71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0756 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0756  protein of unknown function DUF329  100 
 
 		 73 aa  147  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147041 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1674  hypothetical protein  57.14 
 
 		 72 aa  76.3  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.231141 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0293  zinc-binding protein  71.74 
 
 		 60 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4313  hypothetical protein  60.32 
 
 		 65 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.647385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2724  hypothetical protein  55.07 
 
 		 76 aa  72  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0901  hypothetical protein  65.96 
 
 		 64 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0276  zinc-binding protein  65.96 
 
 		 65 aa  70.5  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0723518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2627  hypothetical protein  56.67 
 
 		 72 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.463351 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0185  zinc-binding protein  55.56 
 
 		 70 aa  69.7  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2751  protein of unknown function DUF329  61.54 
 
 		 67 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3554  hypothetical protein  55.77 
 
 		 60 aa  67.8  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.179215 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4345  zinc-binding protein  72.5 
 
 		 64 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.15942 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2867  hypothetical protein  58.18 
 
 		 60 aa  67.4  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.148567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0529  hypothetical protein  56.9 
 
 		 75 aa  67  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.502678  normal  0.0768596 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2851  protein of unknown function DUF329  54.24 
 
 		 72 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4413  zinc-binding protein  63.27 
 
 		 61 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.809075  normal  0.591143 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5017  zinc-binding protein  69.23 
 
 		 60 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453654  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0623  hypothetical protein  59.62 
 
 		 60 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0335184  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2275  hypothetical protein  59.62 
 
 		 60 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3343  protein of unknown function DUF329  60.42 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0213  zinc-binding protein  55.56 
 
 		 70 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.682651 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3582  hypothetical protein  61.9 
 
 		 60 aa  62  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.891273 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2136  protein of unknown function DUF329  58.7 
 
 		 82 aa  62  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0244  zinc-binding protein  57.45 
 
 		 70 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1793  hypothetical protein  59.57 
 
 		 49 aa  61.2  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2766  hypothetical protein  53.45 
 
 		 78 aa  60.5  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0272  zinc-binding protein  56.52 
 
 		 70 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2951  hypothetical protein  70.27 
 
 		 61 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0321  zinc-binding protein  51.06 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0247  zinc-binding protein  49.12 
 
 		 57 aa  58.2  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.612167  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0265  zinc-binding protein  49.12 
 
 		 71 aa  58.2  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000322134  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1133  hypothetical protein  50 
 
 		 55 aa  58.2  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.121348 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0602  hypothetical protein  68.57 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0636  hypothetical protein  51.02 
 
 		 69 aa  54.7  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0213  hypothetical protein  47.83 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  2.00433e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1055  hypothetical protein  54.17 
 
 		 57 aa  52.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.800623  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0513  protein of unknown function DUF329  46.94 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0279105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2001  protein of unknown function DUF329  45.83 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.155969  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2086  protein of unknown function DUF329  42.86 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0763  protein of unknown function DUF329  42.11 
 
 		 76 aa  44.3  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0800  hypothetical protein  42.11 
 
 		 76 aa  44.3  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.596856  normal  0.565525 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2830  hypothetical protein  41.18 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0927405  normal  0.221876 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4113  hypothetical protein  51.35 
 
 		 51 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2907  hypothetical protein  42.31 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3075  protein of unknown function DUF329  43.48 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1859  hypothetical protein  52.38 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0275  hypothetical protein  42.55 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0270  hypothetical protein  40 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2090  hypothetical protein  48.78 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0541121  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0846  hypothetical protein  42 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.278661  normal  0.355285 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0103  zinc-binding protein  47.62 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000361316  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3500  protein of unknown function DUF329  47.62 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00100  hypothetical protein  47.62 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.643456  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0108  zinc-binding protein  47.62 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000466413  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00101  zinc-binding protein  47.62 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.56833  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0094  zinc-binding protein  47.62 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000295925  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0545  hypothetical protein  38.89 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0105  zinc-binding protein  47.62 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360038  normal  0.317748 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3557  zinc-binding protein  47.62 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0234492  hitchhiker  0.00132097 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1982  hypothetical protein  41.82 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0380441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0106  zinc-binding protein  47.62 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.61676e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0771  hypothetical protein  46.34 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0717965 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3505  zinc-binding protein  38.1 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000224667  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3376  zinc-binding protein  38.1 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.144795  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1047  zinc-binding protein  38.1 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0583875  normal  0.0218321 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0155  zinc-binding protein  56.25 
 
 		 63 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.401353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0151  zinc-binding protein  56.25 
 
 		 63 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.766166  hitchhiker  0.00953047 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0157  zinc-binding protein  56.25 
 
 		 63 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000171473  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0149  zinc-binding protein  56.25 
 
 		 63 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0151  zinc-binding protein  56.25 
 
 		 63 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00971492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1422  hypothetical protein  36.67 
 
 		 68 aa  40  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.402148  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>