16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0456 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0456  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  526  1e-148  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1778  hypothetical protein  39.19 
 
 
149 aa  86.3  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.38263 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1777  hypothetical protein  39.86 
 
 
149 aa  85.1  9e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.301806 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1652  TM2 domain-containing protein  35.43 
 
 
108 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.503869  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1190  hypothetical protein  28.89 
 
 
192 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.550664  normal  0.0144222 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2415  Protein of unknown function DUF1628  34.04 
 
 
124 aa  67  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.506159  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1218  hypothetical protein  36.29 
 
 
128 aa  61.2  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1218  hypothetical protein  35 
 
 
153 aa  60.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1357  hypothetical protein  31.54 
 
 
148 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.456114  normal  0.0308639 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3451  hypothetical protein  31.97 
 
 
106 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.950641  normal  0.149126 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2044  hypothetical protein  26.63 
 
 
151 aa  57.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.00000000000114034  normal  0.017313 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1219  hypothetical protein  32.03 
 
 
128 aa  56.6  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0126962 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2417  hypothetical protein  31.36 
 
 
134 aa  50.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.812754  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22460  hypothetical protein  35.63 
 
 
188 aa  49.7  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1070  TM2 domain-containing protein  27.78 
 
 
176 aa  48.5  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.607501 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0355  TM2 domain containing protein?  30.84 
 
 
110 aa  45.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00269193 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>