74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5017 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_5017  zinc-binding protein  100 
 
 		 60 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453654  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4345  zinc-binding protein  77.08 
 
 		 64 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.15942 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0185  zinc-binding protein  64.29 
 
 		 70 aa  80.5  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0276  zinc-binding protein  76.09 
 
 		 65 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0723518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4413  zinc-binding protein  76 
 
 		 61 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.809075  normal  0.591143 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0293  zinc-binding protein  73.91 
 
 		 60 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2724  hypothetical protein  62 
 
 		 76 aa  73.6  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0321  zinc-binding protein  57.14 
 
 		 71 aa  73.6  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0901  hypothetical protein  54.84 
 
 		 64 aa  71.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0213  zinc-binding protein  60.71 
 
 		 70 aa  69.3  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.682651 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0244  zinc-binding protein  67.39 
 
 		 70 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0265  zinc-binding protein  53.57 
 
 		 71 aa  68.2  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000322134  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0247  zinc-binding protein  53.57 
 
 		 57 aa  67.8  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.612167  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0756  protein of unknown function DUF329  69.23 
 
 		 73 aa  65.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147041 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0272  zinc-binding protein  63.04 
 
 		 70 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1674  hypothetical protein  52.08 
 
 		 72 aa  62.8  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.231141 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4313  hypothetical protein  69.23 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.647385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0213  hypothetical protein  50 
 
 		 60 aa  62.4  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  2.00433e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0529  hypothetical protein  51.92 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.502678  normal  0.0768596 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1133  hypothetical protein  60 
 
 		 55 aa  60.8  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.121348 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2751  protein of unknown function DUF329  55.1 
 
 		 67 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3343  protein of unknown function DUF329  69.23 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1793  hypothetical protein  61.36 
 
 		 49 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3554  hypothetical protein  53.33 
 
 		 60 aa  60.1  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.179215 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2851  protein of unknown function DUF329  58.14 
 
 		 72 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2627  hypothetical protein  63.16 
 
 		 72 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.463351 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2275  hypothetical protein  61.36 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0636  hypothetical protein  56.52 
 
 		 69 aa  58.9  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0623  hypothetical protein  61.36 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0335184  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2867  hypothetical protein  57.78 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.148567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1055  hypothetical protein  59.18 
 
 		 57 aa  58.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.800623  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3582  hypothetical protein  58.14 
 
 		 60 aa  57.8  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.891273 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2766  hypothetical protein  53.66 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2136  protein of unknown function DUF329  54.05 
 
 		 82 aa  53.5  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2951  hypothetical protein  59.46 
 
 		 61 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0513  protein of unknown function DUF329  53.06 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0279105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0602  hypothetical protein  60 
 
 		 60 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2086  protein of unknown function DUF329  46.94 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4113  hypothetical protein  55.81 
 
 		 51 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2001  protein of unknown function DUF329  46.94 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.155969  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2090  hypothetical protein  52.08 
 
 		 73 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0541121  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0270  hypothetical protein  48.94 
 
 		 70 aa  47  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0275  hypothetical protein  48.94 
 
 		 70 aa  47  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1859  hypothetical protein  45.65 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1982  hypothetical protein  51.22 
 
 		 66 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0380441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3075  protein of unknown function DUF329  44.9 
 
 		 67 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2830  hypothetical protein  45.65 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0927405  normal  0.221876 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2228  hypothetical protein  51.22 
 
 		 62 aa  44.3  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00360569  normal  0.379355 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2301  hypothetical protein  44.9 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00209673  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3384  protein of unknown function DUF329  45.65 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5166  zinc-binding protein  42.55 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299758  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58790  zinc-binding protein  42.55 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.262724  normal  0.292853 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1006  hypothetical protein  41.67 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.595477  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0408  hypothetical protein  47.62 
 
 		 79 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3428  hypothetical protein  42.86 
 
 		 69 aa  41.6  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2710  protein of unknown function DUF329  42.86 
 
 		 67 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0364  hypothetical protein  47.62 
 
 		 71 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0308  hypothetical protein  46.34 
 
 		 62 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0922  hypothetical protein  46.94 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0414  hypothetical protein  42.86 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431669 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3610  hypothetical protein  42.86 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0415  hypothetical protein  42.86 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2143  hypothetical protein  37.04 
 
 		 80 aa  41.2  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0794  zinc-binding protein  46.94 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1404  hypothetical protein  42.86 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.828972  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0411  hypothetical protein  42.86 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2317  hypothetical protein  41.67 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2365  hypothetical protein  39.29 
 
 		 69 aa  41.2  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.859692  normal  0.117564 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0771  hypothetical protein  39.58 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0717965 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3443  hypothetical protein  45.24 
 
 		 74 aa  40.8  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0338371 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0771  zinc-binding protein  40.43 
 
 		 64 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.879508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2907  hypothetical protein  37.5 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2280  protein of unknown function DUF329  41.67 
 
 		 62 aa  40.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0781652  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3113  hypothetical protein  42.86 
 
 		 63 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>