26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2417 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2417  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  263  7e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.812754  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2415  Protein of unknown function DUF1628  61.11 
 
 
124 aa  130  6.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.506159  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1777  hypothetical protein  57.83 
 
 
149 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.301806 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1778  hypothetical protein  57.83 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.38263 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1219  hypothetical protein  42.19 
 
 
128 aa  73.6  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0126962 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1218  hypothetical protein  42.19 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1218  hypothetical protein  36.91 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1357  hypothetical protein  42.7 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.456114  normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1027  hypothetical protein  54.88 
 
 
158 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2868  Protein of unknown function DUF1628  44.12 
 
 
152 aa  53.9  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.24462 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1466  hypothetical protein  38.33 
 
 
182 aa  52.4  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.82518  normal  0.0169363 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0291  Protein of unknown function DUF1628  47.14 
 
 
176 aa  52  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0292  Protein of unknown function DUF1628  47.44 
 
 
151 aa  51.2  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0456  hypothetical protein  31.36 
 
 
262 aa  50.8  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0569  Protein of unknown function DUF1628  41.38 
 
 
131 aa  48.9  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.199871  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5010  hypothetical protein  36.44 
 
 
172 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0792  Protein of unknown function DUF1628  51.61 
 
 
136 aa  45.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2866  Protein of unknown function DUF1628  40.85 
 
 
169 aa  45.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.711339  normal  0.341 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1959  Protein of unknown function DUF1628  44.59 
 
 
169 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1960  Protein of unknown function DUF1628  73.53 
 
 
161 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0297  hypothetical protein  45.59 
 
 
229 aa  44.3  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.497298  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0298  hypothetical protein  45.45 
 
 
236 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.186262  normal  0.350827 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1429  Protein of unknown function DUF1628  41.38 
 
 
154 aa  42.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.747471  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1635  Protein of unknown function DUF1628  49.21 
 
 
136 aa  41.6  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0791  Protein of unknown function DUF1628  81.48 
 
 
157 aa  40.8  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0296  hypothetical protein  45.45 
 
 
229 aa  40.8  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.635456  normal  0.340374 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>