 
 
306 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.881493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.8 
 
 
313 aa  270  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.235303  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4219  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.42 
 
 
309 aa  270  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.946237  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1135  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.1 
 
 
324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.721722  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1091  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.41 
 
 
309 aa  269  4e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.7 
 
 
312 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2350  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.95 
 
 
312 aa  267  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2362  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.99 
 
 
313 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000746713  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0624  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.71 
 
 
308 aa  265  8e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3150  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.63 
 
 
324 aa  265  8e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.37 
 
 
321 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.757489 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.17 
 
 
323 aa  264  1e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.429243  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0627  GDP-fucose synthetase  44.55 
 
 
314 aa  263  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2842  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.03 
 
 
324 aa  261  8e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.01 
 
 
314 aa  256  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.660712  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3270  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.73 
 
 
316 aa  256  4e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1234  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.02 
 
 
310 aa  255  7e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0865  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.01 
 
 
309 aa  255  7e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.043091  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1282  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.14 
 
 
320 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3209  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.12 
 
 
347 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3442  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.77 
 
 
310 aa  251  8.000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.06 
 
 
345 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.141904 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1315  NAD dependent epimerase/dehydratase  43.59 
 
 
332 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1084  putative GDP-fucose synthetase  43.01 
 
 
316 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4753  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.7 
 
 
324 aa  251  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.6 
 
 
322 aa  251  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3862  putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  39.02 
 
 
319 aa  249  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.76 
 
 
321 aa  249  4e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11546  nucleotide-sugar epimerase epiA  37.5 
 
 
322 aa  249  4e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1775  GDP-L-fucose synthetase  41.67 
 
 
327 aa  249  6e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6238  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.4 
 
 
356 aa  249  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.435131  normal  0.526104 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4242  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.99 
 
 
311 aa  248  9e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0896711  normal  0.0692369 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0081  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.33 
 
 
321 aa  246  3e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.384606 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0411  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.67 
 
 
314 aa  246  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2900  GDP-fucose synthetase NAD dependent epimerase/dehydratase  43.31 
 
 
311 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.33 
 
 
318 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0450  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.87 
 
 
333 aa  245  6e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0947626  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0651  GDP-L-fucose synthetase  43.1 
 
 
323 aa  244  9e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.193687  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0822  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.56 
 
 
319 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2730  GDP-L-fucose synthetase  38.94 
 
 
326 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.193423 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5711  GDP-4-dehydro-6-deoxy-D-mannose epimerase /GDP-4-dehydro-6-L-deoxygalactose reductase  39.86 
 
 
316 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3252  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.64 
 
 
332 aa  242  6e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0426  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.28 
 
 
316 aa  241  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.22 
 
 
324 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.221885  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0962  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.22 
 
 
324 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1828  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.7 
 
 
306 aa  239  2.9999999999999997e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0122431 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14001  putative fucose synthetase  45.02 
 
 
322 aa  239  5e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.881279  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1147  GDP-L-fucose synthetase  38.44 
 
 
322 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.51 
 
 
324 aa  238  6.999999999999999e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.51 
 
 
325 aa  236  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.6044  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2092  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.32 
 
 
322 aa  236  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6328  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.48 
 
 
305 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2470  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.11 
 
 
331 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.482517 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.46 
 
 
317 aa  235  6e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.94 
 
 
376 aa  235  7e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000078339  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4142  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.29 
 
 
313 aa  234  9e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.09 
 
 
312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.144888  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2695  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.74 
 
 
321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0303782 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4620  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.09 
 
 
312 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000717233 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.24 
 
 
335 aa  232  6e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2845  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.79 
 
 
308 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00578096  normal  0.490082 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3191  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.68 
 
 
324 aa  231  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26933  normal  0.010449 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13691  putative fucose synthetase  40.13 
 
 
332 aa  230  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0771  bifunctional GDP-fucose synthetase: GDP-4-dehydro-6-deoxy-D-mannose epimerase and GDP-4-dehydro-6-L-deoxygalactose reductase  40.58 
 
 
322 aa  229  4e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0933619 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1864  GDP-L-fucose synthetase  40.07 
 
 
319 aa  229  6e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1289  GDP-fucose synthetase  36.5 
 
 
357 aa  228  7e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1235  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.67 
 
 
320 aa  228  8e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.67 
 
 
319 aa  227  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00831994  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0173  NAD dependent epimerase/dehydratase  37.94 
 
 
320 aa  227  2e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0818369  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2384  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.57 
 
 
316 aa  226  4e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.73165  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5160  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.73 
 
 
312 aa  226  4e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195142  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0254  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.37 
 
 
329 aa  225  9e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2345  GDP-L-fucose synthetase  38.83 
 
 
321 aa  225  9e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1248  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.93 
 
 
362 aa  224  1e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1010  GDP-L-fucose synthetase  38.83 
 
 
321 aa  224  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2987  GDP-L-fucose synthetase  38.83 
 
 
321 aa  224  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201772 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01958  bifunctional GDP-fucose synthetase: GDP-4-dehydro-6-deoxy-D-mannose epimerase/ GDP-4-dehydro-6-L-deoxygalactose reductase  38.49 
 
 
321 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.881949  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1605  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.49 
 
 
321 aa  224  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.171954  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1180  GDP-L-fucose synthetase  38.83 
 
 
321 aa  223  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01947  hypothetical protein  38.49 
 
 
321 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0361  fucose synthetase family protein  36.58 
 
 
326 aa  223  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0252323  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1589  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.83 
 
 
321 aa  223  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0418  fucose synthetase family protein  36.58 
 
 
326 aa  223  3e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0709177  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2666  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.93 
 
 
321 aa  223  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.350076 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.85 
 
 
331 aa  223  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168438  normal  0.238091 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.62 
 
 
326 aa  223  4e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00285763  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3182  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.66 
 
 
321 aa  223  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.092333  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3040  GDP-L-fucose synthetase  39.66 
 
 
321 aa  223  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1253  GDP-L-fucose synthetase  39.32 
 
 
321 aa  222  8e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000974466  hitchhiker  0.000000000000993367 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02915  GDP-fucose synthetase  36.59 
 
 
362 aa  221  9.999999999999999e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0734964  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3371  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.18 
 
 
326 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2967  GDP-L-fucose synthetase  40.21 
 
 
321 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000296227 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>