130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3394 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3394  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0420  hypothetical protein  60.81 
 
 		 70 aa  96.3  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290938 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0411  hypothetical protein  63.51 
 
 		 69 aa  95.5  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3443  hypothetical protein  60.81 
 
 		 74 aa  94.7  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0338371 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0415  hypothetical protein  60.81 
 
 		 69 aa  94  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3610  hypothetical protein  60.81 
 
 		 69 aa  94  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0414  hypothetical protein  60.81 
 
 		 69 aa  94  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431669 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0408  hypothetical protein  62.5 
 
 		 79 aa  92.4  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0300  hypothetical protein  60.81 
 
 		 70 aa  92  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3924  hypothetical protein  60.81 
 
 		 69 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.73598  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3947  hypothetical protein  60.81 
 
 		 69 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4065  hypothetical protein  60.81 
 
 		 69 aa  90.9  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.291294 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3872  protein of unknown function DUF329  60.81 
 
 		 69 aa  90.9  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285731 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3428  hypothetical protein  62.16 
 
 		 69 aa  90.5  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0364  hypothetical protein  60.27 
 
 		 71 aa  89.7  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3788  hypothetical protein  63.38 
 
 		 72 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0794  zinc-binding protein  55.17 
 
 		 69 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2830  hypothetical protein  59.09 
 
 		 71 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0927405  normal  0.221876 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0922  hypothetical protein  53.45 
 
 		 69 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2365  hypothetical protein  62.22 
 
 		 69 aa  67.8  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.859692  normal  0.117564 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3113  hypothetical protein  57.81 
 
 		 63 aa  67  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0275  hypothetical protein  46.97 
 
 		 70 aa  67  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58790  zinc-binding protein  61.36 
 
 		 66 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.262724  normal  0.292853 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5166  zinc-binding protein  61.36 
 
 		 66 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299758  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2090  hypothetical protein  56.52 
 
 		 73 aa  66.2  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0541121  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0270  hypothetical protein  46.27 
 
 		 70 aa  66.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2965  hypothetical protein  57.14 
 
 		 63 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.17158  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2688  hypothetical protein  46.03 
 
 		 62 aa  65.5  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2710  protein of unknown function DUF329  56.82 
 
 		 67 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4452  hypothetical protein  42.11 
 
 		 78 aa  65.5  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.193954  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0771  zinc-binding protein  56.52 
 
 		 64 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.879508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2317  hypothetical protein  46.03 
 
 		 74 aa  65.1  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0676  zinc-binding protein  51.72 
 
 		 66 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3075  protein of unknown function DUF329  56.82 
 
 		 67 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4824  zinc-binding protein  52.63 
 
 		 66 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.459647  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0630  zinc-binding protein  50 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3658  hypothetical protein  53.06 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.178306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1006  hypothetical protein  62.79 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.595477  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0091  hypothetical protein  57.78 
 
 		 66 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.73124  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0476  hypothetical protein  55.1 
 
 		 66 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0573  hypothetical protein  57.78 
 
 		 66 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.399541  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0671  zinc-binding protein  50 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0546784 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0543  hypothetical protein  57.78 
 
 		 66 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196615  normal  0.115747 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2660  hypothetical protein  60 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0460  hypothetical protein  52.27 
 
 		 64 aa  62.8  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.308666  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3457  protein of unknown function DUF329  57.78 
 
 		 65 aa  62  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.659104  hitchhiker  0.000593666 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0772  hypothetical protein  53.06 
 
 		 67 aa  61.6  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0910112  normal  0.50859 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0501  hypothetical protein  55.56 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.707045  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3339  hypothetical protein  44 
 
 		 76 aa  61.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.208724  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3532  hypothetical protein  55.56 
 
 		 67 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.995869  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0458  hypothetical protein  55.56 
 
 		 67 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1316  hypothetical protein  55.56 
 
 		 67 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3511  hypothetical protein  55.56 
 
 		 67 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3536  hypothetical protein  55.56 
 
 		 67 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3246  hypothetical protein  55.56 
 
 		 67 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4540  zinc-binding protein  50 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1131  hypothetical protein  55.56 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2823  hypothetical protein  57.78 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.800981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03236  zinc-binding protein  43.24 
 
 		 75 aa  60.5  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00081145  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2178  hypothetical protein  45.45 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.453357  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00101  zinc-binding protein  51.11 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.56833  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3500  protein of unknown function DUF329  51.11 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0308  hypothetical protein  54.76 
 
 		 62 aa  59.3  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3769  protein of unknown function DUF329  51.16 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119343  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0621  protein of unknown function DUF329  52.17 
 
 		 73 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0136701  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00100  hypothetical protein  51.11 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.643456  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0660  protein of unknown function DUF329  52.38 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2635  zinc-binding protein  37.68 
 
 		 69 aa  58.9  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0106  zinc-binding protein  51.11 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.61676e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0103  zinc-binding protein  51.11 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000361316  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0108  zinc-binding protein  51.11 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000466413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3557  zinc-binding protein  51.11 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0234492  hitchhiker  0.00132097 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0105  zinc-binding protein  51.11 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360038  normal  0.317748 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0094  zinc-binding protein  51.11 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000295925  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002540  zinc-binding protein  36.23 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000015451  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3658  protein of unknown function DUF329  46.94 
 
 		 73 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.673603  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3581  hypothetical protein  51.16 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00002401  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0646  zinc-binding protein  47.37 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.744559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0859  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  52.27 
 
 		 70 aa  56.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1161  hypothetical protein  48.94 
 
 		 63 aa  56.6  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.234176  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2006  zinc-binding protein  34.78 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000391833  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0155  zinc-binding protein  54.76 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.401353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1058  hypothetical protein  56.52 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.21679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0151  zinc-binding protein  54.76 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00971492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0149  zinc-binding protein  54.76 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0151  zinc-binding protein  54.76 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.766166  hitchhiker  0.00953047 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0157  zinc-binding protein  54.76 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000171473  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2228  hypothetical protein  48.94 
 
 		 62 aa  54.7  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00360569  normal  0.379355 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1422  hypothetical protein  54 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.402148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1404  hypothetical protein  54.35 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.828972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03474  zinc-binding protein  37.68 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3707  hypothetical protein  45 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.811659  normal  0.416266 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3376  zinc-binding protein  50 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.144795  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1047  zinc-binding protein  50 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0583875  normal  0.0218321 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3505  zinc-binding protein  50 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000224667  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0763  protein of unknown function DUF329  47.92 
 
 		 76 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0800  hypothetical protein  47.92 
 
 		 76 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.596856  normal  0.565525 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1644  hypothetical protein  44.44 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000155903  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1943  protein of unknown function DUF329  40 
 
 		 62 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5493  hypothetical protein  44.9 
 
 		 87 aa  51.6  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.493446  normal  0.188786 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>