36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1218 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1218  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  303  6e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1218  hypothetical protein  49.67 
 
 
128 aa  117  6e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1777  hypothetical protein  46.54 
 
 
149 aa  112  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.301806 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1778  hypothetical protein  46.54 
 
 
149 aa  110  7.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.38263 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1219  hypothetical protein  47.68 
 
 
128 aa  103  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0126962 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2415  Protein of unknown function DUF1628  42.28 
 
 
124 aa  93.6  9e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.506159  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1357  hypothetical protein  37.41 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.456114  normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2417  hypothetical protein  36.91 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.812754  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1960  Protein of unknown function DUF1628  43.43 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5010  hypothetical protein  52.17 
 
 
172 aa  64.3  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1027  hypothetical protein  57.81 
 
 
158 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2866  Protein of unknown function DUF1628  52.17 
 
 
169 aa  60.8  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.711339  normal  0.341 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0456  hypothetical protein  35 
 
 
262 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2868  Protein of unknown function DUF1628  55.38 
 
 
152 aa  60.5  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.24462 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0792  Protein of unknown function DUF1628  51.61 
 
 
136 aa  60.1  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0569  Protein of unknown function DUF1628  55.38 
 
 
131 aa  60.1  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.199871  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1959  Protein of unknown function DUF1628  52.24 
 
 
169 aa  59.7  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0291  Protein of unknown function DUF1628  78.95 
 
 
176 aa  59.3  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1466  hypothetical protein  31.29 
 
 
182 aa  58.5  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.82518  normal  0.0169363 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0292  Protein of unknown function DUF1628  76.32 
 
 
151 aa  58.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1635  Protein of unknown function DUF1628  51.61 
 
 
136 aa  56.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1250  hypothetical protein  30.19 
 
 
386 aa  53.1  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.138271  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0791  Protein of unknown function DUF1628  50 
 
 
157 aa  53.5  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1390  hypothetical protein  66.67 
 
 
177 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0297  hypothetical protein  36.56 
 
 
229 aa  47.8  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.497298  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1429  Protein of unknown function DUF1628  45.9 
 
 
154 aa  47.4  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.747471  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0541  hypothetical protein  38.53 
 
 
158 aa  45.4  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.32485  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0310  hypothetical protein  34.78 
 
 
210 aa  45.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0685599  normal  0.28293 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0267  hypothetical protein  32.94 
 
 
200 aa  43.9  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.93762  normal  0.110699 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3311  Protein of unknown function DUF1628  43.48 
 
 
194 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0296  hypothetical protein  51.43 
 
 
229 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.635456  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0251  hypothetical protein  59.38 
 
 
201 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00204328  normal  0.639009 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0298  hypothetical protein  50 
 
 
236 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.186262  normal  0.350827 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5067  hypothetical protein  47.22 
 
 
128 aa  42.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.211532  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2376  hypothetical protein  58.06 
 
 
271 aa  40.8  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000807827  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1532  hypothetical protein  48.57 
 
 
229 aa  40.4  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000000205669  normal  0.0294417 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>