110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4313 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4313  hypothetical protein  100 
 
 		 65 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.647385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3343  protein of unknown function DUF329  79.17 
 
 		 65 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2724  hypothetical protein  62.3 
 
 		 76 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0756  protein of unknown function DUF329  60.32 
 
 		 73 aa  74.3  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147041 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1674  hypothetical protein  62.75 
 
 		 72 aa  69.7  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.231141 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0276  zinc-binding protein  72.34 
 
 		 65 aa  67.8  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0723518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0901  hypothetical protein  66 
 
 		 64 aa  67.4  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0185  zinc-binding protein  59.62 
 
 		 70 aa  66.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4345  zinc-binding protein  76.32 
 
 		 64 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.15942 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0293  zinc-binding protein  55 
 
 		 60 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3554  hypothetical protein  60.98 
 
 		 60 aa  65.1  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.179215 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2751  protein of unknown function DUF329  64 
 
 		 67 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0623  hypothetical protein  70.73 
 
 		 60 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0335184  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2275  hypothetical protein  70.73 
 
 		 60 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0529  hypothetical protein  70 
 
 		 75 aa  63.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.502678  normal  0.0768596 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1133  hypothetical protein  60.38 
 
 		 55 aa  62.8  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.121348 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1793  hypothetical protein  75 
 
 		 49 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2951  hypothetical protein  69.05 
 
 		 61 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5017  zinc-binding protein  69.23 
 
 		 60 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453654  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2136  protein of unknown function DUF329  65.85 
 
 		 82 aa  62.8  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3582  hypothetical protein  72.22 
 
 		 60 aa  62  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.891273 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4413  zinc-binding protein  62.75 
 
 		 61 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.809075  normal  0.591143 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0213  zinc-binding protein  54.17 
 
 		 70 aa  61.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.682651 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0244  zinc-binding protein  53.85 
 
 		 70 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2627  hypothetical protein  64.29 
 
 		 72 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.463351 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2867  hypothetical protein  60 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.148567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2851  protein of unknown function DUF329  61.9 
 
 		 72 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2766  hypothetical protein  57.78 
 
 		 78 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0272  zinc-binding protein  50 
 
 		 70 aa  57.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0636  hypothetical protein  54.17 
 
 		 69 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0602  hypothetical protein  68.57 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0265  zinc-binding protein  50 
 
 		 71 aa  54.3  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000322134  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0247  zinc-binding protein  50 
 
 		 57 aa  53.9  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.612167  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0321  zinc-binding protein  51.06 
 
 		 71 aa  53.5  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1055  hypothetical protein  60.53 
 
 		 57 aa  52  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.800623  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0763  protein of unknown function DUF329  49.06 
 
 		 76 aa  52  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0800  hypothetical protein  49.06 
 
 		 76 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.596856  normal  0.565525 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0213  hypothetical protein  48.94 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  2.00433e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1131  hypothetical protein  42.59 
 
 		 74 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2830  hypothetical protein  39.39 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0927405  normal  0.221876 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2228  hypothetical protein  46.55 
 
 		 62 aa  47  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00360569  normal  0.379355 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3075  protein of unknown function DUF329  37.5 
 
 		 67 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3658  hypothetical protein  43.4 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.178306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0091  hypothetical protein  43.4 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.73124  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0476  hypothetical protein  43.4 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0573  hypothetical protein  43.4 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.399541  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0543  hypothetical protein  43.4 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196615  normal  0.115747 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0364  hypothetical protein  45.45 
 
 		 71 aa  45.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0501  hypothetical protein  43.4 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.707045  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0846  hypothetical protein  42.37 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.278661  normal  0.355285 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1006  hypothetical protein  42.11 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.595477  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0621  protein of unknown function DUF329  42 
 
 		 73 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0136701  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2710  protein of unknown function DUF329  36.51 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2907  hypothetical protein  45.28 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0772  hypothetical protein  44.23 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0910112  normal  0.50859 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2660  hypothetical protein  40 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2001  protein of unknown function DUF329  53.49 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.155969  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2086  protein of unknown function DUF329  53.49 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3532  hypothetical protein  38.89 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.995869  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0771  hypothetical protein  45.65 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0717965 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0458  hypothetical protein  38.89 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1316  hypothetical protein  38.89 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3511  hypothetical protein  38.89 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3536  hypothetical protein  38.89 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3246  hypothetical protein  38.89 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3384  protein of unknown function DUF329  42.55 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0415  hypothetical protein  45.24 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3610  hypothetical protein  45.24 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0414  hypothetical protein  45.24 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431669 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4113  hypothetical protein  51.22 
 
 		 51 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00101  zinc-binding protein  38.33 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.56833  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3500  protein of unknown function DUF329  38.33 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2090  hypothetical protein  48.78 
 
 		 73 aa  42  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0541121  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0411  hypothetical protein  43.18 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0922  hypothetical protein  50 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0794  zinc-binding protein  50 
 
 		 69 aa  42  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3113  hypothetical protein  42.55 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3428  hypothetical protein  45.24 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2301  hypothetical protein  38.18 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00209673  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0106  zinc-binding protein  38.33 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.61676e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0103  zinc-binding protein  38.33 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000361316  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3557  zinc-binding protein  38.33 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0234492  hitchhiker  0.00132097 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0105  zinc-binding protein  38.33 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360038  normal  0.317748 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0094  zinc-binding protein  38.33 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000295925  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3457  protein of unknown function DUF329  39.62 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.659104  hitchhiker  0.000593666 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00100  hypothetical protein  38.33 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.643456  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0108  zinc-binding protein  38.33 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000466413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3707  hypothetical protein  45.65 
 
 		 65 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.811659  normal  0.416266 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2965  hypothetical protein  41.67 
 
 		 63 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.17158  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0308  hypothetical protein  42.22 
 
 		 62 aa  41.6  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1735  hypothetical protein  45.45 
 
 		 86 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.211092  normal  0.471661 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2688  hypothetical protein  39.62 
 
 		 62 aa  41.6  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0513  protein of unknown function DUF329  51.22 
 
 		 82 aa  41.6  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0279105  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0275  hypothetical protein  42.22 
 
 		 70 aa  41.2  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3924  hypothetical protein  40.43 
 
 		 69 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.73598  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3947  hypothetical protein  40.43 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4065  hypothetical protein  40.43 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.291294 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3872  protein of unknown function DUF329  40.43 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285731 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0151  zinc-binding protein  56.25 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.766166  hitchhiker  0.00953047 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0155  zinc-binding protein  56.25 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.401353  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>