109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2627 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2627  hypothetical protein  100 
 
 		 72 aa  147  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.463351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2851  protein of unknown function DUF329  94.44 
 
 		 72 aa  141  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2751  protein of unknown function DUF329  78.79 
 
 		 67 aa  106  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0756  protein of unknown function DUF329  56.67 
 
 		 73 aa  70.5  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147041 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2136  protein of unknown function DUF329  61.36 
 
 		 82 aa  65.9  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3582  hypothetical protein  54.72 
 
 		 60 aa  65.5  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.891273 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0901  hypothetical protein  55.77 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0276  zinc-binding protein  50 
 
 		 65 aa  62  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0723518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2724  hypothetical protein  65.91 
 
 		 76 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0293  zinc-binding protein  56.25 
 
 		 60 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0185  zinc-binding protein  53.45 
 
 		 70 aa  62  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0321  zinc-binding protein  56.36 
 
 		 71 aa  61.6  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3554  hypothetical protein  51.16 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.179215 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4313  hypothetical protein  64.29 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.647385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2951  hypothetical protein  67.57 
 
 		 61 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1674  hypothetical protein  53.85 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.231141 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5017  zinc-binding protein  63.16 
 
 		 60 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453654  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0247  zinc-binding protein  61.9 
 
 		 57 aa  58.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.612167  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0265  zinc-binding protein  61.9 
 
 		 71 aa  58.9  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000322134  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3343  protein of unknown function DUF329  59.52 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1133  hypothetical protein  50.94 
 
 		 55 aa  57.8  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.121348 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0623  hypothetical protein  59.52 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0335184  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2275  hypothetical protein  59.52 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4345  zinc-binding protein  63.16 
 
 		 64 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.15942 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4413  zinc-binding protein  60.98 
 
 		 61 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.809075  normal  0.591143 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1793  hypothetical protein  67.57 
 
 		 49 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0244  zinc-binding protein  44.44 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1982  hypothetical protein  64.29 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0380441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2086  protein of unknown function DUF329  50.82 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2001  protein of unknown function DUF329  50.82 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.155969  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0272  zinc-binding protein  45.21 
 
 		 70 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0636  hypothetical protein  48.33 
 
 		 69 aa  53.5  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2867  hypothetical protein  47.73 
 
 		 60 aa  53.5  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.148567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0213  hypothetical protein  50 
 
 		 60 aa  53.5  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  2.00433e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2766  hypothetical protein  54.35 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1859  hypothetical protein  52.83 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0213  zinc-binding protein  44.44 
 
 		 70 aa  51.2  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.682651 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0529  hypothetical protein  55 
 
 		 75 aa  51.2  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.502678  normal  0.0768596 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3075  protein of unknown function DUF329  43.1 
 
 		 67 aa  51.2  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1055  hypothetical protein  56.82 
 
 		 57 aa  51.2  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.800623  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0602  hypothetical protein  60 
 
 		 60 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0513  protein of unknown function DUF329  48 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0279105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2710  protein of unknown function DUF329  43.1 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3457  protein of unknown function DUF329  47.06 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.659104  hitchhiker  0.000593666 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2830  hypothetical protein  46.81 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0927405  normal  0.221876 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2660  hypothetical protein  43.08 
 
 		 64 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1131  hypothetical protein  40.98 
 
 		 74 aa  47  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2365  hypothetical protein  46.94 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.859692  normal  0.117564 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0415  hypothetical protein  46.81 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3610  hypothetical protein  46.81 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0414  hypothetical protein  46.81 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431669 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3428  hypothetical protein  46.81 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2317  hypothetical protein  45.31 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4540  zinc-binding protein  47.83 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0630  zinc-binding protein  47.83 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3532  hypothetical protein  38.1 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.995869  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1404  hypothetical protein  39.29 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.828972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0458  hypothetical protein  38.1 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1316  hypothetical protein  38.1 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3511  hypothetical protein  38.1 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3536  hypothetical protein  38.1 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3246  hypothetical protein  38.1 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0676  zinc-binding protein  47.83 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3658  hypothetical protein  41.67 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.178306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2228  hypothetical protein  45.83 
 
 		 62 aa  45.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00360569  normal  0.379355 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3924  hypothetical protein  44.64 
 
 		 69 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.73598  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3947  hypothetical protein  44.64 
 
 		 69 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4065  hypothetical protein  44.64 
 
 		 69 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.291294 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3872  protein of unknown function DUF329  44.64 
 
 		 69 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285731 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0091  hypothetical protein  37.7 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.73124  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0476  hypothetical protein  37.7 
 
 		 66 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58790  zinc-binding protein  42.86 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.262724  normal  0.292853 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0573  hypothetical protein  37.7 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.399541  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5166  zinc-binding protein  42.86 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299758  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0543  hypothetical protein  37.7 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196615  normal  0.115747 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0501  hypothetical protein  37.7 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.707045  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0411  hypothetical protein  44.68 
 
 		 69 aa  44.7  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1006  hypothetical protein  46.67 
 
 		 65 aa  44.3  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.595477  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2823  hypothetical protein  36.21 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.800981  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2090  hypothetical protein  53.66 
 
 		 73 aa  43.9  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0541121  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0275  hypothetical protein  51.22 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0270  hypothetical protein  51.22 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0763  protein of unknown function DUF329  42.86 
 
 		 76 aa  43.9  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0800  hypothetical protein  42.86 
 
 		 76 aa  43.9  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.596856  normal  0.565525 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0364  hypothetical protein  52.5 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4113  hypothetical protein  55.26 
 
 		 51 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0671  zinc-binding protein  45.65 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0546784 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0859  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  46.15 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3113  hypothetical protein  45.45 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0771  zinc-binding protein  43.48 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.879508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0408  hypothetical protein  52.5 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5493  hypothetical protein  39.22 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.493446  normal  0.188786 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1058  hypothetical protein  48.78 
 
 		 65 aa  42  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.21679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2965  hypothetical protein  40 
 
 		 63 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.17158  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4824  zinc-binding protein  40.74 
 
 		 66 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.459647  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3394  hypothetical protein  46.51 
 
 		 74 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0460  hypothetical protein  42.86 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.308666  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0420  hypothetical protein  45.45 
 
 		 70 aa  41.2  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290938 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4452  hypothetical protein  48.78 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.193954  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3443  hypothetical protein  47.5 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0338371 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>