58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4113 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4113  hypothetical protein  100 
 
 		 51 aa  104  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1055  hypothetical protein  60.87 
 
 		 57 aa  57  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.800623  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4345  zinc-binding protein  56.1 
 
 		 64 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.15942 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1793  hypothetical protein  56.1 
 
 		 49 aa  50.1  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5017  zinc-binding protein  55.81 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453654  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0185  zinc-binding protein  53.49 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2724  hypothetical protein  51.16 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0529  hypothetical protein  48.84 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.502678  normal  0.0768596 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2951  hypothetical protein  56.1 
 
 		 61 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0276  zinc-binding protein  49.06 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0723518  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2090  hypothetical protein  51.06 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0541121  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0275  hypothetical protein  46.94 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4413  zinc-binding protein  54.05 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.809075  normal  0.591143 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0270  hypothetical protein  46.94 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1674  hypothetical protein  51.35 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.231141 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0293  zinc-binding protein  51.16 
 
 		 60 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3658  protein of unknown function DUF329  47.83 
 
 		 73 aa  44.7  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.673603  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1133  hypothetical protein  50 
 
 		 55 aa  44.3  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.121348 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2851  protein of unknown function DUF329  53.66 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0901  hypothetical protein  45.24 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4313  hypothetical protein  51.22 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.647385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0321  zinc-binding protein  46.67 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0272  zinc-binding protein  47.62 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0636  hypothetical protein  47.62 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2627  hypothetical protein  55.26 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.463351 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0244  zinc-binding protein  47.62 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2136  protein of unknown function DUF329  50 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2280  protein of unknown function DUF329  46.94 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0781652  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3554  hypothetical protein  48.65 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.179215 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0756  protein of unknown function DUF329  51.35 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147041 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1943  protein of unknown function DUF329  47.92 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2823  hypothetical protein  43.1 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.800981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2751  protein of unknown function DUF329  55 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3658  hypothetical protein  44.9 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.178306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1859  hypothetical protein  51.11 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5493  hypothetical protein  44.19 
 
 		 87 aa  41.6  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.493446  normal  0.188786 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0504  hypothetical protein  43.18 
 
 		 64 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.11543 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0602  hypothetical protein  51.43 
 
 		 60 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3582  hypothetical protein  45.45 
 
 		 60 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.891273 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2086  protein of unknown function DUF329  52.17 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2001  protein of unknown function DUF329  52.17 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.155969  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0265  zinc-binding protein  44.44 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000322134  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0623  hypothetical protein  48.65 
 
 		 60 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0335184  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2275  hypothetical protein  48.65 
 
 		 60 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_004310  BR0247  zinc-binding protein  44.44 
 
 		 57 aa  40.8  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.612167  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0213  zinc-binding protein  47.22 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.682651 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0501  hypothetical protein  42.86 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.707045  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0458  hypothetical protein  43.75 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1316  hypothetical protein  43.75 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1006  hypothetical protein  41.07 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.595477  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1644  hypothetical protein  46.94 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000155903  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3511  hypothetical protein  43.75 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3536  hypothetical protein  43.75 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3532  hypothetical protein  43.75 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.995869  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2710  protein of unknown function DUF329  45.45 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3246  hypothetical protein  43.75 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0846  hypothetical protein  46.81 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.278661  normal  0.355285 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1131  hypothetical protein  43.75 
 
 		 74 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>