20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0541 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0541  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  308  2e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.32485  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0540  hypothetical protein  36.31 
 
 
171 aa  71.2  0.000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000936052  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2868  Protein of unknown function DUF1628  43.64 
 
 
152 aa  47.4  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.24462 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1218  hypothetical protein  38.2 
 
 
128 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1778  hypothetical protein  42.19 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.38263 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1218  hypothetical protein  38.53 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0292  Protein of unknown function DUF1628  41.1 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1777  hypothetical protein  42.19 
 
 
149 aa  44.3  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.301806 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2866  Protein of unknown function DUF1628  42.59 
 
 
169 aa  43.9  0.0009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.711339  normal  0.341 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1027  hypothetical protein  48.89 
 
 
158 aa  43.9  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1466  hypothetical protein  60 
 
 
182 aa  43.5  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.82518  normal  0.0169363 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1390  hypothetical protein  34.23 
 
 
177 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0291  Protein of unknown function DUF1628  33.33 
 
 
176 aa  43.9  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5010  hypothetical protein  37.38 
 
 
172 aa  43.9  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2415  Protein of unknown function DUF1628  41.67 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.506159  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0569  Protein of unknown function DUF1628  48.15 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.199871  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2376  hypothetical protein  45.28 
 
 
271 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000807827  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1219  hypothetical protein  41.82 
 
 
128 aa  42  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0126962 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1357  hypothetical protein  40 
 
 
148 aa  41.6  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.456114  normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0945  von Willebrand factor type A  55.88 
 
 
2166 aa  40.8  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.775742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>