117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0602 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0602  hypothetical protein  100 
 
 		 60 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0623  hypothetical protein  75 
 
 		 60 aa  93.6  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0335184  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2275  hypothetical protein  75 
 
 		 60 aa  93.6  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1793  hypothetical protein  72.97 
 
 		 49 aa  65.5  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2766  hypothetical protein  66.67 
 
 		 78 aa  65.1  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0756  protein of unknown function DUF329  68.18 
 
 		 73 aa  63.9  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147041 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4313  hypothetical protein  68.29 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.647385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2751  protein of unknown function DUF329  61.9 
 
 		 67 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2830  hypothetical protein  45.16 
 
 		 71 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0927405  normal  0.221876 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3554  hypothetical protein  50 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.179215 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2867  hypothetical protein  50 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.148567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1674  hypothetical protein  48.21 
 
 		 72 aa  58.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.231141 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1133  hypothetical protein  59.46 
 
 		 55 aa  57.8  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.121348 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2627  hypothetical protein  54.55 
 
 		 72 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.463351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3343  protein of unknown function DUF329  53.19 
 
 		 65 aa  57  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4345  zinc-binding protein  59.09 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.15942 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2136  protein of unknown function DUF329  51.28 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2851  protein of unknown function DUF329  52.27 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0529  hypothetical protein  58.97 
 
 		 75 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.502678  normal  0.0768596 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3582  hypothetical protein  46.67 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.891273 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0276  zinc-binding protein  57.78 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0723518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2724  hypothetical protein  52.38 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0293  zinc-binding protein  56.1 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0901  hypothetical protein  59.52 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3457  protein of unknown function DUF329  42.86 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.659104  hitchhiker  0.000593666 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5017  zinc-binding protein  56.82 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453654  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4413  zinc-binding protein  62.86 
 
 		 61 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.809075  normal  0.591143 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0185  zinc-binding protein  50 
 
 		 70 aa  51.6  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2710  protein of unknown function DUF329  43.33 
 
 		 67 aa  51.2  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0636  hypothetical protein  51.16 
 
 		 69 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0244  zinc-binding protein  50 
 
 		 70 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2951  hypothetical protein  60 
 
 		 61 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0213  zinc-binding protein  48.94 
 
 		 70 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.682651 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0501  hypothetical protein  44.83 
 
 		 66 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.707045  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3658  hypothetical protein  43.64 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.178306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1131  hypothetical protein  39.66 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0091  hypothetical protein  45.45 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.73124  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0476  hypothetical protein  43.1 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0573  hypothetical protein  45.45 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.399541  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0543  hypothetical protein  45.45 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196615  normal  0.115747 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2660  hypothetical protein  40 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3075  protein of unknown function DUF329  41.67 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3532  hypothetical protein  41.94 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.995869  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0458  hypothetical protein  41.94 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1316  hypothetical protein  41.94 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3511  hypothetical protein  41.94 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3536  hypothetical protein  41.94 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3246  hypothetical protein  41.94 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0272  zinc-binding protein  47.73 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2965  hypothetical protein  39.66 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.17158  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0660  protein of unknown function DUF329  47.83 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03236  zinc-binding protein  38.46 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00081145  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3707  hypothetical protein  41.27 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.811659  normal  0.416266 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2365  hypothetical protein  46.34 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.859692  normal  0.117564 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1006  hypothetical protein  37.29 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.595477  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4824  zinc-binding protein  45.83 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.459647  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1943  protein of unknown function DUF329  42.59 
 
 		 62 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2823  hypothetical protein  45.65 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.800981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2280  protein of unknown function DUF329  42.59 
 
 		 62 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0781652  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0247  zinc-binding protein  50 
 
 		 57 aa  45.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.612167  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1859  hypothetical protein  46.55 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0265  zinc-binding protein  50 
 
 		 71 aa  45.4  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000322134  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3658  protein of unknown function DUF329  43.18 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.673603  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0621  protein of unknown function DUF329  43.48 
 
 		 73 aa  44.7  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0136701  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3113  hypothetical protein  37.04 
 
 		 63 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3685  hypothetical protein  46.51 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3384  protein of unknown function DUF329  44.68 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2907  hypothetical protein  43.18 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2228  hypothetical protein  48.78 
 
 		 62 aa  44.3  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00360569  normal  0.379355 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0213  hypothetical protein  41.46 
 
 		 60 aa  43.9  0.0008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  2.00433e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0676  zinc-binding protein  41.67 
 
 		 66 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0275  hypothetical protein  38.64 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2301  hypothetical protein  45.1 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00209673  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0321  zinc-binding protein  40 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2001  protein of unknown function DUF329  46.55 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.155969  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00101  zinc-binding protein  39.13 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.56833  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3500  protein of unknown function DUF329  39.13 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0630  zinc-binding protein  41.67 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709442  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4452  hypothetical protein  40 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.193954  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0270  hypothetical protein  38.64 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00100  hypothetical protein  39.13 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.643456  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2688  hypothetical protein  39.62 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0771  hypothetical protein  37.25 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0717965 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0106  zinc-binding protein  39.13 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.61676e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0103  zinc-binding protein  39.13 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000361316  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2086  protein of unknown function DUF329  46.55 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3557  zinc-binding protein  39.13 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0234492  hitchhiker  0.00132097 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0105  zinc-binding protein  39.13 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360038  normal  0.317748 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0094  zinc-binding protein  39.13 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000295925  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0108  zinc-binding protein  39.13 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000466413  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2090  hypothetical protein  39.22 
 
 		 73 aa  41.6  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0541121  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0308  hypothetical protein  41.3 
 
 		 62 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0800  hypothetical protein  38 
 
 		 76 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.596856  normal  0.565525 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0504  hypothetical protein  45.45 
 
 		 64 aa  41.6  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.11543 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4113  hypothetical protein  48.65 
 
 		 51 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0671  zinc-binding protein  41.67 
 
 		 66 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0546784 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0772  hypothetical protein  39.13 
 
 		 67 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0910112  normal  0.50859 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5493  hypothetical protein  38.78 
 
 		 87 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.493446  normal  0.188786 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0763  protein of unknown function DUF329  38 
 
 		 76 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1055  hypothetical protein  48.57 
 
 		 57 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.800623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>