34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1219 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1219  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  255  1e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0126962 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1218  hypothetical protein  78.91 
 
 
128 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1218  hypothetical protein  47.68 
 
 
153 aa  103  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1777  hypothetical protein  45.14 
 
 
149 aa  100  6e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.301806 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1778  hypothetical protein  45.14 
 
 
149 aa  100  9e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.38263 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2415  Protein of unknown function DUF1628  50 
 
 
124 aa  99  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.506159  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1357  hypothetical protein  40 
 
 
148 aa  87.8  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.456114  normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2417  hypothetical protein  42.19 
 
 
134 aa  73.6  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.812754  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2868  Protein of unknown function DUF1628  51.52 
 
 
152 aa  61.6  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.24462 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1027  hypothetical protein  88.57 
 
 
158 aa  58.9  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1466  hypothetical protein  37.88 
 
 
182 aa  59.3  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.82518  normal  0.0169363 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0569  Protein of unknown function DUF1628  38.71 
 
 
131 aa  58.2  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.199871  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2866  Protein of unknown function DUF1628  47.89 
 
 
169 aa  57  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.711339  normal  0.341 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0456  hypothetical protein  32.03 
 
 
262 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1635  Protein of unknown function DUF1628  46.27 
 
 
136 aa  54.7  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0792  Protein of unknown function DUF1628  44.78 
 
 
136 aa  55.1  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0291  Protein of unknown function DUF1628  62.26 
 
 
176 aa  54.3  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0292  Protein of unknown function DUF1628  81.82 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1960  Protein of unknown function DUF1628  47.37 
 
 
161 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1959  Protein of unknown function DUF1628  80 
 
 
169 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5010  hypothetical protein  89.66 
 
 
172 aa  50.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0791  Protein of unknown function DUF1628  44.12 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0298  hypothetical protein  34.88 
 
 
236 aa  47  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.186262  normal  0.350827 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0297  hypothetical protein  46.55 
 
 
229 aa  47  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.497298  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0296  hypothetical protein  45.1 
 
 
229 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.635456  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1390  hypothetical protein  69.44 
 
 
177 aa  46.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1532  hypothetical protein  41.1 
 
 
229 aa  43.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000205669  normal  0.0294417 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2376  hypothetical protein  55.56 
 
 
271 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000807827  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1541  hypothetical protein  39.68 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000440251  hitchhiker  0.0000169675 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0541  hypothetical protein  41.82 
 
 
158 aa  42  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.32485  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0251  hypothetical protein  57.58 
 
 
201 aa  41.6  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00204328  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2680  hypothetical protein  42.37 
 
 
187 aa  41.2  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.593402  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5067  hypothetical protein  51.52 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.211532  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3311  Protein of unknown function DUF1628  41.3 
 
 
194 aa  40.4  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>