174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3674 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3961  glucan biosynthesis protein D  85.87 
 
 		 552 aa  867    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.218276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3969  glucan biosynthesis protein G  98.36 
 
 		 548 aa  1070    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3674  glucan biosynthesis protein G  100 
 
 		 556 aa  1103    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1824  glucan biosynthesis protein D  52.58 
 
 		 547 aa  472  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.123731  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5503  glucan biosynthesis protein D  50.76 
 
 		 562 aa  464  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.545727  normal  0.294343 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2986  glucan biosynthesis protein D  49.6 
 
 		 522 aa  445  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.510691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1804  glucan biosynthesis protein D  43.13 
 
 		 536 aa  392  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0710  glucan biosynthesis protein D  45.09 
 
 		 530 aa  384  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2148  glucan biosynthesis protein G  38.91 
 
 		 545 aa  345  1e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0089817  normal  0.333418 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0907  glucan biosynthesis protein D  38.18 
 
 		 545 aa  345  1e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201606  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3848  glucan biosynthesis protein G  39 
 
 		 559 aa  344  2e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1887  glucan biosynthesis protein G  38.71 
 
 		 545 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1829  glucan biosynthesis protein G  38.71 
 
 		 545 aa  343  4e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2107  glucan biosynthesis protein G  38.51 
 
 		 498 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2397  glucan biosynthesis protein G  38.91 
 
 		 542 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000106178  normal  0.024996 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1929  glucan biosynthesis protein G  38.91 
 
 		 542 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.178013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1896  glucan biosynthesis protein G  38.91 
 
 		 542 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.465098  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1922  glucan biosynthesis protein G  38.91 
 
 		 542 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000209795  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1691  glucan biosynthesis protein G  36.02 
 
 		 540 aa  336  7.999999999999999e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.0773488 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2081  glucan biosynthesis protein G  38.71 
 
 		 544 aa  335  2e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1534  glucan biosynthesis protein G  38.25 
 
 		 508 aa  331  2e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2251  glucan biosynthesis protein G  38.18 
 
 		 495 aa  323  6e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2336  glucan biosynthesis protein G  33.99 
 
 		 529 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3220  glucan biosynthesis protein D  37.8 
 
 		 503 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.321251  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2559  glucan biosynthesis protein G  33.74 
 
 		 529 aa  302  9e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000572513  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2597  glucan biosynthesis protein D  33.74 
 
 		 529 aa  302  1e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000617652  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2674  glucan biosynthesis protein D  33.73 
 
 		 527 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0237308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1785  glucan biosynthesis protein D  33.73 
 
 		 531 aa  301  3e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000307117  hitchhiker  0.00000000192926 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1130  glucan biosynthesis protein G  35.7 
 
 		 519 aa  300  4e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.700993 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2425  glucan biosynthesis protein G  33.59 
 
 		 527 aa  300  5e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0750815  hitchhiker  0.00489845 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2731  glucan biosynthesis protein G  31.84 
 
 		 528 aa  299  8e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2780  glucan biosynthesis protein G  35.89 
 
 		 503 aa  299  9e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309239  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2353  glucan biosynthesis protein G  32.72 
 
 		 527 aa  298  1e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0646222  hitchhiker  0.0000000102725 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1791  glucan biosynthesis protein D  36.04 
 
 		 525 aa  298  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.315041 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3200  glucan biosynthesis protein G  35.53 
 
 		 504 aa  296  8e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2514  glucan biosynthesis protein G  32.93 
 
 		 526 aa  294  4e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0712053  hitchhiker  0.00000000245442 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1302  glucan biosynthesis protein G  32.45 
 
 		 530 aa  290  4e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4296  glucan biosynthesis protein D  33.6 
 
 		 568 aa  289  7e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183317 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2990  glucan biosynthesis protein D  35.85 
 
 		 560 aa  286  5e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0233  glucan biosynthesis protein D  34.59 
 
 		 530 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0141  glucan biosynthesis protein D  35.36 
 
 		 534 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359657 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3021  glucan biosynthesis protein D  31.78 
 
 		 594 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1051  glucan biosynthesis protein D  31.78 
 
 		 597 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3046  glucan biosynthesis protein D  31.78 
 
 		 604 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000732267  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0926  glucan biosynthesis protein D  31.78 
 
 		 604 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000374583  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3126  glucan biosynthesis protein G  32.34 
 
 		 525 aa  283  7.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.213498  normal  0.0516686 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0889  glucan biosynthesis protein D  31.78 
 
 		 558 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000629377  normal  0.387819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3412  glucan biosynthesis protein D  31.17 
 
 		 562 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000028825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0877  glucan biosynthesis protein D  31.17 
 
 		 562 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000443395  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3487  glucan biosynthesis protein D  31.17 
 
