54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0636 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0636  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  144  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0272  zinc-binding protein  70.31 
 
 		 70 aa  98.2  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0244  zinc-binding protein  72.13 
 
 		 70 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0213  zinc-binding protein  67.21 
 
 		 70 aa  91.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.682651 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0185  zinc-binding protein  53.73 
 
 		 70 aa  76.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0265  zinc-binding protein  59.02 
 
 		 71 aa  73.6  0.0000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000322134  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0321  zinc-binding protein  65.96 
 
 		 71 aa  71.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0247  zinc-binding protein  58.18 
 
 		 57 aa  67.8  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.612167  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0213  hypothetical protein  53.23 
 
 		 60 aa  67  0.00000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  2.00433e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0276  zinc-binding protein  53.33 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0723518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5017  zinc-binding protein  56.52 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453654  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0293  zinc-binding protein  50.91 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4345  zinc-binding protein  57.45 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.15942 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0529  hypothetical protein  54 
 
 		 75 aa  57  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.502678  normal  0.0768596 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4313  hypothetical protein  54.17 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.647385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0901  hypothetical protein  52.94 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0756  protein of unknown function DUF329  51.02 
 
 		 73 aa  54.7  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147041 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1055  hypothetical protein  52.17 
 
 		 57 aa  53.9  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.800623  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2627  hypothetical protein  48.33 
 
 		 72 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.463351 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2751  protein of unknown function DUF329  52.83 
 
 		 67 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0623  hypothetical protein  49.02 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0335184  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2275  hypothetical protein  49.02 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2724  hypothetical protein  62.16 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2851  protein of unknown function DUF329  46.67 
 
 		 72 aa  52  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3554  hypothetical protein  46.51 
 
 		 60 aa  52  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.179215 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4413  zinc-binding protein  58.33 
 
 		 61 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.809075  normal  0.591143 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1793  hypothetical protein  48.98 
 
 		 49 aa  50.4  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2867  hypothetical protein  45.83 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.148567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2951  hypothetical protein  56.1 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2766  hypothetical protein  51.28 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1674  hypothetical protein  43.48 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.231141 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3075  protein of unknown function DUF329  40.35 
 
 		 67 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3343  protein of unknown function DUF329  50 
 
 		 65 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1133  hypothetical protein  48.94 
 
 		 55 aa  47.4  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.121348 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2830  hypothetical protein  42.59 
 
 		 71 aa  47  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0927405  normal  0.221876 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2228  hypothetical protein  40.68 
 
 		 62 aa  46.2  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00360569  normal  0.379355 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2136  protein of unknown function DUF329  34.78 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3582  hypothetical protein  48.89 
 
 		 60 aa  45.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.891273 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2710  protein of unknown function DUF329  39.29 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3384  protein of unknown function DUF329  41.18 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4113  hypothetical protein  47.62 
 
 		 51 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0602  hypothetical protein  48.65 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2001  protein of unknown function DUF329  47.5 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.155969  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0800  hypothetical protein  34.78 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.596856  normal  0.565525 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2086  protein of unknown function DUF329  47.5 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0763  protein of unknown function DUF329  34.78 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4824  zinc-binding protein  40.74 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.459647  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3707  hypothetical protein  41.18 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.811659  normal  0.416266 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1859  hypothetical protein  48.78 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1218  hypothetical protein  38.98 
 
 		 61 aa  40.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246817  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5166  zinc-binding protein  47.5 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299758  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3428  hypothetical protein  38.1 
 
 		 69 aa  40.4  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58790  zinc-binding protein  47.5 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.262724  normal  0.292853 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3457  protein of unknown function DUF329  41.51 
 
 		 65 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.659104  hitchhiker  0.000593666 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>