174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2986 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2986  glucan biosynthesis protein D  100 
 
 		 522 aa  1039    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.510691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3961  glucan biosynthesis protein D  50.81 
 
 		 552 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.218276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5503  glucan biosynthesis protein D  49.52 
 
 		 562 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.545727  normal  0.294343 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3674  glucan biosynthesis protein G  49.4 
 
 		 556 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3969  glucan biosynthesis protein G  49.4 
 
 		 548 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1824  glucan biosynthesis protein D  48.85 
 
 		 547 aa  437  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.123731  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1804  glucan biosynthesis protein D  44.61 
 
 		 536 aa  402  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0710  glucan biosynthesis protein D  45.09 
 
 		 530 aa  372  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2251  glucan biosynthesis protein G  38.46 
 
 		 495 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1130  glucan biosynthesis protein G  38.76 
 
 		 519 aa  315  9.999999999999999e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.700993 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1691  glucan biosynthesis protein G  34.32 
 
 		 540 aa  311  2e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.0773488 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1534  glucan biosynthesis protein G  38.27 
 
 		 508 aa  310  5.9999999999999995e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0907  glucan biosynthesis protein D  35.08 
 
 		 545 aa  306  4.0000000000000004e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201606  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3126  glucan biosynthesis protein G  34.24 
 
 		 525 aa  306  4.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.213498  normal  0.0516686 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3200  glucan biosynthesis protein G  36.44 
 
 		 504 aa  306  9.000000000000001e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.421618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3220  glucan biosynthesis protein D  37.95 
 
 		 503 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.321251  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2780  glucan biosynthesis protein G  35.15 
 
 		 503 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309239  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1896  glucan biosynthesis protein G  35 
 
 		 542 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.465098  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1922  glucan biosynthesis protein G  35 
 
 		 542 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000209795  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2397  glucan biosynthesis protein G  34.99 
 
 		 542 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000106178  normal  0.024996 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1929  glucan biosynthesis protein G  34.99 
 
 		 542 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.178013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1887  glucan biosynthesis protein G  34.17 
 
 		 545 aa  301  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1829  glucan biosynthesis protein G  34.38 
 
 		 545 aa  300  3e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2148  glucan biosynthesis protein G  34.38 
 
 		 545 aa  300  3e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0089817  normal  0.333418 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2107  glucan biosynthesis protein G  34.17 
 
 		 498 aa  297  3e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3848  glucan biosynthesis protein G  34.66 
 
 		 559 aa  296  5e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2081  glucan biosynthesis protein G  34.24 
 
 		 544 aa  296  7e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2353  glucan biosynthesis protein G  33.08 
 
 		 527 aa  295  2e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0646222  hitchhiker  0.0000000102725 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2425  glucan biosynthesis protein G  33.08 
 
 		 527 aa  295  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0750815  hitchhiker  0.00489845 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2514  glucan biosynthesis protein G  32.56 
 
 		 526 aa  292  8e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0712053  hitchhiker  0.00000000245442 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2336  glucan biosynthesis protein G  33.4 
 
 		 529 aa  291  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1302  glucan biosynthesis protein G  33.47 
 
 		 530 aa  290  3e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2674  glucan biosynthesis protein D  33.75 
 
 		 527 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0237308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1785  glucan biosynthesis protein D  33.33 
 
 		 531 aa  286  7e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000307117  hitchhiker  0.00000000192926 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2597  glucan biosynthesis protein D  32.92 
 
 		 529 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000617652  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2559  glucan biosynthesis protein G  33.33 
 
 		 529 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000572513  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2731  glucan biosynthesis protein G  32.42 
 
 		 528 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0233  glucan biosynthesis protein D  35.7 
 
 		 530 aa  278  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0046  glucan biosynthesis protein D  35.85 
 
 		 534 aa  276  4e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11724 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4296  glucan biosynthesis protein D  34.08 
 
 		 568 aa  273  4.0000000000000004e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183317 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1314  glucan biosynthesis protein G  35.7 
 
 		 532 aa  272  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.327506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1583  glucan biosynthesis protein G  35.7 
 
 		 532 aa  272  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00561497 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3563  glucan biosynthesis protein G  36.14 
 
 		 513 aa  268  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3095  glucan biosynthesis protein G  34.25 
 
 		 498 aa  268  2e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3866  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2793  glucan biosynthesis protein G  33.27 
 
 		 546 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3412  glucan biosynthesis protein D  31.93 
 
 		 562 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000028825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0877  glucan biosynthesis protein D  31.93 
 
 		 562 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000443395  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3487  glucan biosynthesis protein D  31.93 
 
 		 608 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000242416  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3610  glucan biosynthesis protein D  31.93 
 
