36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2415 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2415  Protein of unknown function DUF1628  100 
 
 
124 aa  241  1.9999999999999999e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.506159  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2417  hypothetical protein  61.11 
 
 
134 aa  130  6.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.812754  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1778  hypothetical protein  47.55 
 
 
149 aa  105  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.38263 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1777  hypothetical protein  47.55 
 
 
149 aa  105  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.301806 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1218  hypothetical protein  52.34 
 
 
128 aa  105  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1219  hypothetical protein  50 
 
 
128 aa  99  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0126962 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1218  hypothetical protein  42.28 
 
 
153 aa  93.6  9e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1027  hypothetical protein  52.27 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2868  Protein of unknown function DUF1628  50.63 
 
 
152 aa  72  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.24462 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0456  hypothetical protein  34.04 
 
 
262 aa  67  0.00000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1357  hypothetical protein  36.69 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.456114  normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0569  Protein of unknown function DUF1628  40 
 
 
131 aa  62  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.199871  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1466  hypothetical protein  43.42 
 
 
182 aa  60.5  0.000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.82518  normal  0.0169363 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0291  Protein of unknown function DUF1628  48.15 
 
 
176 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5010  hypothetical protein  50 
 
 
172 aa  56.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1960  Protein of unknown function DUF1628  45.21 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1635  Protein of unknown function DUF1628  46.34 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0292  Protein of unknown function DUF1628  70 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2866  Protein of unknown function DUF1628  49.3 
 
 
169 aa  54.7  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.711339  normal  0.341 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1959  Protein of unknown function DUF1628  71.05 
 
 
169 aa  54.3  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0792  Protein of unknown function DUF1628  46.48 
 
 
136 aa  50.8  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0296  hypothetical protein  53.33 
 
 
229 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.635456  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0297  hypothetical protein  59.46 
 
 
229 aa  48.9  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.497298  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0298  hypothetical protein  51.16 
 
 
236 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.186262  normal  0.350827 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1390  hypothetical protein  72.22 
 
 
177 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2376  hypothetical protein  32.52 
 
 
271 aa  47.4  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000807827  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0791  Protein of unknown function DUF1628  78.79 
 
 
157 aa  47  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1429  Protein of unknown function DUF1628  35.96 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.747471  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0251  hypothetical protein  60.53 
 
 
201 aa  44.7  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00204328  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0267  hypothetical protein  47.5 
 
 
200 aa  44.7  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.93762  normal  0.110699 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3311  Protein of unknown function DUF1628  40 
 
 
194 aa  42.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1250  hypothetical protein  42.86 
 
 
386 aa  42.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.138271  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0541  hypothetical protein  41.67 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.32485  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0310  hypothetical protein  46.34 
 
 
210 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0685599  normal  0.28293 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1532  hypothetical protein  52.5 
 
 
229 aa  40.8  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000205669  normal  0.0294417 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5067  hypothetical protein  47.06 
 
 
128 aa  40  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.211532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>