45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0529 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0529  hypothetical protein  100 
 
 		 75 aa  157  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.502678  normal  0.0768596 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0185  zinc-binding protein  46.97 
 
 		 70 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2724  hypothetical protein  60.78 
 
 		 76 aa  67.4  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0756  protein of unknown function DUF329  56.9 
 
 		 73 aa  67  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147041 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0213  zinc-binding protein  52.54 
 
 		 70 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.682651 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2867  hypothetical protein  48.33 
 
 		 60 aa  64.3  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.148567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4313  hypothetical protein  70 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.647385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0276  zinc-binding protein  48.48 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0723518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1674  hypothetical protein  45.16 
 
 		 72 aa  62.4  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.231141 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2951  hypothetical protein  68.29 
 
 		 61 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0321  zinc-binding protein  48.39 
 
 		 71 aa  62.8  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5017  zinc-binding protein  51.92 
 
 		 60 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453654  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0265  zinc-binding protein  51.72 
 
 		 71 aa  60.5  0.000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000322134  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0244  zinc-binding protein  50.98 
 
 		 70 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0213  hypothetical protein  53.85 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  2.00433e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4345  zinc-binding protein  53.19 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.15942 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1133  hypothetical protein  61.9 
 
 		 55 aa  57.4  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.121348 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3582  hypothetical protein  63.89 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.891273 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0293  zinc-binding protein  58.54 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0636  hypothetical protein  54 
 
 		 69 aa  57  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0272  zinc-binding protein  49.02 
 
 		 70 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0247  zinc-binding protein  50.91 
 
 		 57 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.612167  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0901  hypothetical protein  58.54 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3343  protein of unknown function DUF329  64.86 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0623  hypothetical protein  60.53 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0335184  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2275  hypothetical protein  60.53 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1793  hypothetical protein  53.49 
 
 		 49 aa  55.1  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2751  protein of unknown function DUF329  57.5 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2766  hypothetical protein  48.08 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3554  hypothetical protein  50 
 
 		 60 aa  53.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.179215 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2136  protein of unknown function DUF329  44.23 
 
 		 82 aa  52.8  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0602  hypothetical protein  60 
 
 		 60 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2627  hypothetical protein  55 
 
 		 72 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.463351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2851  protein of unknown function DUF329  55 
 
 		 72 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4413  zinc-binding protein  55.56 
 
 		 61 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.809075  normal  0.591143 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4113  hypothetical protein  48.84 
 
 		 51 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1055  hypothetical protein  51.35 
 
 		 57 aa  45.1  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.800623  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0513  protein of unknown function DUF329  48.78 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0279105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1404  hypothetical protein  33.33 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.828972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2301  hypothetical protein  34.92 
 
 		 74 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00209673  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2086  protein of unknown function DUF329  38.33 
 
 		 67 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2001  protein of unknown function DUF329  38.33 
 
 		 67 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.155969  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3384  protein of unknown function DUF329  45.24 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3685  hypothetical protein  33.8 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2280  protein of unknown function DUF329  36.73 
 
 		 62 aa  40  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0781652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>