148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1859 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1859  hypothetical protein  100 
 
 
67 aa  136  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2001  protein of unknown function DUF329  88.06 
 
 
67 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.155969  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2086  protein of unknown function DUF329  86.57 
 
 
67 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1982  hypothetical protein  67.21 
 
 
66 aa  90.1  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0380441  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0270  hypothetical protein  61.9 
 
 
70 aa  61.2  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2365  hypothetical protein  50 
 
 
69 aa  60.5  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.859692  normal  0.117564 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0275  hypothetical protein  46.77 
 
 
70 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4824  zinc-binding protein  56 
 
 
66 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.459647  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3457  protein of unknown function DUF329  55.56 
 
 
65 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.659104  hitchhiker  0.000593666 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58790  zinc-binding protein  47.37 
 
 
66 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.262724  normal  0.292853 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5166  zinc-binding protein  47.37 
 
 
66 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299758  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2710  protein of unknown function DUF329  48.21 
 
 
67 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2830  hypothetical protein  55.56 
 
 
71 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0927405  normal  0.221876 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3075  protein of unknown function DUF329  48.21 
 
 
67 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1006  hypothetical protein  50 
 
 
65 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.595477  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3658  protein of unknown function DUF329  43.08 
 
 
73 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.673603  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5493  hypothetical protein  53.33 
 
 
87 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.493446  normal  0.188786 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3532  hypothetical protein  44.44 
 
 
67 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.995869  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0513  protein of unknown function DUF329  56.1 
 
 
82 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0279105  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0458  hypothetical protein  44.44 
 
 
67 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1316  hypothetical protein  44.44 
 
 
67 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3511  hypothetical protein  44.44 
 
 
67 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3536  hypothetical protein  44.44 
 
 
67 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3246  hypothetical protein  44.44 
 
 
67 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1131  hypothetical protein  52.17 
 
 
74 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2660  hypothetical protein  52.17 
 
 
64 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2688  hypothetical protein  47.92 
 
 
62 aa  54.3  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00101  zinc-binding protein  50.94 
 
 
65 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.56833  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3500  protein of unknown function DUF329  50.94 
 
 
65 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3557  zinc-binding protein  50.94 
 
 
65 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0234492  hitchhiker  0.00132097 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0105  zinc-binding protein  50.94 
 
 
65 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360038  normal  0.317748 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0094  zinc-binding protein  50.94 
 
 
65 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000295925  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00100  hypothetical protein  50.94 
 
 
65 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.643456  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0106  zinc-binding protein  50.94 
 
 
65 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.61676e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0103  zinc-binding protein  50.94 
 
 
65 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000361316  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0108  zinc-binding protein  50.94 
 
 
65 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000466413  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2228  hypothetical protein  50.98 
 
 
62 aa  53.5  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00360569  normal  0.379355 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0630  zinc-binding protein  54.55 
 
 
66 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709442  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03236  zinc-binding protein  42.86 
 
 
75 aa  53.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00081145  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3113  hypothetical protein  44.44 
 
 
63 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0800  hypothetical protein  56.1 
 
 
76 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.596856  normal  0.565525 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4540  zinc-binding protein  52.17 
 
 
66 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3428  hypothetical protein  42.62 
 
 
69 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0771  zinc-binding protein  44.26 
 
 
64 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.879508  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2301  hypothetical protein  50.88 
 
 
74 aa  52.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00209673  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0671  zinc-binding protein  51.92 
 
 
66 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0546784 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0763  protein of unknown function DUF329  56.1 
 
 
76 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2751  protein of unknown function DUF329  56.52 
 
 
67 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2280  protein of unknown function DUF329  53.06 
 
 
62 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0781652  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3581  hypothetical protein  44.44 
 
 
64 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00002401  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1943  protein of unknown function DUF329  53.06 
 
 
62 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2851  protein of unknown function DUF329  51.85 
 
 
72 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0420  hypothetical protein  50 
 
 
70 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000290938 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2823  hypothetical protein  50 
 
 
65 aa  52  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.800981  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2627  hypothetical protein  52.83 
 
 
72 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.463351 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2090  hypothetical protein  47.83 
 
 
73 aa  52  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0541121  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2965  hypothetical protein  42.86 
 
 
63 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.17158  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3658  hypothetical protein  50 
 
 
66 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.178306  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0091  hypothetical protein  41.54 
 
 
66 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.73124  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0476  hypothetical protein  50 
 
 
66 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0573  hypothetical protein  41.54 
 
 
66 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.399541  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0543  hypothetical protein  41.54 
 
 
66 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196615  normal  0.115747 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0660  protein of unknown function DUF329  50 
 
 
65 aa  51.6  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0501  hypothetical protein  43.08 
 
 
66 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.707045  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3707  hypothetical protein  54.55 
 
 
65 aa  51.6  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.811659  normal  0.416266 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1644  hypothetical protein  53.49 
 
 
87 aa  51.2  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000155903  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0676  zinc-binding protein  52.27 
 
 
66 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2136  protein of unknown function DUF329  56.52 
 
 
82 aa  50.8  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0308  hypothetical protein  51.16 
 
 
62 aa  50.4  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0415  hypothetical protein  40.98 
 
 
69 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3610  hypothetical protein  40.98 
 
 
69 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0414  hypothetical protein  40.98 
 
 
69 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00431669 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3384  protein of unknown function DUF329  46.34 
 
 
75 aa  50.1  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3924  hypothetical protein  43.33 
 
 
69 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.73598  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0922  hypothetical protein  51.16 
 
 
69 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3872  protein of unknown function DUF329  41.67 
 
 
69 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285731 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0460  hypothetical protein  52.27 
 
 
64 aa  49.7  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.308666  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3769  protein of unknown function DUF329  48.89 
 
 
64 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119343  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3443  hypothetical protein  47.73 
 
 
74 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0338371 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0772  hypothetical protein  46.43 
 
 
67 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0910112  normal  0.50859 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4452  hypothetical protein  39.34 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.193954  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0411  hypothetical protein  39.34 
 
 
69 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0794  zinc-binding protein  51.16 
 
 
69 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0623  hypothetical protein  50 
 
 
60 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0335184  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0621  protein of unknown function DUF329  47.83 
 
 
73 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0136701  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2275  hypothetical protein  50 
 
 
60 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3788  hypothetical protein  44.44 
 
 
72 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3947  hypothetical protein  41.67 
 
 
69 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4065  hypothetical protein  41.67 
 
 
69 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.291294 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0276  zinc-binding protein  50 
 
 
65 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0723518  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0846  hypothetical protein  51.22 
 
 
68 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.278661  normal  0.355285 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0185  zinc-binding protein  46.77 
 
 
70 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0364  hypothetical protein  48.84 
 
 
71 aa  47.8  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1218  hypothetical protein  43.1 
 
 
61 aa  47.4  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246817  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1404  hypothetical protein  47.73 
 
 
65 aa  47.4  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.828972  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1058  hypothetical protein  52.27 
 
 
65 aa  47.4  0.00008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.21679  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3394  hypothetical protein  50 
 
 
74 aa  47  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1793  hypothetical protein  52.08 
 
 
49 aa  47  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0300  hypothetical protein  43.18 
 
 
70 aa  47  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1422  hypothetical protein  51.22 
 
 
68 aa  47  0.00009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.402148  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>