96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0958 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0958  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0299948  normal  0.52832 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2589  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  40.54 
 
 		 210 aa  158  4e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0674  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  33.77 
 
 		 176 aa  89.4  3e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1280  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  29.11 
 
 		 575 aa  63.9  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.637418  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0335  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  29.94 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.29537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4570  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  26.11 
 
 		 571 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0127  hydrogenase-4 component G  30.63 
 
 		 582 aa  60.8  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.548953  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3155  formate hydrogenlyase, subunit E  31.4 
 
 		 569 aa  60.8  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02571  hydrogenase 3, large subunit  29.75 
 
 		 569 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.671666  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2846  formate hydrogenlyase, subunit E  29.75 
 
 		 576 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.15789 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0991  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  29.75 
 
 		 569 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0591467 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2186  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  26.45 
 
 		 574 aa  59.7  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3009  formate hydrogenlyase, subunit E  30.58 
 
 		 569 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3972  formate hydrogenlyase, subunit E  30.58 
 
 		 576 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02536  hypothetical protein  29.75 
 
 		 569 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.576982  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2857  formate hydrogenlyase, subunit E  29.75 
 
 		 569 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0968  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  29.75 
 
 		 569 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2713  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  29.01 
 
 		 575 aa  59.3  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3194  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  29.84 
 
 		 569 aa  58.5  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1788  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  28.14 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.489696 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0183  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  25.95 
 
 		 567 aa  57.8  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1956  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  27.54 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00990  Ni,Fe-hydrogenase III large subunit  27.27 
 
 		 576 aa  56.6  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1299  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  28.21 
 
 		 164 aa  57  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.137962  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0427  NADH-quinone oxidoreductase, B subunit  25.47 
 
 		 374 aa  56.2  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0711  DNA-3-methyladenine glycosylase I  35.29 
 
 		 578 aa  56.2  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0105954  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1000  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  28.14 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.28179  normal  0.107428 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2228  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  29.55 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.310199  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3052  formate hydrogenlyase subunit E  29.75 
 
 		 569 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.309808 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3036  formate hydrogenlyase subunit E  29.75 
 
 		 569 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143989 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3001  formate hydrogenlyase subunit E  29.75 
 
 		 569 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.33609  normal  0.016492 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2970  formate hydrogenlyase, subunit E  29.75 
 
 		 569 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3159  formate hydrogenlyase, subunit E  29.75 
 
 		 569 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.146854 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1635  phage integrase family site specific recombinase  23.23 
 
 		 578 aa  55.5  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0144556  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2430  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  28.1 
 
 		 567 aa  54.7  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1131  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  31.43 
 
 		 175 aa  54.3  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0316  NADH-ubiquinone oxidoreductase  40 
 
 		 561 aa  53.9  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.371145  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1281  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  28.57 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3676  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  25.16 
 
 		 174 aa  52.8  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00982408 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3525  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  32.64 
 
 		 154 aa  52  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0594  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  33.33 
 
 		 159 aa  51.2  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1322  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  25.16 
 
 		 174 aa  51.2  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.671955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4173  NADH dehydrogenase subunit J  27.1 
 
 		 168 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1875  NADH (or F420H2) dehydrogenase subunit C  28.03 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.603948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1087  hypothetical protein  30.97 
 
 		 166 aa  50.1  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3410  NADH dehydrogenase subunit C  26.25 
 
 		 158 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.060616  normal  0.771962 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3499  NADH dehydrogenase subunit J  27.1 
 
 		 167 aa  49.3  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.678212 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3081  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  25 
 
 		 171 aa  49.3  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.876993  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1071  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  30.08 
 
 		 537 aa  49.7  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2621  hydrogenase-4, G subunit  25.81 
 
 		 555 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1182  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  25.81 
 
 		 555 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02379  hydrogenase 4, subunit  25.81 
 
 		 555 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1189  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  25.81 
 
 		 555 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.454918 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02341  hypothetical protein  25.81 
 
 		 555 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3709  hydrogenase-4, G subunit  25.81 
 
 		 571 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2859  hydrogenase-4, G subunit  25.81 
 
 		 571 aa  48.5  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0269  NADH dehydrogenase subunit C  43.1 
 
 		 192 aa  48.5  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.148576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2634  hydrogenase-4, G subunit  25.81 
 
 		 571 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2769  hydrogenase-4, G subunit  25.81 
 
 		 571 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0278  NADH dehydrogenase 30 kDa subunit  28.57 
 
 		 200 aa  48.1  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000316476 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1151  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  22.78 
 
 		 169 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1866  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  25 
 
 		 579 aa  47  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2154  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  26.2 
 
 		 230 aa  46.6  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.818422  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2473  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  30.17 
 
 		 180 aa  47  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2989  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  29.52 
 
 		 506 aa  46.2  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.016212  hitchhiker  0.00562837 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0317  NADH (or F420H2) dehydrogenase subunit C  33.85 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03180  NADH dehydrogenase subunit C  30.08 
 
 		 253 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.44147 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1182  NADH dehydrogenase subunit J  25.62 
 
 		 172 aa  45.4  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.54085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0795  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  25.47 
 
 		 525 aa  44.7  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1896  NADH dehydrogenase subunit C  25.2 
 
 		 160 aa  44.7  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.759596  normal  0.414005 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0780  NADH dehydrogenase subunit C  25.79 
 
 		 205 aa  44.7  0.0009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.575172  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0522  NADH dehydrogenase subunit C  40.68 
 
 		 250 aa  43.9  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0232  NADH dehydrogenase subunit J  25.37 
 
 		 193 aa  43.9  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0205  NADH dehydrogenase subunit J  28.7 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00876666  normal  0.281377 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1039  NADH dehydrogenase subunit J  23.14 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1068  NADH dehydrogenase subunit J  23.97 
 
 		 174 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5055  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  29.89 
 
 		 246 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2301  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  27.56 
 
 		 309 aa  43.9  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2991  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  27.83 
 
 		 168 aa  42.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03251  NADH dehydrogenase subunit J  24.6 
 
 		 176 aa  42.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1871  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  24.22 
 
 		 172 aa  43.1  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1080  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  29.09 
 
 		 161 aa  42.7  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.20785  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0665  NADH:ubiquinone oxidoreductase 27 kD subunit- like protein  31.43 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0745  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  39.29 
 
 		 274 aa  42.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179796 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1542  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  26.92 
 
 		 179 aa  42.4  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1295  NADH dehydrogenase subunit C  25.44 
 
 		 158 aa  42.4  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2714  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  33.9 
 
 		 309 aa  42.4  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03151  NADH dehydrogenase subunit J  27.56 
 
 		 176 aa  42.4  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0737318  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2090  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  28.18 
 
 		 189 aa  42  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1658  NADH dehydrogenase subunit J  27.48 
 
 		 173 aa  42  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.677545  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25241  NADH dehydrogenase subunit J  25 
 
 		 185 aa  41.6  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2693  NADH dehydrogenase subunit C  31.71 
 
 		 252 aa  41.6  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03721  NADH dehydrogenase subunit J  27.48 
 
 		 173 aa  41.6  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.238222 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1494  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  32.31 
 
 		 599 aa  41.2  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0962881  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_796  NADH:quinone oxidoreductase 27 kD subunit  25.32 
 
 		 149 aa  41.2  0.01  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0511  NADH dehydrogenase I chain C, D  23.93 
 
 		 168 aa  41.2  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.367993 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>