70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3384 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3384  protein of unknown function DUF329  100 
 
 		 75 aa  160  4.0000000000000004e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1859  hypothetical protein  46.34 
 
 		 67 aa  50.1  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2001  protein of unknown function DUF329  48.72 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.155969  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2178  hypothetical protein  36.92 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.453357  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2228  hypothetical protein  43.18 
 
 		 62 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00360569  normal  0.379355 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2086  protein of unknown function DUF329  48.72 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1982  hypothetical protein  45.24 
 
 		 66 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0380441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2951  hypothetical protein  45.65 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2365  hypothetical protein  43.9 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.859692  normal  0.117564 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1006  hypothetical protein  38.24 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.595477  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2317  hypothetical protein  38.98 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2724  hypothetical protein  39.62 
 
 		 76 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4345  zinc-binding protein  53.85 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.15942 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0636  hypothetical protein  41.18 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0504  hypothetical protein  44.19 
 
 		 64 aa  43.9  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.11543 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0513  protein of unknown function DUF329  43.75 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0279105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0213  zinc-binding protein  44.44 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.682651 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2688  hypothetical protein  41.03 
 
 		 62 aa  43.9  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4313  hypothetical protein  42.55 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.647385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3443  hypothetical protein  44.68 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0338371 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5017  zinc-binding protein  45.65 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453654  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3394  hypothetical protein  48.72 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2907  hypothetical protein  40 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3428  hypothetical protein  39.66 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1674  hypothetical protein  41.67 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.231141 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2867  hypothetical protein  41.38 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.148567  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0411  hypothetical protein  36.92 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4452  hypothetical protein  30.91 
 
 		 78 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.193954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0293  zinc-binding protein  51.28 
 
 		 60 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2143  hypothetical protein  36.73 
 
 		 80 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2660  hypothetical protein  42.22 
 
 		 64 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0265  zinc-binding protein  41.67 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000322134  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0529  hypothetical protein  45.24 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.502678  normal  0.0768596 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1943  protein of unknown function DUF329  46.15 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0501  hypothetical protein  39.22 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.707045  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0364  hypothetical protein  37.29 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3788  hypothetical protein  43.75 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2830  hypothetical protein  37.25 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0927405  normal  0.221876 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0185  zinc-binding protein  38.46 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2280  protein of unknown function DUF329  46.15 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0781652  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2710  protein of unknown function DUF329  38.64 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0771  zinc-binding protein  38.18 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.879508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0901  hypothetical protein  51.28 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0247  zinc-binding protein  41.67 
 
 		 57 aa  41.2  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.612167  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0308  hypothetical protein  41.86 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0420  hypothetical protein  40 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290938 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0602  hypothetical protein  47.5 
 
 		 60 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5166  zinc-binding protein  38.6 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299758  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0275  hypothetical protein  50 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0276  zinc-binding protein  51.28 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0723518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58790  zinc-binding protein  38.6 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.262724  normal  0.292853 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3075  protein of unknown function DUF329  37.74 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1735  hypothetical protein  45 
 
 		 86 aa  40.4  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.211092  normal  0.471661 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0630  zinc-binding protein  37.5 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2275  hypothetical protein  44.68 
 
 		 60 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3581  hypothetical protein  36.36 
 
 		 64 aa  40.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00002401  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0623  hypothetical protein  44.68 
 
 		 60 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0335184  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0244  zinc-binding protein  42.55 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0415  hypothetical protein  36.21 
 
 		 69 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2090  hypothetical protein  41.03 
 
 		 73 aa  40.4  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0541121  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3769  protein of unknown function DUF329  38.64 
 
 		 64 aa  40.4  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119343  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3658  hypothetical protein  37.25 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.178306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0321  zinc-binding protein  39.62 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3610  hypothetical protein  36.21 
 
 		 69 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0414  hypothetical protein  36.21 
 
 		 69 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431669 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0671  zinc-binding protein  37.5 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0546784 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4065  hypothetical protein  40 
 
 		 69 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.291294 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3947  hypothetical protein  40 
 
 		 69 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3872  protein of unknown function DUF329  41.46 
 
 		 69 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285731 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4413  zinc-binding protein  51.28 
 
 		 61 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.809075  normal  0.591143 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>