120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2143 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2143  hypothetical protein  100 
 
 
80 aa  167  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1943  protein of unknown function DUF329  60 
 
 
62 aa  53.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2317  hypothetical protein  45.31 
 
 
74 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2280  protein of unknown function DUF329  60 
 
 
62 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0781652  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0922  hypothetical protein  42.62 
 
 
69 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0794  zinc-binding protein  42.62 
 
 
69 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0859  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  43.55 
 
 
70 aa  52  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3443  hypothetical protein  60.98 
 
 
74 aa  52  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0338371 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2965  hypothetical protein  51.67 
 
 
63 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.17158  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2688  hypothetical protein  50.98 
 
 
62 aa  50.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2301  hypothetical protein  57.89 
 
 
74 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00209673  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1422  hypothetical protein  38.33 
 
 
68 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.402148  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0420  hypothetical protein  43.86 
 
 
70 aa  50.8  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000290938 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3707  hypothetical protein  50.82 
 
 
65 aa  50.4  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.811659  normal  0.416266 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3113  hypothetical protein  46.67 
 
 
63 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1133  hypothetical protein  48 
 
 
55 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.121348 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0300  hypothetical protein  41.82 
 
 
70 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4824  zinc-binding protein  40.98 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.459647  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3658  protein of unknown function DUF329  50.98 
 
 
73 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.673603  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4452  hypothetical protein  44.9 
 
 
78 aa  47.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.193954  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2228  hypothetical protein  46.3 
 
 
62 aa  47.4  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00360569  normal  0.379355 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0545  hypothetical protein  61.54 
 
 
68 aa  47.4  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1006  hypothetical protein  53.66 
 
 
65 aa  47.4  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.595477  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3394  hypothetical protein  50 
 
 
74 aa  47  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1735  hypothetical protein  43.55 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.211092  normal  0.471661 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0364  hypothetical protein  50 
 
 
71 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1218  hypothetical protein  48.84 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246817  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0270  hypothetical protein  53.66 
 
 
70 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3788  hypothetical protein  53.66 
 
 
72 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3581  hypothetical protein  43.9 
 
 
64 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00002401  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0621  protein of unknown function DUF329  41.82 
 
 
73 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0136701  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0408  hypothetical protein  46.55 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3457  protein of unknown function DUF329  47.46 
 
 
65 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.659104  hitchhiker  0.000593666 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1058  hypothetical protein  46.81 
 
 
65 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.21679  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0308  hypothetical protein  42.86 
 
 
62 aa  45.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00101  zinc-binding protein  37.14 
 
 
65 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.56833  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3500  protein of unknown function DUF329  37.14 
 
 
65 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2090  hypothetical protein  47.37 
 
 
73 aa  45.1  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0541121  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2086  protein of unknown function DUF329  44 
 
 
67 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1859  hypothetical protein  38.46 
 
 
67 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0108  zinc-binding protein  37.14 
 
 
65 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000466413  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3924  hypothetical protein  48.84 
 
 
69 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.73598  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00100  hypothetical protein  37.14 
 
 
65 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.643456  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0771  zinc-binding protein  45.45 
 
 
64 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.879508  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0106  zinc-binding protein  37.14 
 
 
65 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.61676e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0103  zinc-binding protein  37.14 
 
 
65 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000361316  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2635  zinc-binding protein  51.43 
 
 
69 aa  44.7  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3557  zinc-binding protein  37.14 
 
 
65 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0234492  hitchhiker  0.00132097 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0105  zinc-binding protein  37.14 
 
 
65 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360038  normal  0.317748 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0094  zinc-binding protein  37.14 
 
 
65 aa  44.7  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000295925  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2001  protein of unknown function DUF329  44 
 
 
67 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.155969  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2830  hypothetical protein  53.66 
 
 
71 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0927405  normal  0.221876 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2710  protein of unknown function DUF329  51.22 
 
 
67 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0293  zinc-binding protein  42.19 
 
 
60 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1404  hypothetical protein  44.68 
 
 
65 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.828972  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1161  hypothetical protein  48.78 
 
 
63 aa  44.3  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.234176  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0275  hypothetical protein  51.22 
 
 
70 aa  43.9  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3872  protein of unknown function DUF329  40 
 
 
69 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285731 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3947  hypothetical protein  48.84 
 
 
69 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4065  hypothetical protein  48.84 
 
 
69 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.291294 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5493  hypothetical protein  42.59 
 
 
87 aa  43.9  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.493446  normal  0.188786 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3428  hypothetical protein  39.34 
 
 
69 aa  43.9  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0676  zinc-binding protein  41.82 
 
 
66 aa  43.5  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3075  protein of unknown function DUF329  51.22 
 
 
67 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0460  hypothetical protein  46.34 
 
 
64 aa  43.5  0.0009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.308666  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2660  hypothetical protein  51.22 
 
 
64 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0630  zinc-binding protein  40.35 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709442  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2365  hypothetical protein  43.64 
 
 
69 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.859692  normal  0.117564 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0415  hypothetical protein  53.66 
 
 
69 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3610  hypothetical protein  53.66 
 
 
69 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0414  hypothetical protein  53.66 
 
 
69 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00431669 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3685  hypothetical protein  40.74 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3769  protein of unknown function DUF329  43.9 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119343  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0671  zinc-binding protein  40.35 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0546784 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3376  zinc-binding protein  36.84 
 
 
68 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.144795  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0772  hypothetical protein  52.63 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0910112  normal  0.50859 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1047  zinc-binding protein  36.84 
 
 
68 aa  43.5  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0583875  normal  0.0218321 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3505  zinc-binding protein  36.84 
 
 
68 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000224667  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4540  zinc-binding protein  40.35 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0247  zinc-binding protein  52.63 
 
 
57 aa  42.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.612167  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2178  hypothetical protein  37.93 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.453357  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0185  zinc-binding protein  46 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0504  hypothetical protein  41.51 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.11543 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2006  zinc-binding protein  42.55 
 
 
65 aa  42  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000391833  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0265  zinc-binding protein  52.63 
 
 
71 aa  42.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000322134  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0321  zinc-binding protein  46.81 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0411  hypothetical protein  77.27 
 
 
69 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4227  protein of unknown function DUF329  46.15 
 
 
70 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0310228  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2907  hypothetical protein  41.46 
 
 
72 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3384  protein of unknown function DUF329  36.73 
 
 
75 aa  42  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58790  zinc-binding protein  46.34 
 
 
66 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.262724  normal  0.292853 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0901  hypothetical protein  43.75 
 
 
64 aa  41.6  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5166  zinc-binding protein  46.34 
 
 
66 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299758  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2823  hypothetical protein  47.62 
 
 
65 aa  41.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.800981  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03236  zinc-binding protein  40.48 
 
 
75 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00081145  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0213  hypothetical protein  42.42 
 
 
60 aa  41.6  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  2.00433e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0157  zinc-binding protein  51.35 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000171473  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5017  zinc-binding protein  37.04 
 
 
60 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453654  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0151  zinc-binding protein  51.35 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00971492  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0151  zinc-binding protein  51.35 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.766166  hitchhiker  0.00953047 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>