21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1357 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1357  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  291  2e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.456114  normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1777  hypothetical protein  49.32 
 
 
149 aa  115  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.301806 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1778  hypothetical protein  47.95 
 
 
149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.38263 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1219  hypothetical protein  40 
 
 
128 aa  87.8  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0126962 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1218  hypothetical protein  37.86 
 
 
128 aa  86.3  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1218  hypothetical protein  37.41 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2415  Protein of unknown function DUF1628  36.69 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.506159  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2417  hypothetical protein  42.7 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.812754  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0456  hypothetical protein  31.54 
 
 
262 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0569  Protein of unknown function DUF1628  39.36 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.199871  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1466  hypothetical protein  31.69 
 
 
182 aa  50.1  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.82518  normal  0.0169363 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5010  hypothetical protein  39.78 
 
 
172 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1027  hypothetical protein  67.65 
 
 
158 aa  47  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2868  Protein of unknown function DUF1628  38.57 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.24462 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2866  Protein of unknown function DUF1628  60.61 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.711339  normal  0.341 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1959  Protein of unknown function DUF1628  56.76 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1960  Protein of unknown function DUF1628  56.76 
 
 
161 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0541  hypothetical protein  40 
 
 
158 aa  41.6  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.32485  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0792  Protein of unknown function DUF1628  30.15 
 
 
136 aa  40.8  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0292  Protein of unknown function DUF1628  60.61 
 
 
151 aa  40.8  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0291  Protein of unknown function DUF1628  60.61 
 
 
176 aa  40  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>