 		 608 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000242416  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3610  glucan biosynthesis protein D  31.17 
 
 		 562 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000323201  normal  0.858477 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3337  glucan biosynthesis protein D  35.85 
 
 		 560 aa  280  4e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0046  glucan biosynthesis protein D  34.78 
 
 		 534 aa  280  5e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11724 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2046  glucan biosynthesis protein G  36.33 
 
 		 539 aa  280  7e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.324147  normal  0.558823 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2321  glucan biosynthesis protein G  36.33 
 
 		 539 aa  278  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.405289  normal  0.314726 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2007  glucan biosynthesis protein G  36.96 
 
 		 545 aa  278  3e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03624  glucan biosynthesis protein D  33.6 
 
 		 534 aa  271  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3095  glucan biosynthesis protein G  35.13 
 
 		 498 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3866  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3057  glucan biosynthesis protein D  35.96 
 
 		 507 aa  270  5e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445662  normal  0.366151 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2234  glucan biosynthesis protein D  34.85 
 
 		 537 aa  270  5.9999999999999995e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0143  glucan biosynthesis protein D  34.64 
 
 		 543 aa  268  1e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2144  glucan biosynthesis protein D  34.85 
 
 		 534 aa  268  2e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03704  glucan biosynthesis protein D  33.09 
 
 		 551 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124419  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1552  glucan biosynthesis protein G  32.2 
 
 		 511 aa  262  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1661  glucan biosynthesis protein G  32.2 
 
 		 528 aa  262  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1314  glucan biosynthesis protein G  34.07 
 
 		 532 aa  259  8e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.327506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1583  glucan biosynthesis protein G  34.07 
 
 		 532 aa  259  8e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00561497 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4077  glucan biosynthesis protein D  32.72 
 
 		 537 aa  256  7e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.608962 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3964  glucan biosynthesis protein D  32.72 
 
 		 537 aa  256  7e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2135  glucan biosynthesis protein G  32.91 
 
 		 528 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4673  glucan biosynthesis protein D  33.65 
 
 		 540 aa  254  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2793  glucan biosynthesis protein G  31.21 
 
 		 546 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3863  glucan biosynthesis protein D  34.19 
 
 		 519 aa  253  8.000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232574 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45510  glucan biosynthesis protein D  34.17 
 
 		 517 aa  253  8.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104074  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3273  glucan biosynthesis protein D  32.75 
 
 		 532 aa  250  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0778178  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1870  glucan biosynthesis protein G  31.01 
 
 		 522 aa  249  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.698965 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67090  glucan biosynthesis protein G  32.28 
 
 		 525 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.755776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5817  glucan biosynthesis protein D  32.28 
 
 		 525 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470464  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0593  glucan biosynthesis protein D  29.24 
 
 		 522 aa  248  2e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000124621  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4893  glucan biosynthesis protein D  34.31 
 
 		 518 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00109342 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1570  glucan biosynthesis protein G  31.34 
 
 		 522 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2523  glucan biosynthesis protein G  32.47 
 
 		 522 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.586165  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1564  glucan biosynthesis protein G  31.16 
 
 		 533 aa  244  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000805878  normal  0.762961 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3438  glucan biosynthesis protein D  34.96 
 
 		 545 aa  244  3e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1604  glucan biosynthesis protein G  31.55 
 
 		 522 aa  244  3.9999999999999997e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3563  glucan biosynthesis protein G  35.46 
 
 		 513 aa  244  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1650  glucan biosynthesis protein G  33.27 
 
 		 532 aa  243  5e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3043  glucan biosynthesis protein D  30.17 
 
 		 534 aa  243  7.999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0445  glucan biosynthesis protein G  33.94 
 
 		 542 aa  242  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1830  glucan biosynthesis protein D  33.7 
 
 		 519 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191017  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2282  glucan biosynthesis protein G  30.59 
 
 		 511 aa  240  4e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2081  glucan biosynthesis protein G  30.59 
 
 		 517 aa  240  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.242328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1428  glucan biosynthesis protein G  30.59 
 
 		 517 aa  240  4e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0037891  normal  0.223049 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1170  glucan biosynthesis protein G  30.59 
 
 		 511 aa  240  4e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0753618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1169  glucan biosynthesis protein G  30.59 
 
 		 511 aa  240  4e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.163218  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2551  glucan biosynthesis protein G  30.59 
 
 		 511 aa  240  4e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  normal  0.55547 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45530  glucan biosynthesis protein G  31.19 
 
 		 505 aa  239  8e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.536607  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2828  glucan biosynthesis protein G  32.07 
 
 		 522 aa  239  9e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2597  periplasmic glucan biosynthesis protein MdoG  30.39 
 
 		 517 aa  239  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000403052  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01052  hypothetical protein  30.39 
 
 		 511 aa  239  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0739536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>