54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0272 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0272  zinc-binding protein  100 
 
 		 70 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0244  zinc-binding protein  94.29 
 
 		 70 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0213  zinc-binding protein  75 
 
 		 70 aa  104  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.682651 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0636  hypothetical protein  70.31 
 
 		 69 aa  98.2  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0321  zinc-binding protein  69.39 
 
 		 71 aa  80.9  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0185  zinc-binding protein  68.75 
 
 		 70 aa  79  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0265  zinc-binding protein  72.34 
 
 		 71 aa  78.2  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000322134  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0247  zinc-binding protein  70.45 
 
 		 57 aa  73.2  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.612167  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0213  hypothetical protein  54.9 
 
 		 60 aa  68.2  0.00000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  2.00433e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5017  zinc-binding protein  63.04 
 
 		 60 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453654  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0293  zinc-binding protein  52.63 
 
 		 60 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0276  zinc-binding protein  50 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0723518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4345  zinc-binding protein  59.57 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.15942 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0756  protein of unknown function DUF329  56.52 
 
 		 73 aa  59.7  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147041 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4313  hypothetical protein  50 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.647385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2724  hypothetical protein  58.97 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3554  hypothetical protein  56.1 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.179215 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0529  hypothetical protein  49.02 
 
 		 75 aa  57  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.502678  normal  0.0768596 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1674  hypothetical protein  46.3 
 
 		 72 aa  57  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.231141 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0901  hypothetical protein  41.94 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2751  protein of unknown function DUF329  50 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2851  protein of unknown function DUF329  44.29 
 
 		 72 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2627  hypothetical protein  45.21 
 
 		 72 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.463351 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1055  hypothetical protein  61.11 
 
 		 57 aa  52.8  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.800623  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4413  zinc-binding protein  58.33 
 
 		 61 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.809075  normal  0.591143 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2867  hypothetical protein  55 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.148567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1793  hypothetical protein  58.33 
 
 		 49 aa  51.2  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2275  hypothetical protein  51.22 
 
 		 60 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0623  hypothetical protein  51.22 
 
 		 60 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0335184  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3343  protein of unknown function DUF329  53.85 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1133  hypothetical protein  42 
 
 		 55 aa  48.9  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.121348 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2136  protein of unknown function DUF329  47.5 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2951  hypothetical protein  53.66 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2830  hypothetical protein  43.33 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0927405  normal  0.221876 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3075  protein of unknown function DUF329  38.98 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3582  hypothetical protein  45.1 
 
 		 60 aa  47.8  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.891273 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2766  hypothetical protein  51.35 
 
 		 78 aa  47.8  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2710  protein of unknown function DUF329  40 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3707  hypothetical protein  43.4 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.811659  normal  0.416266 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0364  hypothetical protein  42 
 
 		 71 aa  43.5  0.0009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4113  hypothetical protein  47.62 
 
 		 51 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2301  hypothetical protein  42.42 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00209673  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2228  hypothetical protein  44.44 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00360569  normal  0.379355 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2001  protein of unknown function DUF329  41.18 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.155969  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2086  protein of unknown function DUF329  41.18 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58790  zinc-binding protein  40.98 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.262724  normal  0.292853 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0602  hypothetical protein  48.57 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5166  zinc-binding protein  40.98 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299758  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1404  hypothetical protein  43.18 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.828972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1982  hypothetical protein  41.82 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0380441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2143  hypothetical protein  35.38 
 
 		 80 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1006  hypothetical protein  40 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.595477  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2090  hypothetical protein  50 
 
 		 73 aa  40.4  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0541121  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4824  zinc-binding protein  42.55 
 
 		 66 aa  40  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.459647  normal  0.368186 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>