 		 562 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000323201  normal  0.858477 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03624  glucan biosynthesis protein D  35.15 
 
 		 534 aa  261  3e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2234  glucan biosynthesis protein D  34.55 
 
 		 537 aa  259  6e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0926  glucan biosynthesis protein D  31.48 
 
 		 604 aa  259  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000374583  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0889  glucan biosynthesis protein D  31.48 
 
 		 558 aa  259  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000629377  normal  0.387819 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2144  glucan biosynthesis protein D  34.55 
 
 		 534 aa  258  1e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3046  glucan biosynthesis protein D  31.3 
 
 		 604 aa  258  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000732267  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67090  glucan biosynthesis protein G  33.47 
 
 		 525 aa  257  4e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.755776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5817  glucan biosynthesis protein D  33.47 
 
 		 525 aa  257  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470464  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3021  glucan biosynthesis protein D  32.07 
 
 		 594 aa  256  6e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0301  glucan biosynthesis protein G  35.79 
 
 		 501 aa  255  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0141  glucan biosynthesis protein D  34.69 
 
 		 534 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359657 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1051  glucan biosynthesis protein D  30.57 
 
 		 597 aa  253  7e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4900  glucan biosynthesis protein G  32.85 
 
 		 579 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.766057 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5026  glucan biosynthesis protein G  32.84 
 
 		 559 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3273  glucan biosynthesis protein D  34.26 
 
 		 532 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0778178  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5076  glucan biosynthesis protein G  32.43 
 
 		 559 aa  250  6e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0143  glucan biosynthesis protein D  34.1 
 
 		 543 aa  249  8e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45530  glucan biosynthesis protein G  31.98 
 
 		 505 aa  249  9e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.536607  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2135  glucan biosynthesis protein G  32.78 
 
 		 528 aa  247  3e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3043  glucan biosynthesis protein D  31.15 
 
 		 534 aa  248  3e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1712  glucan biosynthesis protein G  31.84 
 
 		 540 aa  248  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0439  glucan biosynthesis protein G  32.64 
 
 		 579 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.529505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2007  glucan biosynthesis protein G  32.93 
 
 		 545 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45510  glucan biosynthesis protein D  34.08 
 
 		 517 aa  244  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104074  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1552  glucan biosynthesis protein G  31.03 
 
 		 511 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1661  glucan biosynthesis protein G  30.91 
 
 		 528 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03704  glucan biosynthesis protein D  32.9 
 
 		 551 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124419  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3996  glucan biosynthesis protein G  31.74 
 
 		 536 aa  243  7.999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00021174  normal  0.469553 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0125  glucan biosynthesis protein G  30.69 
 
 		 540 aa  242  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1762  glucan biosynthesis protein G  30.69 
 
 		 540 aa  242  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1870  glucan biosynthesis protein G  31.57 
 
 		 522 aa  242  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.698965 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1110  glucan biosynthesis protein D  33.4 
 
 		 526 aa  241  2e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1791  glucan biosynthesis protein D  32.38 
 
 		 525 aa  241  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.315041 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4077  glucan biosynthesis protein D  32.35 
 
 		 537 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.608962 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3964  glucan biosynthesis protein D  32.35 
 
 		 537 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0373  glucan biosynthesis protein G  32.22 
 
 		 604 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.999536  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3057  glucan biosynthesis protein D  34.44 
 
 		 507 aa  238  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445662  normal  0.366151 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3863  glucan biosynthesis protein D  31.01 
 
 		 519 aa  238  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232574 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1261  glucan biosynthesis protein G  31.22 
 
 		 517 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1246  glucan biosynthesis protein G  31.22 
 
 		 517 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2039  glucan biosynthesis protein G  31.22 
 
 		 517 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000331819  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1217  glucan biosynthesis protein G  31.22 
 
 		 517 aa  237  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.211172 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3438  glucan biosynthesis protein D  32.6 
 
 		 545 aa  236  6e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2223  glucan biosynthesis protein G  31.22 
 
 		 517 aa  236  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.966209 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5162  periplasmic glucan biosynthesis protein  31.52 
 
 		 641 aa  236  9e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2081  glucan biosynthesis protein G  30.14 
 
 		 517 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.242328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1428  glucan biosynthesis protein G  30.14 
 
 		 517 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0037891  normal  0.223049 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2282  glucan biosynthesis protein G  30.14 
 
 		 511 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1170  glucan biosynthesis protein G  30.14 
 
 		 511 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0753618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1169  glucan biosynthesis protein G  30.14 
 
 		 511 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.163218  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2551  glucan biosynthesis protein G  30.14 
 
 		 511 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  normal  0.55547 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>