98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0513 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0513  protein of unknown function DUF329  100 
 
 
82 aa  171  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0279105  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1859  hypothetical protein  50 
 
 
67 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2851  protein of unknown function DUF329  41.1 
 
 
72 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2627  hypothetical protein  44.78 
 
 
72 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.463351 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2001  protein of unknown function DUF329  55.56 
 
 
67 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.155969  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2086  protein of unknown function DUF329  55.56 
 
 
67 aa  57.8  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2724  hypothetical protein  46.88 
 
 
76 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1982  hypothetical protein  53.66 
 
 
66 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0380441  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2751  protein of unknown function DUF329  42.19 
 
 
67 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0321  zinc-binding protein  44.64 
 
 
71 aa  53.9  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5017  zinc-binding protein  53.06 
 
 
60 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453654  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0265  zinc-binding protein  51.11 
 
 
71 aa  50.8  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000322134  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0247  zinc-binding protein  46.94 
 
 
57 aa  50.4  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.612167  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1404  hypothetical protein  39.66 
 
 
65 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.828972  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0901  hypothetical protein  44.07 
 
 
64 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1793  hypothetical protein  56.52 
 
 
49 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0185  zinc-binding protein  36 
 
 
70 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4345  zinc-binding protein  51.06 
 
 
64 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.15942 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58790  zinc-binding protein  45.65 
 
 
66 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.262724  normal  0.292853 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5166  zinc-binding protein  45.65 
 
 
66 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299758  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1674  hypothetical protein  37.7 
 
 
72 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.231141 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2090  hypothetical protein  40.32 
 
 
73 aa  48.5  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0541121  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1133  hypothetical protein  47.06 
 
 
55 aa  48.5  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.121348 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2867  hypothetical protein  42.86 
 
 
60 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.148567  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0293  zinc-binding protein  47.83 
 
 
60 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0763  protein of unknown function DUF329  39.39 
 
 
76 aa  47.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0800  hypothetical protein  39.39 
 
 
76 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.596856  normal  0.565525 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3343  protein of unknown function DUF329  47.06 
 
 
65 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0276  zinc-binding protein  37.7 
 
 
65 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0723518  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0213  zinc-binding protein  40.74 
 
 
70 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.682651 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0270  hypothetical protein  37.25 
 
 
70 aa  47.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03236  zinc-binding protein  38 
 
 
75 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00081145  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0756  protein of unknown function DUF329  45.1 
 
 
73 aa  46.2  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147041 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2951  hypothetical protein  46 
 
 
61 aa  47  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2830  hypothetical protein  37.93 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0927405  normal  0.221876 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0859  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.66 
 
 
70 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1058  hypothetical protein  41.38 
 
 
65 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.21679  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2301  hypothetical protein  50 
 
 
74 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00209673  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0771  zinc-binding protein  38 
 
 
64 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.879508  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0460  hypothetical protein  40.43 
 
 
64 aa  44.7  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.308666  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3554  hypothetical protein  38.46 
 
 
60 aa  44.7  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.179215 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2228  hypothetical protein  42.86 
 
 
62 aa  44.7  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00360569  normal  0.379355 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0275  hypothetical protein  35.29 
 
 
70 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3384  protein of unknown function DUF329  43.75 
 
 
75 aa  44.7  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0545  hypothetical protein  42.86 
 
 
68 aa  44.3  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0529  hypothetical protein  38.6 
 
 
75 aa  43.9  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.502678  normal  0.0768596 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0244  zinc-binding protein  38.98 
 
 
70 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869931  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1316  hypothetical protein  36.92 
 
 
67 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3511  hypothetical protein  36.92 
 
 
67 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3536  hypothetical protein  36.92 
 
 
67 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3246  hypothetical protein  36.92 
 
 
67 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0458  hypothetical protein  36.92 
 
 
67 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3532  hypothetical protein  36.92 
 
 
67 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.995869  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3658  hypothetical protein  38.33 
 
 
66 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.178306  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5493  hypothetical protein  36.71 
 
 
87 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.493446  normal  0.188786 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4313  hypothetical protein  44.64 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.647385  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3457  protein of unknown function DUF329  37.93 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.659104  hitchhiker  0.000593666 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2317  hypothetical protein  39.13 
 
 
74 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2280  protein of unknown function DUF329  62.07 
 
 
62 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0781652  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1943  protein of unknown function DUF329  62.07 
 
 
62 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0308  hypothetical protein  38.6 
 
 
62 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2365  hypothetical protein  34.55 
 
 
69 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.859692  normal  0.117564 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3581  hypothetical protein  33.9 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00002401  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3582  hypothetical protein  48.78 
 
 
60 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.891273 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0411  hypothetical protein  37.04 
 
 
69 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0414  hypothetical protein  37.04 
 
 
69 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00431669 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0415  hypothetical protein  37.04 
 
 
69 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3610  hypothetical protein  37.04 
 
 
69 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3075  protein of unknown function DUF329  33.33 
 
 
67 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4824  zinc-binding protein  41.86 
 
 
66 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.459647  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0573  hypothetical protein  38.6 
 
 
66 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.399541  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3658  protein of unknown function DUF329  34.48 
 
 
73 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.673603  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1422  hypothetical protein  38.46 
 
 
68 aa  42  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.402148  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0476  hypothetical protein  38.6 
 
 
66 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0621  protein of unknown function DUF329  40.38 
 
 
73 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0136701  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3769  protein of unknown function DUF329  36.36 
 
 
64 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.119343  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4413  zinc-binding protein  50 
 
 
61 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.809075  normal  0.591143 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0501  hypothetical protein  38.6 
 
 
66 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.707045  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0091  hypothetical protein  38.6 
 
 
66 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.73124  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0543  hypothetical protein  38.6 
 
 
66 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196615  normal  0.115747 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3113  hypothetical protein  38.78 
 
 
63 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3924  hypothetical protein  42.5 
 
 
69 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.73598  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2143  hypothetical protein  41.43 
 
 
80 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2635  zinc-binding protein  37.21 
 
 
69 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3443  hypothetical protein  31.75 
 
 
74 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0338371 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3707  hypothetical protein  45.1 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.811659  normal  0.416266 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3872  protein of unknown function DUF329  42.5 
 
 
69 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285731 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4065  hypothetical protein  42.5 
 
 
69 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.291294 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1055  hypothetical protein  40.38 
 
 
57 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.800623  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3947  hypothetical protein  42.5 
 
 
69 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0623  hypothetical protein  51.22 
 
 
60 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0335184  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2766  hypothetical protein  40.74 
 
 
78 aa  40.8  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2275  hypothetical protein  51.22 
 
 
60 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0364  hypothetical protein  40 
 
 
71 aa  40.8  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0272  zinc-binding protein  42.22 
 
 
70 aa  40.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2178  hypothetical protein  41.3 
 
 
76 aa  40.8  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.453357  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1644  hypothetical protein  51.61 
 
 
87 aa  40.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000155903  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0636  hypothetical protein  42.22 
 
 
69 aa  40.4  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>